2012年，戴斯蒙德死亡后，Abstergo派人回收了戴斯蒙德的尸体，并加以研究，名为“17号样本计划”。
Abstergo还收集了戴斯蒙德的遗物，包括一些录音和照片。
下图是四人小队在大神殿入口前的合照，这应该是戴斯蒙德生前的最后一张照片了。
对戴斯蒙德的祖先们进行研究后，在蒙特利尔的Abstergo娱乐公司（育碧开发刺客信条的主力工作室就在蒙特利尔）经过市场分析，认为阿泰尔、艾吉奥、康纳的故事不适合做成游戏，最终决定选用爱德华·肯威的记忆来制作第二款电子游戏——《梦魇海盗》。（第一款是《解放》）
2013年，Abstergo娱乐公司聘请一名研究分析员来探索爱德华·肯威的记忆，表面上是为了做游戏，实际上是为圣殿骑士寻找伊甸圣器和遗址。而这位名字、相貌都未知的研究分析员，就是《刺客信条4》现代剧情的主角了，下文称“路人A”。
大多数Abstergo娱乐公司的雇员都不知道公司背后其实是由圣殿骑士操控，除了少数几个公司管理人员，比如创意总监奥利佛·加奈尔（Olivier Garneau），以及17号样本项目主管梅兰妮·勒梅（Melanie Lemay）。
路人A刚入职，就稀里糊涂地卷进刺客与圣殿骑士的斗争之中，在卧底约翰·斯坦迪什的指引下，为潜伏进公司的肖恩和瑞贝卡送情报。
不久后奥利佛去芝加哥参加会议，却离奇失踪，此后梅兰妮接替了他的位置。第二年（2014），奥利佛死于芝加哥黑客——艾登·皮尔斯（Aiden Pearce）的枪下。《看门狗》的一个支线就是艾登去拦截奥利佛。
（另外，《刺客信条4》中能找到ctOS、Blume的相关彩蛋，《看门狗》中也能找到Abstergo的相关彩蛋，非常有趣的联动。）
约翰·斯坦迪什（John Standish，1975 - 2013）表面上是Abstergo娱乐公司的的技术人员，暗中却是刺客安插在公司的卧底。然而，他的真实身份是一名圣者，他企图使朱诺重返人间，最后因阴谋败露被Abstergo保安射杀。
朱诺自《刺客信条3》被戴斯蒙德从大神殿释放出来后，栖身于全球数字网络空间中。约翰本打算诱骗路人A让朱诺附身，但是由于朱诺还比较虚弱，暂时无法寄宿在有机生物体上。约翰死后，朱诺复活的阴谋还在继续……
通过《刺客信条4》现代剧情中的文档，可了解到更多Animus项目的实验体，这里总结下关键的几个，多数在前面都介绍过。
0号实验体：艾琳·波特（沃伦·韦迪克早年的竞争对手，于实验中意外身亡后，沃伦·韦迪克接手了她的项目）
1号实验体：艾芙琳的后代
2号实验体：沃伦·韦迪克（是的，拿自己做实验，然后发现自己的祖先是杀害圣女贞德的刽子手）
4号实验体：丹尼尔·克洛斯
16号实验体：克莱·卡茨马雷克
17号实验体：戴斯蒙德·迈尔斯
电影版中的实验体：卡勒姆·林奇以及其他刺客后代
