本章节具体讲述主权殖民地联盟~殖民地联合地球政府时期（《死亡空间3》中的暗线剧情），在这里为了区别“主权殖民地联盟”和“殖民地联合地球政府”，故此就不单独把两者都纳入“地球政府”概念中，而是分开进行叙述了。
主权殖民地联盟武装力量LOGO
到22世纪中叶（2146年），由联合国（United Nations）发展而来的主权殖民地联盟（Sovereign Colonies）正式成为了《死亡空间》世界观中人类历史上第一个联合地球政府组织。
主权殖民地联盟是一个类联邦制的政体（在游戏的大背景之下，由于没有国家概念，就使用政体来代称国家），联盟是由8个完全享有平等权利的大洲部分按照自愿结合的原则构成联盟。这8个区块分别是——斯堪的纳维亚地区、北美地区、中美地区、南美地区、北亚地区、泛亚地区、泛欧洲区和非洲地区。看到这里大家是不是很熟悉了，对，主权殖民地联盟的“国体”非常类似苏维埃社会主义共和国联盟。
迈克尔·阿尔特曼
到殉道者时间线的2214年，正式进入了“《死亡空间》宇宙”主体作品的时间线。从这段时间线开始，所有关于《死亡空间》剧情的发展都能够通过本体游戏作品和大家能够接触到的衍生作品进行了解。
"For two hundred years, Unitology has sought the truth.
两世纪以来，吾教一务求其道。
When Michael Altman spread his word, few people believed him.
当阿尔特曼一字一句的吐其遇，鲜有人信之。
The government tried to discredit him! And when that didn't work, they killed him and said it was an accident!
政府为一切之法欲败坏我大先知之名，然则力尽。机关算尽的政府竟杀死了我们伟大的先知，且谎称其死于意外！
But we also know he was telling the truth! For two centuries, we and our forefathers kept the faith and our belief in his words.
但我们知道先知所述一切，句句皆实！我们和我的祖先两世纪以来坚信着伟大先知之所言。
Now finally we have proof - that we have been right all along.
如今铁证如山，我们对于先知的信仰都是对的。
You've all seen the vidlogs by now, you all know what they found out there.
现录像昭然若见，你们都明白了这个地方到底发生了什么。
Here on this very planet, we found - Another Marker!"
如今，在这个星球上（指神盾7号），我们发现了另一枚神印。
Deakin Abbott（迪金·圣·约翰·艾伯特）统一教传教士
到了23世纪初（2214年），主权殖民地联盟发现了位于墨西哥地区尤卡坦半岛“神印”撞击坑内的黑色神印，挖掘科研队除了迈克尔·阿尔特曼之外，全都因为黑色神印的影响而变得疯狂，地球上的第一次尸变体爆发开始。
迈克尔·阿尔特曼是一名物理学家，他在北美地区的新闻发布会上公开发布了关于神印的细节和相关镜头。在《殉道者》中，阿尔特曼是一名40岁左右、黑发于鬓角、蓝绿色眼睛的“智者”形象（其实“阿尔特曼”在古德语里面也有智者的意思）。不过到了《死亡空间2》里，阿尔特曼的雕像被弄成了一个秃顶造型，这简直是对神的侮辱。
死亡空间2统一教教堂中的阿尔特曼形象
…someone has to shut him up. His public out cry about the Marker is more than a nuisance. This is a matter of security.
…总有人会让他永远闭嘴的，这家伙天天在外面对着神印失智一样的叫唤不光让人觉得心烦，更重要的是这绝对是一个安全隐患。
—Eando Dukaj（伊恩多·杜克）
迈克尔·阿尔特曼和神印达成了所谓“协议”，并向公众完全公开了神印的一切。
2215年，阿尔特曼死在了两名联盟政府特工——马尔可夫和斯蒂文森的手上。不过这两人并不是为了建立统一教好谋取利益的——而是主权殖民地联盟政府安布罗斯·凯登将军直接下令杀死的。
海上油田开采殆尽
同年，主权殖民地联盟的星际拓展问题越来越严重。联盟政府经济因为能源和气候问题正在衰退，能源的枯竭造成民众需要的基础生活物资大幅度上升，并且政府高压管理导致底层民众对联盟的公信力大幅下降，“分裂分子（分离主义者）”的势头正在逐步发芽。
在这样的环境之后，政府通过将阿尔特曼的死稍作渲染，被政府有意地塑造为了一名殉道者，而统一教则成为了《死亡空间》世界观下人类历史上最大的单一性宗教，以此来转移民众对政府的矛盾。在这期间，统一教的高层基本上都是联盟政府的高官。
不过这一点真的想说一句——这真不是有意养蛊？ 其实按照殉道者里的描述，是为了先普及有关神印的信息让人们有个心理准备，随后能够通过这个方式推广神印。因为当时人类正处于严重的资源和能源危机中，急需神印这种无限能源来缓解危机。
政府塑造的统一教非常成功的转移了底层民众的注意力，让他们有了信仰，同时也为联盟政府这个政权的存续延上了不少时间。
火星殖民地
2289年，联盟政府位于火星的前线殖民地从局部暴乱到宣布“武装独立”，让旧政府彻底和分裂分子进入战争状态。
2294年，经历了5年战争的主权殖民地联盟政府非但没有重新获取对火星前线殖民地的控制，反而在各次战役中失败。同时，联盟政府在南门二比邻星恒星星系阿斯佩拉成功地通过黑色神印逆向仿制出了红色神印Marker 1A，这也是死亡空间小说作品《催化剂》的时间线。
虽然人类成功完成了星际探索，但是联盟政府对能源的无止境渴求几乎是到了一种疯狂的程度。
在2294年到2299年期间，“阿斯佩拉行动（Operation Aspera）”成为了主权殖民地联盟政府的首要科研目标。不过遗憾的是Marker 1A的逆向仿制工程基本上是失败的，所复制出来的神印并没有得到黑色神印的一些功能。在这段时间里，联盟政府将流放于阿斯佩拉的政治犯直接用于神印的生物实验造成了阿斯佩拉上的尸变体爆发。
死亡空间3中三座联盟政府制造的红色神印
23世纪末，“分离主义者”的舆论势力开始力压联盟政府，留给联盟的时间不多了。星际之间的月球资源争夺战开始，联盟政府位于月球宁静海的海军基地被分裂分子占领。
了解这段背景故事之后，就是本体游戏《死亡空间3》和漫画作品《解放》中的暗线剧情了。
经解包《死亡空间3》整个游戏后发现这段两百年前的游戏故事居然是有详细的建模和剧情布置的，换句话说就是《死亡空间3》中有主权殖民地联盟200年前的游戏剧情线。EA能把这段剧情给砍掉完全作为暗线剧情的确有点理解不能了。
在战败危机的压力下，主权殖民地联盟成功完成对剩下两座黑色神印的逆向复制工程，这一批神印被视作联盟政府挽回局面的唯一希望。
神盾7殖民地
进入24世纪（2300年左右），联盟政府将Marker 2A和Marker 3A秘密运送到格利泽581G行星和神盾7号行星上进行研究，红色神印被激活。研究人员发现激活后的红色神印可以通过一些人类不能理解的方式重组DNA序列从而进一步的重组细胞微生物。在红色神印的“催眠”和“诱导”之下，两个殖民地的尸变体感染最终爆发了。研究人员在死亡之前，通过扩大神印所释放出来的“死亡空间”力场而让整个殖民星球进入休眠期。而这件事情也让厄尔·赛拉诺博士成功接收到了于塔弗兰提斯星球上血月所发出的能量信号。
红色神印（Marker 3A）
在《死亡空间1》的第12章，我们可以通过游玩二周目查看到一则关于联盟政府使用逆向工程复制红色神印相关文本。
RECOVERED FILE FRAGMENTS
文本日志:恢复的文件片段
FROM DR. EANDO DUKAJ
来自：伊恩多·杜克博士
TO: GENERAL AMBROSE CAIDEN
致:安布罗斯.凯登将军
(Restricted access - Maximum encryption)
(访问受限，绝密级)
Altman's hasty expulsion from the project is unfortunate. His notes on the Black Marker appear incomplete and our findings this far have been inconclusive. What notes we have recovered appear to be written in a code of his devising. It will be weeks before we can decipher them. In the meantime, someone has to shut him up. His public outcry about the Marker is more than a nuisance. This is a matter of security.
阿尔特曼被驱逐出神印计划是一件不幸的事，他对黑色神印的记录似乎并不完整，目前为止我们针对其发现仍然没有什么头绪。
阿尔特曼对神印的记录很可能使用了他自己设计的代码进行编译的，对此，我们得要几周时间才能破译这段代码。
…总有人会让他永远闭嘴的，这家伙天天在外面对着神印失智一样的叫唤不光让人觉得心烦，更重要的是这绝对是一个安全隐患。
···
The continued financial infusion over the years has been appreciated and I'm pleased to share the results with you today.
我们（团队）对多年以来针对神印计划提供的经济支持表示由衷感谢，我很高兴今天可以和大家分享研究成果。
While some of our material fabrications are approximations of substances foreign to us, we have completed the internal workings of the device.
虽然制造神印的一些材料不是来源于我们认知宇宙中的已知元素，不过麻雀虽小、五脏俱全。
One obvious difference between our replica and the original is the reddish hue. I assure you this is purely a cosmetic difference not indicative of a flaw.
我们所复制出来的神印和原版神印的唯一区别就是“她”呈现出了鲜艳的红色。不过我保证，他们之间的差异只会是红和黑的区别。
The device, when activated, began to emit a highly complicated rhythmic pattern across a wide band of frequencies - from actual sound waves through the electromagnetic spectrum to alpha, delta, and theta brain waves. It seems mostly inert and harmless aside from some slight interference with communication equipment.
当激活神印后，“她”会在长波频道上发出非常有节奏的信号。——这类复杂信号一从人类能够感受到的声波到肉眼看不见的电磁波，甚至是ALPHA(Α)、DELTA（Δ）、THETA（Θ）的脑电波。这类信号除了对通信设备造成的轻微干扰外，在我们看来这类信号似乎大多惰性且无害的。
We are proceeding with the final construction.
“她”最后的建设即将完成。
···
We've run into a disturbing but fascinating find. In re-creating the DNA instructions gleaned from the Black Marker, we've managed to create a recombinant microbial life form. It seemed dormant at first, even when placed in a bath of rich nutrients.
我们又有了一个不太好的发现，当红色身影准备接受黑色神印储存的DNA信号时，我们发现“她”可以重组一些微生物的生命形式，不过神印似乎一直处于休眠状态，即使放在饱和析出溶液中也没有发生啥事情。
Were it not for Dr. Clifton's poor hygiene, we might have deemed the attempt a failure. Fortunately for us, he had not fully decontaminated himself before working with the sample and managed to contaminate it with some dead skin cells. Suddenly, the microbes jumped into action! Recombination happened almost instantly and the sample began self-replicating and mutating before our eyes.
如果克利夫顿博士没有那么邋遢，我们可能会觉得这次实验又失败了。因祸得福，他在实验的时候并没有好好进行洗消，造成一些脱落的表皮细胞污染了这个无菌的研究过程。
顷刻之间，死亡的表皮细胞居然重组了!这些细胞样本在我们面前疯狂的自我复制并且发生了突变。
···
More confounding results from our research: Today, as we moved what we're now calling the Red Marker, we had to pass by the cellular lab area. The scientists working at the time complained about interruptions in the necrotic flesh experiments. As is turns out, the field generated by the Marker creates a "dead space" around itself that forces the recombination effect into dormancy.
我们研究出来了一些很迷惑的玩意——今天在移动红色神印的时候不得不让神印通过当初那个死皮细胞的实验室。正在工作的科学家们都在抱怨死皮细胞实验被搬运神印所打断了。不过实验也证明了红色神印可以在她的周围创造一个能让受到神印影响正在突变的细胞休眠的力场，这种力场我们称之为“死亡空间”。
···
I apologize for the setback relayed in the last report. The macro-scale infection has been contained with a minimal loss of life. The newly recombinated doctors are now quarantined for further study.
我为上次报告中提到的一些小挫折表示道歉。大规模爆发已得到控制，死亡数量也控制到最低，这件事情之后重新组建的医疗团队也已经隔离并且等待我们下一步的研究。
···
Many of the scientists have been complaining of headaches and we are all having difficulty sleeping for more than an hour at a time. We suspect a problem in the ventilation system. The maintenance team reported finding a build-up of some kind blocking the airways.
近段时间以来我们非常难以入睡，甚至是能好好的睡一个小时，很多科学家一直在抱怨自己头疼的问题。
并且我们怀疑环控通风系统有问题，维修班组也在报告中提到有某种堆积物堵塞了通风管道。
···
The organic mass continues to expand and take over the complex. The recombinated nightmares now move freely through the corridors. My remaining crew is hastily constructing a transmitter for the Marker in an attempt to broaden the signal it is emanating. Dr. Foster said the idea came to him in a vision. Our hope is to use the signal to keep the unchecked infection from spreading to the landing area. There is little time remaining! You must send help as quickly as possible! Our lives are in your hands.
这些有机体持续扩大并且形成了一个聚合体，这怪物现在大摇大摆的在殖民地里面到处“玩耍”。我和剩下的幸存者为神印创建了一个基站尝试放大能让突变有机体进入休眠的力场。
福斯特博士提到这个想法是在幻觉中得到的灵感，我们非常希望利用这个信号来阻止感染爆发蔓延到殖民地着陆区，我们没多少时间了！请您尽快来救我们！我们存活与否都取决于您了！
2311年年初，主权殖民地联盟通过托勒密阵列让三个红色神印以三角定位的方式确定了冰冻星球塔弗兰提斯的黑色神印信号源。主权殖民地联盟孤注一掷，派遣并组建了一只精英远征舰队前往冰冻星球“塔弗兰提斯”。
冰冻星球塔夫兰提斯联盟陆军初始着陆区（初始机场）
这只舰队由指挥舰兼旗舰的罗阿诺克号、作为舰队质量驱动中枢的新星号、格里列号、布鲁斯洛夫号、黄蜂号和沙克尔顿号组成，其中新星号作为舰队的质量驱动母舰承担着为整个舰队“开启”冲击点压缩空间的任务。
此处引援主权殖民地联盟武装力量-信息通讯第20481号，联盟陆军“212哨位”日志条目：
SCAF-ISC-20481 MD212 LOG ENTRIES: SFC LUMLEY
AUG 29, 2311: INITIAL DROP ZONE ESTABLISHED. CMS FRANKLIN AND CMS CROZIER EN ROUTE WITH EQUIPMENT AND PERSONNEL.
SEPT 03, 2311: DEPOT CONSTRUCTION UNDERWAY. SGT GEORGE COCHRAN AND 21ST ENGINEERING ESTABLISHING PIPELINE TO PRIMARY DIG SITE.
OCT 11, 2311: DEPOT COMPLETE. HEARING SOME WILD STORIES FROM PRIMARY DIG SITE.
OCT 13, 2311: STORMS PLAYING HELL WITH RESUPPLY. LOST CMS FRANKLIN TODAY TO HIGH WINDS. CREW PRESUMED DEAD.
OCT 15, 2311: CREW OF FRANKLIN RECOVERED. THEY JUST SHOWED UP ON OUR DOORSTEP. SOMETHING WRONG. BRINGING THEM IN UNTIL THEY CAN BE TRANSFERRED TO CMS GREELY FOR OBSERVATION.
OCT 16, 2311: TURN IT OFF TURN IT OFF TURN IT OFF TURN IT OFF TURN IT OFF TURN IT OFF TURN IT OFF TURN IT OFF TURN IT OFF TURN IT OFF TURN IT OFF MAKE US WHOLE
主权殖民地联盟武装力量-信息通讯第20481号
联盟陆军“212哨位”日志条目：拉姆利军士长
2311年8月29日：首个登陆区已建立。联盟海军富兰克林号和联盟海军克罗吉亚号已经带着设备和人员在赶来的路上了。
2311年9月3号：仓库正在建造中。乔治·科克兰中士和21工程营的人也在建立通往主挖掘场的地铁物流管道。
2311年10月11日：仓库竣工。从主挖掘场传出了一些怪异的传闻。
2311年10月13日：猛烈的风暴导致我们的补给线难以维持。并且今天富兰克林号也因为大风失事了。推测全体船员都已遇难。
2311年10月15日：发现了富兰克林号的船员，他们就这样突然出现在了基地大门口。肯定有哪里不对劲。暂且先让他们进来，之后再送到联盟海军格里列号上进行检查。
2311年10月16日：关掉它！关掉它！关掉它！关掉它！关掉它！关掉它！关掉它！关掉它！关掉它！关掉它！关掉它！让我们完整归一吧！
2311年6月，主权殖民地联盟武装力量舰队抵达冰冻星球塔弗兰提斯。
2311年9月，新星号上的陆战队、陆军部队开始向冰冻进驻相关的工程师，并开始修建初始着陆区。博士塞拉诺也因此发现了当时外星人为了冰冻星球而建设的地底城市远古文明。
外星城市
将军马哈德从舰队总司令马乔里口中得知殖民地的军队和舰队行动的真正目的啥为了寻找神印源以获取其源源不断的力量，与此同时新星号上的指挥官少校凯特尔就布鲁斯诺夫上满是悬浮雷一事对贝尔上尉提出了质疑。
2311年，初始着陆区建设完毕，新星号上的舰载机富兰克林号和克罗吉亚号开始在星球上巡航，大批格里列号护卫舰上的科研人员和新星号上的海军陆战队作战部队来到“冰冻星球”塔弗兰提斯的星球地表并开始建设建筑、补给站、中继站等基础设施设备。
联盟陆军塔夫兰提斯大本营
第14工程旅开始组成深层挖掘小队参与通往“外星遗迹”的道路建设。
马哈德将军的第163“死神”特种部队部队正式进入军营。
深层挖掘队已出现因接触神印而导致的幻象，半数以上人员听到“关掉他”的声音。列兵瓦力到达他所在的挖掘地点，大量冰冻状态下的外星原住民浮现出来。
来自新星号上的MU90补给队向“外星遗迹”工作区域运输大量工程、建设使用的备件。星球上除驻防部队和科研人员之外，所有余下的劳动力都前往“外星遗迹”进行相关的建设工作。
塔弗兰提斯星球殖民地因全员进行建设作业，导致其挖掘队员出现了比神盾7事故中更为严重的影响事件。
舰队司令马乔里下达命令将“外星遗迹”挖掘出来的神印标本由富兰克林号运输到新星号上。伴随着外星神印标本登陆飞船，新星号上的船员也开始出现精神被影响的状况。
格里列号的劳拉博士针对“罗赛塔标本”的调查研究后发现这块有机物实际上是外星人的尸骸，且大脑内储存有大量关于这个星球以及神印的资料。于是将其冰冻后切片，而科学家们认为星球表面上所有的神印都是这些外星人所建造的。
罗塞塔
主要补给线修筑完毕，一号设施的钻头组装完成，但是出现了巨大的安全事故。而士兵仍然听到“关掉他”的声音，这些情况对整个神印的发掘计划构成了极大的威胁。
在这之后，第二批文物进入新星号，军士长弗莱斯接收了大量因超载运输而损坏的飞行载具。
神印的所有秘密被公开，富兰克林号驾驶员看到了来自他死去妻子的幻象。
联盟海军克罗吉亚号（富兰克林号同级舰）穿梭机船舱
富兰克林号失事，补给物资被毁，船员全体遇难。
军需官拉姆利军士长被神印影响，脑子充满了“关掉他”的信息。
阿克曼抱怨食物供给问题，军需官军士长拉姆利失踪。
柯克蓝中士开始寻找拉姆利，但是中士的精神开始不正常。墙上出现了“让我们一同归一（Make Us Whole）”的文字。随着文字的出现，拉姆利军士长的RIG信号越来越近。
当柯克兰一行人找到拉姆利的时候，来自舰队补给的食品已经被破坏殆尽，柯克蓝中士被神印控制。遭到神印影响的人开始食尸，拉姆利开始疯狂杀人，塔弗兰提斯地面感染事件爆发。
一些被冰冻起来的外星尸变体被当作标本送到各艘飞船，“塔弗兰提斯”尸变体事件全面爆发。
马哈德要求马乔里立刻停止一切关于神印的作业，而司令马乔里则是一个不折不扣的统一教徒，自然不吃这一套。马哈德将军让特种部队潜入罗阿诺克号，并以武力软禁马乔里，整个舰队指挥权转移到马哈德手中，而马乔里在不久后自杀。
失落舰队（途中主体舰艇为联盟海军新星号）
至此，距离主权殖民地联盟来到这个星球已经过了2年，2313年,将军马哈德告诉博士塞拉诺“已经没有马乔里司令的支持，现在你只能靠我”。
在这之后，塞拉诺博士的研究开始有了惊人的进展。她发现控制这些尸变体的其实是那个犹如卫星一样的巨型聚合物血月在控制着所有尸变体的行动。
主权殖民地联盟军开始和尸变体直接交手，主权殖民地联盟议会以防万一制定五号预案。相关信息我们可以从《死亡空间3》第14章节中的文本日志“最终联系”里了解到相关内容：
FROM: GOA Ambrose Caiden
来自：安布罗斯·凯登
TO: GEN Spencer Mahad
致：斯宾塞·马哈德
SUBJECT: SCENARIO FIVE
五号预案
After receiving your reports on Dr. Serranos's latest discoveries and in light of recent activities at the marker test sites, it is the decision of the council to invoke scenario five. What we once thought would save us from extinction has only served to hasten it.
鉴于最近针对神印的相关研究以及在引援关于塞拉诺博士的最新报告之后，联盟政府议会决定启用五号预案——这个让我们曾经觉得可以拯救我们的东西反而加速了我们的灭亡。
Everything about the markers - all research, all replicas, even the black marker - must be forever buried. All sites are to be shuttered. All involved planets are to be blacklisted. Everyone involved in the marker program, from Aspera to Aegis VII to Tau Volantis are to be executed.
无论是从阿斯佩拉、神盾7还是塔弗兰提斯，这些关于神印一切的一切都必须完全摧毁——无论是研究资料、红色神印还是黑色神印。所有参与神印实验的星球、参与神印实验的每个人都必须清理干净。
We realize this will effectively negate our ability to fight the war against the separatists. They will no doubt take power and form an Earth government in the vacuum we leave behind.
我们都知道这会让我们与分裂分子之间的战争陷入被动局面，这帮人肯定会在权利真空期间推翻我们的政府并且建立一个新的政权。
But to save the future of mankind, this must come to pass. Should one person, ship or scrap of paper survive to make its way into their hands, the epidemic will begin anew and our sacrifice will have been for nothing. I know I can count on you to carry out these orders.
但我相信，为了全人类我们必须要完成这个使命。哪怕是一艘船、一个人甚至是一张纸没有被毁掉并落入了这帮人的手中，我们做出的牺牲都会白费，灾难将会卷土重来。所以你应该会明白我的意思。
It has been a pleasure working with you for these many years.
这些年与你共事感到非常荣幸。
Long live the colonies.
联盟万岁！
五号预案的核心就是联盟军队的焦土战略。所有关于神印的实验计划所得到的数据和神印必须全部摧毁，塔弗兰提斯远征部队的行动必须完全“终止”。而联盟政府通过逆向工程复制的神印和塔弗兰提斯星球的远征部队都必须被掩埋，以此防止新建立的联合地球政府攫取任何一丝关于联盟政府研究的成果。
弗里曼解冻外星尸变体冰封后被杀害，阿丽莎博士将弗里曼列兵的尸体钉起来并且亲眼见到了列兵的变异过程，博士发现列兵的变异和神印的影响脱不了干系。
塞拉诺博士发现外星生物有鳃，并且有如同鱼鳞一样的东西。结合地址勘测发现这个星球以前是一片汪洋大海——在一夜之间被全部冰封。此后，塞拉诺的的探索重点直指“外星遗迹”。
外星遗迹
第163特种部队的士兵对列兵麦尔斯的侮辱，直接导致其潜入军营将15名“死神”军营士兵杀害，之后麦尔斯受到神印的影响。
塞拉诺博士遭遇由外星生物的卵孵化出的变异外星生物，一号设施深层钻井、二号设施罗塞塔（Rosseta）均目击到了大型蜘蛛类型的“雪怪”，这直接导致分布在在两个设施的工作人员以及士兵被杀害。
博士发现“远古机器”后设立了营地，并对进入机器的门进行音频破解。
深层挖掘小组由于营地驻扎位置不利造成全员被屠杀殆尽，遗迹尸变体大规模爆发。而塞拉诺发现这座地底城市实际上是由外星人的身体铸造的。
深层挖掘组成员全体疯狂，他们在衣服上大量写上神印字体和疯狂涂鸦。并且满口说到“让我们一同归一（Make Us Whole）”。塞拉诺紧急隔离了大量疯狂的挖掘组成员，并且有大量外星文物、士兵尸体、古代生物、冰冻标本被送往了新星号。
新星号的指挥塔指挥官塔克·爱德华向舰桥指挥官凯特尔上尉了解关于“起源行动”（Cradle Operation）的计划后遭到了拒绝，被运输到新星号上的冰冻棺材其实是从深度挖掘区域被屠杀的士兵，这些士兵在被冰冻之前已经变异成尸变体。
新星号查尔斯中尉收到了来自于星球表面士兵缇姆传输的关于“外星机器”的图像资料。 塞拉诺一行人对外星生物的语言、发音进行详细研究，外星遗迹的大门被破解打开。
外星生物的一具完美尸体被制做成标本，塞拉诺将标本送往罗赛塔进行切片研究。并且开始着手对外星生物的大脑资料进行提取来制作一个代号为“译码器（CODEX）”的节点译码器设备。
题外话：“CODEX”在作为英文名词使用的时候译为“法典”或“古抄本”，在游戏中这个东西本质上是古代外星科技的一个复制品，被科学家作为了一个翻译外星语言的译码器使用，所以这个单词在游戏中实际上有双关之意。
在这之后，塔弗兰提斯星球和轨道舰队的感染扩散范围越来越大。以防万一，马哈德将军按照议会的要求实施五号预案。我们可以在《死亡空间3》第11章节中看到名叫致全军备忘录的文本：
SCAF-AHC 30904 FROM: GENERAL SPENCER MAHAD
主权殖民地联盟30904号令，来自斯宾塞·马哈德将军
ATTENTION ALL HANDS: SCENARIO FIVE HAS BEEN DECLARED.
全体注意，五号预案已经实施。
ALL FLIGHTS ARE GROUNDED. DO NOT ATTEMPT TO CONTACT THE FLEET.
所有针对轨道舰队的交通艇均已停飞，不要尝试联系轨道舰队。
REPORT TO YOUR SUPERIOR OFFICER FOR ORDERS.100% COMPLIANCE IS REQUIRED. THIS IS NOT A DRILL.
请向你的上级军官报道，并且保证对本条命令完全遵守，这不是演习。
GOD SAVE THE COLONIES.
天佑联盟。
同时在联盟军队的五号预案实施视频中也可以看到这段信息：
第10官方令/信息计划部门/主权殖民地联盟军队参谋部
If you're watching this film, it means despite our every precaution, containment has become a necessity.
如果你看到了这个，这意味着我们所有的预防措施已经失效，遏制成为了必然手短。
It is now up to us to make the ultimate sacrifice for the safety of the Sovereign Colonies we have sworn to protect.
虽然我不知道我们做的这一切究竟会怎么样，但现在我们必须誓做联盟政府安全的殉道者。
We understand we cannot expect one hundred percent compliance.
我们理解这项命令不太可能会完全遵守。
Therefore the military arm of this final quarantine campaign will divide into three tiers of soldiers on sweep and cleanse duty.
为了防止这种情况的发生，负责本次行动的部队将会分为三组：
The first crew disables all vehicles, the next takes census of those who obeyed the order and provides assistance to those who have not.
The last destroys all data, records and communication structures on Tau Volantis and in orbit.
第一组：破坏所有的载具。
第二组：帮助那些不愿意成为人类利益牺牲的人做一些力所能及的事情。
第三组：彻底摧毁塔弗兰提斯地面和舰队轨道上的所有数据、日志和通讯记录。
At the end of these tasks, each group will consider their missions objectives complete, and proceed to self-terminate.
当以上这些任务目标都完成后，为自己送上最后一程。
God bless the sovereign colonies and may he has mercy on us all
愿上天能够原谅我们！天佑联盟！
五号预案实施后，所有人开始执行该命令。而沙克尔顿号的指挥官拒绝执行五号计划，并且用主炮朝布鲁斯诺夫号开炮，之后布鲁斯诺夫号发射了两枚导弹直接命中沙克尔顿号导致其被击毁。
2314年，贝克福特上尉将在一号设施研究的“译码器”送往罗塞塔，天不遂人愿这架承载了塞拉诺博士希望的运输机最终还是坠毁了。博士为不让这一个血月连入庞大的神印网络而让列兵缇姆和列兵山姆去去找“译码器”。
2314年6月18日，博士为了防止最坏的情况发生，在外星遗迹的各个地点留下操作提示的影像。在找到“译码器”的俩列兵由于坠毁飞机引起的松动导致山姆死于雪崩，马哈德也在杀害缇姆后将“译码器”的所有资料抹除掉。在这之后，塞拉诺博士重伤而亡，外星遗迹被掩埋。
最终，主权殖民地联盟行动宣告失败。
总体而言主权殖民地联盟这种孤注一掷的作战方法是失败的，但无论是联盟议会“玉碎”的做法还是赛拉诺博士想要直接杀死血月的做法思路都是正确的，无论是否出于焦土战略，而时间同样也证明了这为之后成立的联合地球政府续了200年的命。
2314年，由此自白令海战争后成立了168年的旧地球政府——主权殖民地联盟，彻底覆灭。