人類濫用科技導致母星面臨毀滅，便用宇宙之心作為方舟的核心製作出方舟跨越若干光年降落在富有能量但尚未開發的王者大陸，曾經的人類成為了王者大陸的神明。他們創造新人類，修建十二座奇蹟，並用第一座奇蹟：日之塔，將埋藏在王者大陸下的能量從地底運到上面，保護他們的居所：倒懸的城市，倒懸天。其中為首的神明給自己取名叫女媧。
在人類抵達王者大陸之前，這裡曾經的居住者是擁有獸型體態的生物：魔種。到來的人類（如今的神明，也叫超智慧生命體），奴役他們做修建奇蹟的勞動力。諸神還挑選了一部分新人類進行力量強化實驗：改造成功的成為神職者；改造失敗的淪為平民，被後世稱為魔道家族。
隨著諸神對能量的過度採集，能量發生異變，汙染了勞動力們的生存空間，孫悟空帶領著豬八戒、牛魔等魔種起義，不過失敗了。但是汙染依舊存在，女媧派后羿關閉受到汙染的日之塔，但她的行為受到了以帝俊為首一些神明的反對，帝俊認為為了獲得力量在所不惜。為了爭奪話語權，神明之戰爆發。
這場暗無天日的神明之戰最後以帝俊戰敗而亡作為收場，神明們死傷殆盡，女媧奄奄一息，起源之地的輝煌不復存在。女媧恍惚間明白了創造與毀滅的輪迴無法避免，究極力量終究不能為人所支配，她用最後的力氣將方舟核心（就是宇宙之心）封印，將鑰匙放在了十二座奇蹟中，期待著將來會有能正確支配力量的人出現，眾神隕落，象徵著一個時代的終結。
轉眼已是三千年，人類繼續繁衍生息，創造了屬於自己的文明，迎來了璀璨的英雄時代，當年的十二奇蹟部分猶在，部分下落不明，昔日的神明時代幾乎淪為傳說。西方大陸某處，“墮世之神”帝俊因為曾經在方舟上偷偷保存了一小小塊方舟核心，得以甦醒，但他只有意識不能移動，需要方舟核心來重塑機體。有一天滲透在土地裡的長安城牡丹花的汁液帶來了關於方舟核心封存地的線索，被帝俊選中的青年馬可波羅，帶著使命，踏上了東方大陸。
稷下學院的老夫子是曾經的神職者，見證過神明之戰，如今他是稷下三賢者之首，大陸第一強者、王者大陸最智慧的**。文明不能再度毀滅，要比墮世之神先找到奇蹟鑰匙，阻止宇宙之力被錯誤使用。夫子將厚望寄託於受徵召的英雄。
未來征程已然開啟：
同伴與敵人，奇蹟和命運，這一次，究極的力量能否找到它正確的方向？
王者大陸
【建木】
倒懸天：姜子牙、女媧、楊戩、哪吒、妲己、太乙真人、夢奇、盤古
女媧是造物主，王者大陸新人類之始。當年神明們把新創造的人類養在溫室裡，新人類不甘於沒有自由，殊死搏鬥，盤古看不下去了，拿起巨斧衝在最前面為人類開闢道路，他不斷的戰鬥著，直到終於打破了溫室的屏障，自此，人類得以自由，盤古則默默消隱了。夢奇的祖先是 穿梭在夢裡的生靈，以噩夢為食，神明奴役魔種的時候放過了這個看起來沒什麼用的種族，把他們趕出了倒懸天。後來，小魔種夢奇活潑又大膽，跑去倒懸天吃噩夢，結果跑進了一個人的夢裡，在夢裡他看到了他們種族被製作出來的過程（夢奇一族不是原居民嗎？這人怎麼夢裡有夢奇的製作過程？）。被夢奇稱為主人的人在意識的最後一刻將銘文交給了夢奇，希望它可以將天書碎片（就是銘文？）交給合適的人。最後，他與機關巨人融為一體，在王者峽谷和蒼狼同歸於盡（也有猜測這個人就是夢奇本身）。
太乙真人，特級鍊金術師，在倒懸天參與奇蹟製作時被力量蠱惑，拿著奇蹟鑰匙跑了，為了躲避追蹤順便救人，把鑰匙換在了瀕死的哪吒心臟裡，哪吒長大後力量過於強大被召喚到倒懸天，太乙不放心跟著去看，結果手癢鍊金遭發現，關進牢裡後被哪吒救走。當權者大怒，要罰陳塘關，哪吒暴走，被太乙救下來時已經死了，太乙用自己的心等價交換救回了哪吒，太乙則和爐子合二為一。楊戩被女媧派去殺姜子牙，因為女媧覺得姜子牙日漸強大，不好控制。但後來楊戩遇到了新生的哪吒，兩人一拍即合，決定一起去幹點自己認為正確的事。
姜子牙和老夫子本是一對摯友，因為一個提倡驅除魔種恢復上古人類輝煌，一個提倡萬物和平共處，兩人不得不分道揚鑣。朝歌的紂王試圖讓人類和魔種和平共處，為姜子牙所不容，姜子牙做了個人偶去蠱惑失去愛人的紂王，妲己跑到紂王死去的愛人屍體旁，發現紂王把自己的心臟放在了愛人心臟裡，同時他愛人發現紂王出軌妲己，憤憤捏碎自己屍體裡的紂王心臟，正在戰場作戰的紂王卒。史書道紂王與魔種同流合汙，誰又知歷史真正面目。古都朝歌沉入地底，古老的知識長眠，小妲己有了自己的思想，任務完成要離開，但是她身體裡容納著關係未來的秘密，被困進了莊周夢裡。
（奇蹟：日之塔）孫悟空、牛魔王、豬八戒、嫦娥、后羿
日之塔坐落在北方的極寒之地。嫦娥的家族是當年人類進化改造的失敗者，也就是魔道家族，他們因不甘心，慫恿魔種起義，被神職者們處決，后羿不忍心14歲的嫦娥死去射偏了本應百發百中的箭，嫦娥則覺醒力量消失在月光裡。因為汙染威脅生存，也因為被奴役太舊，孫悟空和牛魔、豬八戒，帶領魔種們揭開了魔種起義的序幕。牛魔因為害怕神明的奇蹟武器而出賣眾人，神明用元氣炮（也就是後來的東風祭壇）炸了起義者營地，孫悟空被抓，豬八戒獨自殺上倒懸天，誓死尋找好友。後來汙染越來越嚴重，女媧派后羿關閉日之塔，結果后羿想要佔據日之塔的力量，日之塔被毀後力量到了后羿身上，神明早有準備殺了后羿。后羿後來不知道被誰挖出來又復活了，孫悟空也是不知道被誰呼喚又醒了。