特工，你好：
在您正式加入拯救奧古斯特特區的工作中之前，本篇檔案旨在幫助特工梳理黑色星期五汙染事件的始末，以及艾倫基納是如何背叛戰略局，成為我們最危險的敵人之一。
戈登·阿默斯特作為一名優異的免疫學學家，這個偏執的學者認為現代社會中的人們患上不可治癒的虛偽和麻木。在黑色星期五的假期中，他在新艾伯市中心製造且投放了汙染物質。
面對汙染侵蝕，沃勒總統選擇保守地執行51號政令，第一波特工正式前往新艾伯市進行調查與救援。其中包括了艾倫基納，哈維爾·卡吉卡等當前仍在潛伏的對抗特工們。
在遭遇敵對陣營幾輪暴力襲擊和新艾伯市大停電等事故後，聯合作戰部隊決定將新艾伯市中心地區全面封鎖，曾經摩肩擦踵的街道變成了人跡罕至的暗區。這項決定極大地挫傷了國土戰略局的特工們，第一波特工中，有的放棄了特工身份，轉為了對抗特工（例如艾倫基納與卡吉卡）；有的逃避作為特工的職責，轉身離開。
為了儘可能地挽救新艾伯市，阻止暴亂與汙染繼續蔓延，沃勒總統迫於壓力，全面啟用了第二波特工。第二波特工們則依次消滅數個新艾伯市的暴力集團，將秩序與規則重新帶回了新艾伯市。
同樣也正是因為對抗特工的出現，第二波特工需要面對的不僅僅是暴力集團，還有對戰略局內部體系相當熟悉的艾倫基納。在一次行動中，第二波特工發現艾倫基納擄走了與戈登·艾默斯特合作研製出汙染物的科學家：契爾年科博士、一臺DNA生物製造器以及汙染物的配方。
不久之後，一則來自
自此，您的故事，正式開始。
