1、尋找“六根”復活悟空
《黑神話：悟空》的故事開始於西遊師徒取經任務圓滿完成之後。遊戲伊始，已經封位“鬥戰勝佛”的孫悟空決意放棄佛位，回到花果山“退休”。天庭派出二郎神率領天兵天將再臨花果山，以屠戮花果山為挾“請”回悟空。兩人再次在雲端單挑鬥法，天地為之震動。
最終悟空落敗，其六根中的五根——眼、耳、鼻、舌、身——被作為獎賞，分給五位妖王——黑熊、貂鼠、黃眉、百眼、牛魔。而其“意”則化為一塊奇石，落在花果山巔，成為猴子猴孫口耳相傳的傳奇。世代以來，無數猴子猴孫從花果山出發，歷經艱難險阻，挑戰妖王，試圖尋回並蒐集“五根”，進而合而為一，復活孫悟空。
玩家扮演的主角“天命人”就是猴子猴孫中的一員。踏著前面無數失敗者的足跡，最終在遊戲人氣並氣人角色豬八戒的陪伴、引導和幫助下，擊敗五大妖王，尋得“五根”。一路上，玩家通過“天命人”視角，瞭解諸仙眾神的緣分和故事。這些故事或續接、或呼應《西遊記》原著劇情，如黃眉怪與金蟬子的對賭、牛魔王的中年危機、天蓬元帥的未了前情，等等。
最終，“天命人”攜“五根”進入孫悟空生前記憶，戰勝悟空殘存意念和身軀，清除悟空不淨“六根”，戴上金剛緊箍，收緊心猿意馬，承接“孫悟空”名號、裝備和法術，成為下一個“孫悟空”。
2、流行文化再造經典
在眾多3A大作中，劇情和結局往往是多線、多個的。以上所述可能只是《黑神話：悟空》的劇情和結局之一。但就目前已知的信息中，遊戲中不僅有對大量《西遊記》原著妖怪、元素想象的呈現和還原，更清晰可見當代流行文化、網絡文學對經典《西遊記》的再造和延伸。
在前往最後戰鬥的路上，擺渡老猴逐一細數悟空不淨“六根”。其中談到情心未斂、多情易折時，稱悟空雖曾三次親手打死白骨公主，意在斬斷情根，但心裡還是沒有放下。這番臺詞與設定直接承繼自遊戲製作人參與的早期作品《鬥戰神》，更讓人直接聯繫到周星馳電影《大話西遊》中，對孫悟空與白骨精情緣的再創作。
與動畫電影《大鬧天宮》及86版電視劇《西遊記》不同，《大話西遊》因其無厘頭的風格、喜悲劇的內核，也因其中對孫悟空感情世界進行創作，對西遊師徒形象的再造、對時空穿越的創新設定，被當時廣大年輕人所津津樂道，引發解構經典的熱潮。
上世紀末本世紀初，互聯網公共空間興起，1995年，電影《大話西遊》在港鎩羽而歸，卻在各大網絡論壇中，受到了內地年輕人追捧，進而催生出眾多西遊記及孫悟空題材的同人創作，今何在小說《悟空傳》就是其中代表。小說以唐僧被孫悟空打死作為開頭，先聲奪目。這樣改編《西遊記》，四百多年來幾乎是第一次。