《寶可夢》世界觀中各個寶可夢作為生物自然也會分為兩種性別，那麼在遊戲中性別會影響哪些內容呢，下面請看《寶可夢》系列術語性別介紹，希望能夠幫助大家。
第一世代中，在設定上尼多蘭與尼多朗是同一物種的不同性別，在許多語言中二者名字相同，只不過末尾加上了♀和♂的後綴。
正式的性別機制於第二世代引入。寶可夢可分為三種性別：♂雄性（日文︰オス，英文︰male）、♀雌性（日文︰メス，英文︰female）和不明（日文︰不明，英文︰Unknown）。
有些組合並非各自是單一性別，或者並非是同一家族。它們的配對來自於設定和形象上的些許聯繫。
有些寶可夢只有唯一的性別，並且沒有合適的配對。
有些形態變化只有唯一的性別，並且這些形態無法生蛋和進化。
寶可夢的性別在生成時決定，取決於它的性別比例。
性別與攻擊個體值相關。因此，對於非固定性別的寶可夢來說，♀的攻擊個體值不可能很高。
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性別與性格值相關。不同性別比例有不同的性別閾值，用性格值最後1個字節的數值（稱為基礎值）與性別閾值進行比較來決定寶可夢性別。
性別閾值不再與基礎值（0-255）比較，而是一個隨機數（1-252）。
性別閾值與一個隨機數（1-253）比較。
主頁面：擁有性別差異的寶可夢列表
第四世代起，有些寶可夢的不同性別在形態上有微妙的不同。比如雄性的皮卡丘尾巴尖端是平整的，而雌性的則是桃心。
部分寶可夢性別差異較大，類似於形態變化一樣分別有各自的繪圖和形象數據空位：
部分寶可夢性別差異極大，而且特性、可以學習的招式等都有區別，已經完全到達了形態變化的程度：
主頁面：寶可夢培育
寶可夢培育與性別息息相關。特別地，若生蛋的母方是尼多蘭或者親代是尼多朗或其進化形和百變怪*，子代由性別決定是尼多蘭還是尼多朗。若生蛋的母方是甜甜螢或者親代是電螢蟲和百變怪*，子代由性別決定是電螢蟲還是甜甜螢。
有些寶可夢只有在特定性別下才會進化：
只有奇魯莉安♂可以使用覺醒石進化為艾路雷朵。
只有雪童子♀可以使用覺醒石進化為雪妖女。
結草兒♀在20級時會進化為結草貴婦，結草兒♂會進化為紳士蛾。
三蜜蜂♀在21級時進化成蜂女王，三蜜蜂♂則不會進化。
夜盜火蜥♀在33級時進化成焰後蜥，夜盜火蜥♂則不會進化。
甜蜜球：若當前出戰的寶可夢與目標處於同一進化家族中，且性別相異，捕獲率×8，否則捕獲率×1。
迷人、誘惑和超極巨熱情擁抱只對異性寶可夢有效。若使用者和目標中任何一方為性別不明，那麼招式失敗。
迷人之軀：對戰中異性寶可夢使用接觸類招式攻擊該特性的寶可夢時，會有30%的機率著迷。對戰外當該特性的寶可夢配置在隊伍首位時，出現的野生寶可夢為異性的機率變為2⁄3。大量出現、隱藏洞穴的寶可夢不受影響。
鬥爭心：對手與自身性別相同時，招式威力提升25%；性別不同時威力下降25%。雙方只要有一方為性別不明時，招式威力不變，群體對戰的群體傷害中，多性別仍然為同性威力提升25%，不同性威力下降25%。
遊戲機制上寶可夢沒有性別，相關招式和特性做出了改動。
性別不明的寶可夢以—標誌表示。雄性和性別不明的寶可夢擊中要害率×1.5，雌性的寶可夢命中率和閃避率×263⁄256。除了固定性別的寶可夢，在奇數樓層遭遇的寶可夢都為♂，偶數樓層都為♀。
某些主角和搭檔只能選擇特定性別，性別還將影響二者的性格。劇情中有些傳說的寶可夢是有性別的（比如時拉比是♀），但是遊戲機制上仍然視為性別不明。
日文版中，遊戲開始的劇情可以選擇搭檔的性別。遊戲機制上寶可夢沒有性別。
聯繫球可連接的寶可夢中有部分寶可夢能♂和♀各連接一隻。遊戲機制上寶可夢沒有性別。
只有主角、搭檔和果然翁有性別設計，其餘寶可夢皆為雄性樣貌。遊戲機制上寶可夢沒有性別。
在電屬性＆鋼屬性蛋活動的說明文中，性別不明的寶可夢以△標誌表示。
主頁面：寶可夢列表（寶可繽紛趣）
在2022/06/17起，寶可繽紛趣追加伊布和皮卡丘的性別，♂、♀屬不同寶可夢，他們的拿手特調材料及關卡圖示有所不同。
由於露力麗的性別比例與瑪力露不同，在第六世代前1⁄3的雌性露力麗進化後會變為雄性瑪力露。
有些寶可夢在圖鑑或其他旁支遊戲及動畫中被描述為特定性別，但在主系列遊戲中屬於性別不明。如蒼響被描述為藏瑪然特的姐姐、撫養幼年人類的薩戮德有被稱為“阿爸”的形態。
有些寶可夢名字中帶有固定性別的字、詞，但並非固定性別，如土龍弟弟、哥德小姐、噬沙堡爺等。
在寶可夢大集結中，可以根據伊布時期的尾巴花紋判斷遊戲中的仙子伊布都是雄性，太陽伊布和冰伊布都是雌性。而嘟嘟及嘟嘟利皆為雌性。
但在該遊戲中並沒有與性別相關的系統或招式。