在原本虚无的Cytus系统中，忽然有了一段输入： “who...I......am?”
输入者稍稍犹豫，又将这段文字删除，并再次输入： “New song released”(新歌发表） 选择并上传这条帖子后，来自Cytus大型互联交流系统的大量讯息朝玩家涌来。Cytus 2，开始了……
遥远的未来，在CYTUS 2时间线的很久以前，终焉病毒蔓延整个世界，许多人因此丧命。仅存的人类为了生存下去，建造了Shelter，并在其中进入休眠。这期间，人类也利用高超的科技力制造了人工智能机器人。此举动的目的就是在人类休眠期间等待终焉病毒变得稀薄，同时让机器人为人类建造隔绝病毒的居所(node)。而人们在精神网络空间cyTus里生活。但是一位传奇DJ Æsir的一场音乐祭而导致的数以千万计人精神联网出现问题，进而失去记忆为故事开篇，展开了一段不断反转的悬疑故事。
雷亚对剧情和人物的打磨细致且精彩，由于发售时不是完整剧情，可以说玩家的留存率都是想追完这部群像剧。(后面略有剧透，但不多)
而cytus2中的第一把刀子，虚拟歌手paff。
aroma自小与姐姐相依为命，而年长的姐姐则含辛茹苦养活aroma。在689年圣诞节，aroma在姐姐工作的酒吧唱歌，展现出了音乐天赋。之后，姐姐结婚带着aroma一起住进研究局的姐夫noch家。
aroma并参加歌曲选秀节目，一时间声名鹊起。姐姐作为aroma的经纪人，与单声公司谈判并加入单声公司。生活的一切似乎都在步入正规，直到在aroma以虚拟偶像PAFF的身份在演出的途中，发生了车祸。虽然经历了失忆但是后面似乎恢复了。可姐姐与姐夫似乎在瞒着PAFF什么事情。直到PAFF在一次晕倒住院之后，与决定出走。
paff之后故事可为跌宕起伏。aroma实则却是被人贩子贩卖的女孩，并且被植入了paff的记忆，其在失忆的情况下与寻找多年她青梅竹马Hayato擦肩而过的桥段也让许多玩家大哭虐心。
把人的记忆转移到另一个人身上，而另一个人将不复存在。外在环境可以被抹杀，而内心的潜意识可以被怎会被轻易代替，这是生命与生活在灵魂深处刻下的烙印。此时，PAFF身上却有三个“核心”：Aroma、被贩卖的女孩和重组后如新生儿一样接触这个崭新世界的PAFF。显然当PAFF身上的三个“核心”都觉醒的时候，她该如何自处，该如何认识自己究竟是谁，又要如何才能将她从生死的罪孽中拯救？就像那首PAFF的专曲《Who Am I》一样，让玩家对PAFF的故事记忆犹存。
音游除了打分，也能讲好故事，用故事也能激励玩家打谱。sytus2初始的五个角色分别对应流行乐、二次元、电音、朋克摇滚和古典乐五种曲风。以及后面版本更新联动了罗德岛的阿米驴，二次元元老初音未来，以及后后续推出了许多角色。
NEKO
ROBO_Head
Xenon
ConneR
回到本文开头讲述的，cytus2是一个刀片厂，给个提示cocytus是cytus的词源。出色的剧情内容和剧本展示出的游戏世界也是向玩家们打造出了一个又一个鲜活的人物，当然角色们最后都在一个特殊的地方大团圆(狗头.jpg)