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中世纪：萨拉札家族与光明教的纠葛
在中世纪的西班牙，一个名为萨拉查（Salazar，音译）的家族统治着一座雄伟的城堡。城堡矗立于一片广袤的土地上，四周环绕着茂密的森林和幽深的峡谷，宛如一座与世隔绝的堡垒。然而，在这片看似宁静的土地上，却隐藏着一段不为人知的秘密。
在城堡的附近，一个名为Los Illuminados的教团悄然兴起。这个光明教利用一种名为Las Plagas的寄生虫进行秘密的宗教活动，这些寄生虫具有奇异的力量和未知的潜能，使得光明教成员在某种程度上获得了超乎常人的能力。然而，这种力量的代价是巨大的，它带来了无尽的痛苦和灾难。
萨拉札家族的第一代城主，一个充满智慧和勇气的领袖，察觉到了光明教的威胁。他决心消灭这个邪恶的存在，以保护他的领地和人民。经过一系列精心策划的行动，他成功地将那些邪恶的寄生虫全部深埋在城堡附近的地底，永远地封印了它们的力量。
与此同时，在欧洲的另一端，一个名为托马斯·特拉维斯的富商正在崛起。他创立了一个海上贸易集团——特拉维斯贸易公司，通过和东方各国的交易获得了大笔资金。这些资金为特拉维斯的运输部门打下了坚实的基础，使得他的企业逐渐发展壮大。
1800年：特拉维斯贸易的崛起与亨利·特拉维斯
到了1800年，特拉维斯贸易已经成为了一个资金雄厚的贸易企业。当时欧洲正盛行着冒险与勘探的风潮，许多有志于探索世界、一举成名的年轻人纷纷投入到这个领域当中。特拉维斯家族中的小儿子亨利·特拉维斯（Henry Travis）便是其中之一。
Tricell
亨利将家族中属于自己的资金全部投入到了冒险领域，他立志成为像大卫·利文斯通一样的勘探家，并誉满世界。受到大卫·利文斯通在非洲勘探成果的影响，亨利先后五次前往非洲大陆进行冒险和勘探。他的勘探足迹遍布非洲的每一个角落，从热带雨林到广袤的草原，从巍峨的山脉到浩瀚的沙漠。
亨利对这些地区的地理、气候、动物、植物、矿产、人口分布和民俗等进行了细致的考察，并形成了详细的冒险记录。这些记录不仅为他日后的研究提供了宝贵的资料，也为特拉维斯贸易公司在非洲的起步奠定了重要的基础。
在第五次非洲探险中，亨利亲身经历了一次当地部落的首领选拔仪式。这个仪式正是恩迪拜亚部落（Ndipaya）的首领选拔仪式。恩迪拜亚部落是散居在西非地区的当地土著部落，他们有着成熟的房屋建筑能力和遗产保护技术。然而，人们所不知道的，是现在恩迪拜亚居住地的地下正是古代恩迪拜亚帝国庞大的遗址。
恩迪拜亚帝国的秘密与“太阳阶梯”的传说
古代的西非地区是由恩迪拜亚帝国统治的。帝国的国王有着无限的权威，并且被他的子民奉为“最接近太阳神”的神祗。恩迪拜亚部落流传着一个神话，就是他们的国王拥有数百年的寿命，并且勇敢无畏、刀枪不入。然而，成为恩迪拜亚帝国国王并不是一件容易的事情。因为恩迪拜亚帝国的王位传承并不是依靠血缘关系，而是保持着原始部落传统的推举方式。
太阳阶梯花朵
推举出来的领袖必须要通过太阳神的考验才能成为国王。这个考验就是“太阳阶梯”仪式。在恩迪拜亚帝国地下核心区域，有一片花坛，花坛上种植着恩迪拜亚的圣物——“太阳阶梯”花朵。这是一个有着剧毒物质的花朵，只有少数能够被神所认可的人才能在吃下花朵后存活。想要成为国王，吃下花朵是必然的考验。而花朵带给新国王的也将是漫长的寿命和强大的力量。
地下遗迹
千百年来，恩迪拜亚帝国就是依靠这种方式来选择自己的首领，并将其视为神所认可的人。然而，这个传承仪式在亨利·特拉维斯所记录的那一次之后，却是恩迪拜亚帝国最后的国王传承仪式。其后不久，恩迪拜亚帝国毫无征兆地突然灭亡了。没有人知道这个王国为什么会消亡，只知道恩迪拜亚人放弃了地下的生活，开始移居在地上。而且“太阳阶梯”也被恩迪拜亚人用机关保护起来，不准外人接近。
再过不久，欧洲殖民主义时代掀起，恩迪拜亚部落不可避免地被卷入到殖民世界的浪潮之中，成为欧洲原始资本积累的受害者。然而，在恩迪拜亚帝国的最后时光里，却发生了一场惊心动魄的王位争夺战。两个王位继承者让各自的支持者吃下了太阳阶梯，结果导致恩迪拜亚的地下世界出现了可怕的怪物。这些怪物有着人的身躯，但却多了许多触手，它们撕咬着当地的居民，破碎的尸体遍地都是。而在恩迪拜亚的圣地，两个巨人一样的怪物正在太阳阶梯的花坛上扭打，这也许就是有记载以来的第一次生化危机。
亨利的归来与《自然历史调查》
在第五次非洲冒险结束之后，亨利·特拉维斯自离开祖国34年后首次回到了那里。他将自己多年来的冒险记录一一整理，并形成了72册的勘探总集《自然历史调查》（又名《博物总览》）。然而，这本凝聚了亨利多年心血的作品却并不为欧洲学术界所认同。特别是里面的民俗部分，被当地学术界看作是“很好的冒险小说”。
亨利遭到了学术界的冷遇，从此一蹶不振，不久便郁郁而终。而亨利的长兄，也就是特拉维斯贸易公司的董事长出面收回了全部流传在外的《自然历史调查》。于是很多人认为，亨利被学术界排挤和漠视，很有可能是这位长兄在幕后操纵的结果。其目的很可能是为了特拉维斯家族能够独享亨利勘探的全部成果。
事情的发展恰如预料一般，亨利·特拉维斯的《自然历史调查》成为了后来特拉维斯贸易公司在非洲起步的重要参考文献。特拉维斯贸易也因为在非洲矿业开采、运输上的成功而壮大成联合企业公司Tricell（三联公司）。当年亨利·特拉维斯的勘探总集《自然历史调查》大部分都被他的长兄购回，自此《自然历史调查》在世间彻底消失。
奥斯威尔E斯宾塞
然而，亨利的长兄却不知道，他并没有全部将书籍收回。出身贵族的斯宾塞家族一直保存着一整套《自然历史调查》，并将其传承了下去。
19世纪末至20世纪中期：特拉维斯贸易的转型与“太阳阶梯”的再现
19世纪末，特拉维斯贸易开始根据《自然历史调查》的第17册至24册的这八本非洲矿物勘探记录开采非洲的矿物资源，并建立了一家分社。在整个大陆上，公司采集特定的金属和开采石油以及天然气，不久公司的资金飙升。这些行为就是Tricell自然资源开发部门的前身。
同世纪，一个拥有过人天赋和极其美丽面容的女子——维罗妮卡·阿什福特建立了阿什福特家族的基业，并顺理成章地成为第一代家主。她的智慧和才能使得阿什福特家族在短时间内迅速崛起，成为了一个不可忽视的力量。
到了20世纪中期，特拉维斯贸易开始采集植物、动物、昆虫的标本，亨利的书正是指引着他们的向导。那些从非洲动物群采集而来的样本被用来进行制药部门的研究，不久就带来了巨大的商业成功并为后来的Tricell制药部门奠定基础。
1960年，特拉维斯贸易的三个部门稳固地建立了起来，他们就是Tricell联合企业的前身。与此同时，《自然历史调查》这本书被斯宾塞家族年轻的族长奥斯维尔·E·斯宾塞（Ozwell. E. Spencer）发现了。作为一名当时流行的优生运动的拥趸，斯宾塞恰恰正视了亨利的见闻。而当斯宾塞看到了亨利记述的有关恩迪拜亚部落的传承仪式之后，立刻对其中所记述的“太阳阶梯”花朵产生了浓烈的兴趣。
浣熊市的工业化与威斯克的诞生
在同一时期，美国中西部一个名为浣熊市的小镇上，麻省理工大学毕业的工程师迈克尔·沃伦开始着手电气化自己的家乡。他发誓要引领浣熊市从一个农业为主的小镇走向工业化。在他的带领下，浣熊市逐渐发展成为一个工业化的城市，吸引了大量的人口和投资。
而在1960年4月，阿尔伯特·威斯克出生。
T病毒的诞生与安布雷拉公司的崛起
在1962年，为了满足对病毒研究的迫切需求，斯宾塞以度假为幌子，聘请了著名建筑师乔治·特雷沃，在美国西部的浣熊市阿克雷山区建造了一座内部结构错综复杂、机关重重的洋馆，即阿克雷研究所。
阿克雷研究所
四年后的1966年，斯宾塞与贵族好友爱德华·阿什福特以及生物学专家詹姆斯·马库斯博士分享了这一计划。马库斯博士提出，非洲的“太阳阶梯”花朵可能含有推动人类进化的物质，并渴望前往非洲对其进行成分分析。斯宾塞对此表示赞同，并带领马库斯及其学生布兰登·贝利一同前往西非。
12月4日，在斯宾塞雇佣的武装雇佣兵的协助下，他们成功控制了恩迪拜亚的圣地花坛，采摘了“太阳阶梯”花朵并进行了深入分析。马库斯发现，这些花朵中确实含有病毒样的遗传物质，且特性前所未见。这一发现让斯宾塞和马库斯激动不已，他们随即将这种古代病毒命名为“始祖病毒”，并成功提取了始祖病毒母体样本。马库斯认为，这是解读生命进化密码的关键，于是带着部分“太阳阶梯”花朵返回欧洲进行深入研究。
然而，当他们回到欧洲后，却遭遇了挫折。被带回的“太阳阶梯”花朵失去了原有的特性，无法再提炼出始祖病毒。即便在欧洲新培育的花朵也无法产生始祖病毒。马库斯尝试更换土壤和水质，但并未取得成功。沮丧的马库斯与他的学生布兰登发生了激烈的争执，而爱德华也感到无所适从。此时，斯宾塞提出了共同建立公司的想法，虽然其他人对此毫无头绪，但在心情低落的情况下，他们还是同意了斯宾塞的提议，任由他全权负责公司的组建工作。
1967年，民间组织S.T.A.R.S.在纽约成立，旨在对抗日益猖獗的恐怖分子。与此同时，阿克雷洋馆也正式完工。
为了独占洋馆的构造和秘密，斯宾塞邀请特雷沃全家前来度假，实则将他们作为始祖病毒的活体实验对象。特雷沃的妻子杰西卡和15岁的女儿丽莎被分别植入了始祖病毒的变异体type-a型和type-b型。然而，杰西卡因融合失败而遭到废弃处理，丽莎虽然成功融合，却失去了理智，并袭击了供应饮食的女研究员。
特雷沃在得知妻女失踪后，开始四处寻找，但始终无果。他最终发现自己被软禁在洋馆内，并在绝望中试图逃离，但未能成功。在极度脱水的状态下，他发现了刻有他名字的墓碑，随后愤然死去。
1968年1月30日，为了掩盖研究目的，爱德华·阿什福特、奥斯威尔·E·斯宾塞和詹姆斯·马库斯共同成立了跨国企业安布雷拉公司。表面上，这是一家制药公司，但实际上却秘密进行病毒的研究和开发。其中，马库斯也参与了T病毒的一系列研究。然而，随着爱德华逐渐忽略公司事务，斯宾塞逐渐掌握了安布雷拉的大权，并开始着手准备一项以威斯克命名的秘密计划。
同年，斯宾塞说服爱德华对浣熊市的公共电车设施进行了投资，从而与迈克尔·沃伦结下了“友谊”。由于找不到稳定病毒的方法，斯宾塞决定武力侵占非洲原始部落尼恩迪拜亚的领地，以夺取生长有始祖花的地区。他制止了马库斯前往非洲的研究计划，转而让他担任尚未修建完成的干部养成所的所长。而布兰登则只得只身前往非洲，负责提取始祖病毒并寄回给马库斯进行后续研究。
随着时间的推移，安布雷拉公司在斯宾塞的领导下逐渐壮大，并在全球范围内建立了多个研究所和设施。然而，这一切的背后都隐藏着对始祖病毒和T病毒的深入研究与开发。而这一切的起点，正是那座位于浣熊市阿克雷山区的洋馆。
1968年，马库斯与研究主任布兰登在始祖病毒的研究上遭遇了重大瓶颈，由于实验材料耗尽，他们决定多次前往非洲寻找始祖花。然而，在多次遭遇恩迪拜亚部落的攻击后，斯宾塞决定采取行动，武力侵占该部落领地，并在此修建非洲研究所。同时，他制止了马库斯前往非洲的计划，转而让他担任浣熊市郊区干部养成所的所长。同年，爱德华·亚西福特意外去世，其子亚历山大继承了亚西福特家族，成为第六代家主。
1969年，美国政府投资建造了浣熊市的地铁、小型火车站和飞机场，成为城市发展的转折点。与此同时，亚历山大开始筹划修建南极研究所，并为“代号:维罗妮卡”计划在地下秘密修建了一个研究中心。同年，安布雷拉公司非洲研究所和南极基地及其地下秘密研究所相继竣工。
1970年，亚历山大在得到英美等国的支持下，开始转向遗传基因方面的研究。他利用遗传学技术，发现了人体基因中隐藏的“控制智商的钥匙”，并制造出了阿尔弗雷德·亚西福特和阿莱克西亚·亚西福特兄妹，这项研究计划被命名为“代号:维罗妮卡”。
维罗妮卡阿什福德
在接下来的几年里，安布雷拉公司在世界各地陆续建造秘密研究所，进行基于始祖病毒和T病毒的各种生化兵器的开发。这些研究所的活体实验对象大多来自贫民区或监狱的死刑犯。
1976年，马库斯出任浣熊地区阿克雷研究所以及新建干部养成所的负责人，开始秘密研究新病毒。1977年，他和威廉·柏金、阿尔伯特·威斯克等人一起，在干部养成所进行了大量的病毒实验。马库斯在实验中创造出了新的菌株，并决定将其与始祖病毒结合，形成了T病毒。
然而，马库斯的研究也引起了斯宾塞的警惕。1978年，斯宾塞派人监视马库斯的一举一动，并发现了他在干部养成所进行的人体实验。同年，马库斯在实验中遭遇了重大突破，但也被斯宾塞等人发现。在董事会议上，斯宾塞揭露了马库斯滥用职权的事实，导致他被取消了在阿克雷研究所的研究主任职务。
尽管马库斯拒绝公司的调任，但斯宾塞仍然决定关闭干部养成所。在关闭前夜，马库斯在实验室中被U.S.S.特种部队开枪击毙，但他的尸体被威斯克和威廉扔进了蓄水池。在长达十年的时间里，马库斯体内的水蛭病毒使他处于生命体征微弱的假死状态，并逐渐恢复。
与此同时，威廉·柏金和威斯克接管了T病毒的研究。威廉一直致力于研究非洲出现的伊波拉病毒的新变种，并将其与始祖病毒结合，形成了更广泛的“T病毒计划”。他们在一个女性实验体内进行了各种T病毒的实验，为后续的生化危机埋下了伏笔。
安布雷拉公司的兴衰与浣熊市的变迁
1980年，安布雷拉非洲研究所成功培育出了可脱离西非太阳花园遗迹土壤而存在的始祖病毒个体，这一突破性的成果为后续的病毒研究奠定了基础。斯宾塞作为公司的管理者，对病毒研究实施了严密的管理制度，包括情报加密、人事调动控制等，以确保研究的秘密性和安全性。
同年夏天，年仅10岁的天才少女阿莱克西亚·亚西福特以第一名的成绩从名牌大学毕业，并因其对生命的漠视和坚定的社会工具论思想而备受关注。1981年7月27日，阿莱克西亚以主任研究员的身份被分配到南极研究所，这一任命让同为主任研究员的威廉·柏金倍感压力。在接下来的几年里，T病毒研制完成，能够感染大部分人成为丧尸，但也有10%的人可以免疫。然而，斯宾塞并不满足于此，他要求开发一种能够毁灭所有人的独立生物武器，这一要求几乎无人知晓。
1983年，阿莱克西亚通过特殊方法将始祖病毒与蚁后基因相结合，成功制造出“veronica-virus”病毒，并在阿尔弗雷德的帮助下将其植入父亲亚力山大的体内。然而，人体实验宣告失败，亚历山大最终变为危险的怪物，被监禁于南极运输基地的地下单人牢房中。阿莱克西亚为了掌握病毒的潜力，决定将其植入自己体内，并利用冷冻方式延缓病毒变异造成的智力退化，从此进入长达十多年的沉睡。
在阿莱克西亚沉睡期间，威廉·柏金逐渐崭露头角，成为安布雷拉病毒研究的权威，并与研究员安妮特结婚，生下了雪莉。与此同时，浣熊市在迈克尔·沃伦的领导下与安布雷拉建立了紧密的关系，城市居民半数为安布雷拉所雇佣，安布雷拉在该市拥有许多销售门市和主要发言权。
1988年，带有攻击意识的战斗生物体“tyrant(暴君)”被创造出来，但研究遇到了困难，因为绝大多数人在和病毒融合时脑细胞会迅速衰竭，不能保证有一定的智力。为了解决这个问题，威廉·柏金开始研究G病毒，这一病毒是在一个女性实验体内分离出来的，具有自发变异的能力。
与此同时，威斯克开始思考研究以外的问题，他对于斯宾塞的想法感到困惑，并开始寻找机会脱离安布雷拉。1991年，威斯克成功进入浣熊市警局卧底，以探知斯宾塞的真正意图。
1992年，安布雷拉在浣熊市地下建造了巨大的研究所，并开始出资修建市政府大楼和医院总部等基础设施。在安布雷拉的经济援助之下，浣熊市发展迅速，但同时也开始时常出现人口失踪事件，这些失踪人口皆为安布雷拉所绑架并用于活体研究。
1993年，阿尔弗雷德出任洛克福特岛Rockford军事训练所司令和南极研究所所长，并开始了对veronica的研究的终止。同年，浣熊市警察局署长布莱恩·艾隆斯开始收受安布雷拉的大量贿赂，帮助其掩盖不道德行为。
1996年，由安布雷拉投资的“光明浣熊21世纪”计划正式开始实行，浣熊市足球队成立并建造了体育场。同时，一度陷入危机的特殊战术及救援特勤部队S.T.A.R.S.在浣熊市开始招募队员，由威斯克领导。然而，随着工业污染的日益严重，环保主义者与政府之间的矛盾也愈发激烈。
1997年夏天，浣熊市实际上已成为安布雷拉制药公司的附庸，城市的大部分属于安布雷拉的研究设施，经济完全依靠安布雷拉。然而，在这一切的背后，隐藏着安布雷拉公司对于生物武器的极端追求和对于人类生命的漠视。随着故事的深入，我们将会看到这些追求和漠视所带来的后果以及人类对于生命和道德的坚守与反思。
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