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在《对马之魂》的特定任务或是地点会触发对决，镜井仁会和对手进行 1v1 的战斗，此时仁不能使用弓箭、苦无等辅助道具，只能使用武士刀。在所有对决战斗中获胜可以获得奖杯，以下是游戏中出现的所有对决战斗的位置：
主线对决
赫通汗（主线，必败对决）
龙三（主线）
铁木哥（主线：遣川战鬼）
龙三（主线：来自黑暗）
赫通汗（主线：永恒苍穹）
志村大人（主线：志村大人的故事）
大型据点对决
将领多加尔（严原的营地：解放小川道场）
巴尔图大将（上县蒙古人的大营地）
道格辛大将（上县蒙古人的大营地）
对马岛故事中的对决
将领春典（支线：未竟之事）
仁六（支线：荣誉的背后）
实时（支线：无辜盗贼）
阿勒坦（结奈支线）
政子（政子支线）
传说故事的对决
枫（传说：忠赖的传说）
古贺泰平（传说：天之一刀）
天狗（传说：内经的诅咒）
别头丸（传说：长明之焰）
遣川怨灵（传说：遣川的复仇怨灵）
康正（问号：深陷泥沼的决斗）
广常（问号：在彼岸花中决斗）
清亲（问号：瀑布之下的决斗）
友次（问号：狂涛海浪的的决斗）
兼友（问号：秋叶之下的决斗）
小次郎（传说：小次郎的六把刀）
