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《对马之魂》的地图中隐藏着一些神秘神龛，这些神龛旁边都会有一个鞠躬的牌子，操纵镜井仁在这些神龛前鞠躬，会出现大量的动物。在游戏中参拜十个隐藏神龛可以拿到奖杯，并拿到染料「超然战鬼」，以下是目前我们找到的十个隐藏神龛位置：
严原
红蜻蜓神龛
坚根森林东北方向狐狸巢穴的东面有一个蒙古人营地，高台上能发现红蜻蜓神龛。
螃蟹神龛
金田小湾北面荣誉之柱为螃蟹神龛。
蝴蝶神龛
代市路口边上有一片墓地，鸟居过去能找到一个蝴蝶神龛。
花神龛
方连牧场北面「忠赖安息之所」能找到花神龛，在完成传说任务时会到达此地。
鸟神龛
小松的铁匠铺传送点东边走 70 米就能发现。
丰玉
青蛙神龛
翠山神社门口能找到一处青蛙神龛。
螃蟹神龛
金田城西北方向的海滩上面朝大海能发现螃蟹神龛。
鱼神龛
青海村青海湖，境井家枫叶决斗场湖边有鱼神龛。
蜻蜓神龛
旧金泽沼泽西南方向的荣誉之柱为蜻蜓神龛。
青蛙神龛
云山神社通过「狂涛海浪的决斗」地点后，会有青蛙神龛。
