《遺蹟：灰燼重生》在最近要迎來自己的續作（豪華版已經可以遊玩了）。作為一個類魂遊戲，遊戲的故事劇情大多都隱藏在物品描述、筆記和 NPC 對話之中，但是不得不說《遺蹟：灰燼重生》確實構建了一個非常吸引人的世界觀，我們也就從各方面來聊一聊《遺蹟：灰燼重生》的故事。
1968年的6月人來迎來了一場毀滅性的災難，致命的異界生物入侵地球。而這一切的開端都是因為人類的頂級軍事科學家發現了異界的文字和一個後來被稱為“世界石”的紅色石頭。人類科學家破解了外星人的文字，並從留下的文字之中瞭解到，人類可以和“世界石”鏈接，並能夠通過這種方法訪問其他的世界。而這些能夠鏈接其他世界的人被稱為夢遊者。
一般來說，想要訪問或者說鏈接其他世界有兩種方法，一種是找到根曼之母所說的不存在之塔進入迷宮來進行世界旅行，另外一種就是通過紅色石頭“世界石”。鏈接也分為精神上和物理上的。但是大體就是這兩種方法。
在遊戲中各位注意劇情的話也能瞭解到，這個不存在之塔和迷宮都是在地球上的。見到迷宮守護者，也能從迷宮守護者嘴裡知道，地球這個地方是特殊的是整個世界的核心，迷宮是地球的核心。因此地球沒有守護生物。
說完了一些設定，我們來聊一聊整個故事的時間線。在1960年美國軍方在海島環礁區發現了奇怪的紅色水晶跟一些神秘建築，軍方懷疑這些東西跟地外生命有關，就開始讓內維爾司令對這些東西進行研究。在研究的過程中除了一個人能夠理解水晶上的文字以外，其他人都無法理解。而這個人就是尤里克哈斯加德。
哈斯加德後來發現那些銘文並不是自己能夠讀懂，而是符文主動跟他交流讓他理解其中的意思。這些符文給他講述了一個高度發達，平靜祥和沒有爭鬥的世界。在當時冷戰的背景下，這種世界無疑讓哈斯加德非常向往，這也讓他產生了迫切的同爪骨（符文創造者）交流的願望。
因為能夠讀懂異界符文，哈斯加德也就被內維爾司令任命為了整個項目負責人。哈斯加德就開始在環礁建立Wrad prime設施也就是實驗區，同時把二戰的戰爭孤兒拉到實驗區開始進行世界連接的實驗。實驗區到底有多少個並不清楚，遊戲裡最多是提到了十七號實驗區，遊戲裡我們的基地十三號實驗區是世界石存放地和所有實驗區的供電中心。
哈斯加德通過特殊設備將人和世界石鏈接起來，然後能夠通過一些手段將實驗體看到的景象放出來。但是早期的實驗並不順利二號實驗區實的驗體在實驗室搞了一波大屠殺，一號試驗區是人人都發瘋，三號實驗室則是發生了火災。主實驗室還在火災錄像裡看到了火龍的虛影（這個火龍不是遊戲裡那個火龍！是骨爪！雖然遊戲裡模型是一樣的）。
哈斯加德這時候也覺得實驗室不對勁，他封鎖了一號實驗區對外宣稱是一號實驗室發生了瘟疫。與此同時取得了布魯納博士的筆記。然後他覺得實驗失敗的原因是這群實驗體的精神不夠堅韌，無法承載爪骨的信息，而他自己是天選之子能夠擔當此任。時間到了1964年，十七號實驗區的第2409號實驗體能夠同其他世界產生了聯繫。這邊有了進步，哈斯加德就去十三號實驗區研究世界之石。
十三號實驗區同時存在過3名夢遊者。2923號實驗體克萊門汀，2419號實驗體加百列，以及加百列死亡後補上的2419-1號實驗體卡索，實驗中瞭解到夢遊者能夠通過世界之石聯繫到其他世界的守護生物，並在他們身上對其他世界進行觀察。但是如果其他世界的守護生物一旦死亡，夢遊者也會隨之死亡。2419號實驗體加百列就是如此死亡的，2419-1號實驗體卡索則是為了弄清為什麼重新連入到了毛怪的世界，2923號實驗體連接到了一個名叫萊森的冰原世界。
2419-1號實驗體重新連入2419號的世界。發現世界已經被一種不是本地的植物生命入侵，研究人員命名為根蔓，2419-1號實驗體卡薩變為了和根曼入侵的紐帶，絕望的研究人員在被根蔓包圍前殺死了實驗體，撤出了13號實驗區。但是主實驗區也出了事故，主實驗區萊託博士用射線轟擊世界之石進行實驗，世界之石崩潰後出現了一個蟲洞，連通了正被根蔓侵蝕的萊森冰原世界，根曼和當地氏族都對地球展開了入侵。
十七號實驗區2409號夢遊者也出現相同異常，實驗室被封鎖。根曼開始入侵地球，人類的軍隊無法阻止根曼的入侵，整個地球很快就淪陷了。存活的人類去到了偏遠的島嶼上生存，大約一個世紀後，一個年輕的冒險家只帶著一把劍和一把木盾從一個偏僻的島嶼出發，開始尋找環焦。（這部分就是遺蹟前作的故事了）
年輕的冒險者進入了迷宮，殺死了眾多迷宮中的生物，見到了高塔中的巨龍，費勁千辛萬苦勇者大敗了巨龍，但是他不知道這是陰謀，哈斯加德接受了爪骨的傳銷，殺掉了屠龍歸來的勇者，自己成為了新的爪骨，新的根曼代言人。
上一個勇者擊殺了巨龍，但是根曼入侵並沒有停止。所以需要有人去塔裡看看情況，探尋為什麼根曼沒有消失，我們的主角也就這樣駕著小船出發了，但是在前往燈塔的路上遭遇巨大海浪，幸運的是主角被送到了十三號實驗所附近。面對根曼攻擊的時候被十三號實驗區的人們所救，從司令員艾倫口中可以得知大概時間點，我們到達十三區的時間也就比上一個勇者晚上一個月左右。
艾倫司令瞭解到我們的目標，告訴我們想要去燈塔，必須找到創始人福特，只有福特才知道去燈塔的路。創始人福特是從環礁上的16號實驗區逃出來的軍事人員。另外一個從哪裡逃出來的是根蔓之母，也就是現任司令員艾倫的祖母伊芙琳上尉。在逃離實驗區後，兩人日久生情，一塊生了個小女孩。小女孩長大後生下了現任司令員艾倫。
老福特本人是有夢遊者天賦的，他也能夠跟世界之石產生聯繫，他也憑此在實驗區外進行探索尋找迷宮和阻止根曼的方法，他找他了高塔，瞭解到沙漠洛姆，知道了洛姆統治者不滅之王消滅了根曼的方法，但是不滅之王並不待見他，派人追殺他。福特因此逃去了沼澤，但是並不能從女王手裡瞭解到有用的信息，最後他前往了耶莎，並在那裡遇到了納文。
納文發現福特受傷後治癒了福特。並幫助福特回到迷宮。此後，福特多次返回耶莎以幫助她反抗女皇。最後一次旅行，福特找到納文，表示他想留下來生活，並幫助叛軍戰鬥。兩人就此成為了密友。福特後來被捕成為抓捕納文的誘餌。
主角解救了根曼之母，從根曼之母處瞭解到如何前往迷宮，費勁千辛萬苦找到了迷宮守護者。迷宮守護者告訴你根蔓會派出吞噬者來殺死並吸收守衛，而他是最後一個守護者。前作Chronos中2409號實驗體殺了不少迷宮首位，這也就給根曼入侵鋪好了路！
穿越迷宮來到了沙漠洛姆，找到不滅之王從不滅之王口中瞭解到，沙漠也曾被根曼入侵，他用核手段處理掉了根曼，而他現在需要另一個世界守護生物的心臟來恢復他們世界的守護生物，來保護他們自己的世界。我們藉助不滅之王的通道，前往沼澤科尓蘇斯，見到了昆蟲女王，昆蟲女王也希望你幫她拿到怪獸的心臟。
伊斯卡爾沼澤實際上很有意思，這個世界並沒有被根曼入侵，而是女皇的族群在統治這裡，甚至整個村整個村的人民被伊斯卡爾女王洗腦，變成維斯蟲的寄生對象，甚至女王覺得他們可以同化根曼。
我們可以將守護心臟交給不滅之王或者昆蟲女王，遊戲中會給不同武器，但是劇情並不太影響。然後我們可以前往森林耶莎。森林耶莎此時是內憂外患，因為先代勇者幹掉了沙耶的守護生物沙耶此時也受到了根曼的入侵，而且還受到了內戰的影響。內戰的原因主要是因為女皇的通知。耶莎的女皇在很久之前發現了生命之樹，通過樹上的果子獲得了無限的壽命，然後靠分發這些果子建立了統治。一段時間後生命之樹枯萎，女王也無法向貴族們提供果子。但是女王將原因歸咎於盜竊，將這莫須有的罪名加到一個不知名的村落裡，侍衛隊長納文看不過決定反叛女皇。
主角找到了福特， 明白瞭如何前往環焦，十三號實驗區地下能夠前往環焦的十七號實驗區，在那裡見到了夢遊者，夢遊者告訴主角這一切都是徒勞，無論重複幾次他們依然無法阻止根曼，當然身為主角的我們肯定不會因為嘴炮而屈服，殺死了根蔓的吞噬者——2409號試驗體，這次哈斯加德沒有出現。打破了鏈接之後，根蔓的入侵明顯緩慢下來。但是想要終止根蔓的入侵，必須前往主實驗區。主角決定前往主實驗區找尋地球和根曼最後的鏈接。
主實驗區的怪物感覺比較像寂靜嶺表裡世界的樣子，但是具體為什麼這個樣子劇情裡都沒有交代，個人推測應該是精神世界和物質世界這種樣子。在主實驗區打碎根蔓之心後，會出現一條前往雪原世界萊森的路。進入萊森之後見到了一個神秘的女人。
追上這個女人，我們在這個女人嘴裡知道他就是曾經的實驗體克萊門汀，她自己是被萊森的守護生物所救，自己並不想管地球的死活， 那與他無關。但是根曼在此時對萊森產生了影響，這讓克萊門汀明白，如果部組織根曼，所有的世界最終都會遭殃，他決定幫助主角回到實驗室找到哈斯加德。
哈斯加德被根曼同化成了新的爪骨，地球上一部分根曼怪物就是由他創造的，可以說地球被根蔓入侵他就是罪魁禍首，但不知道為什麼最後根蔓還是拋棄了哈斯加德。哈斯加德就此隕落，地球上的根蔓也開始消逝，第一部的故事也就到此結束了。