《遗迹：灰烬重生》在最近要迎来自己的续作（豪华版已经可以游玩了）。作为一个类魂游戏，游戏的故事剧情大多都隐藏在物品描述、笔记和 NPC 对话之中，但是不得不说《遗迹：灰烬重生》确实构建了一个非常吸引人的世界观，我们也就从各方面来聊一聊《遗迹：灰烬重生》的故事。
1968年的6月人来迎来了一场毁灭性的灾难，致命的异界生物入侵地球。而这一切的开端都是因为人类的顶级军事科学家发现了异界的文字和一个后来被称为“世界石”的红色石头。人类科学家破解了外星人的文字，并从留下的文字之中了解到，人类可以和“世界石”链接，并能够通过这种方法访问其他的世界。而这些能够链接其他世界的人被称为梦游者。
一般来说，想要访问或者说链接其他世界有两种方法，一种是找到根曼之母所说的不存在之塔进入迷宫来进行世界旅行，另外一种就是通过红色石头“世界石”。链接也分为精神上和物理上的。但是大体就是这两种方法。
在游戏中各位注意剧情的话也能了解到，这个不存在之塔和迷宫都是在地球上的。见到迷宫守护者，也能从迷宫守护者嘴里知道，地球这个地方是特殊的是整个世界的核心，迷宫是地球的核心。因此地球没有守护生物。
说完了一些设定，我们来聊一聊整个故事的时间线。在1960年美国军方在海岛环礁区发现了奇怪的红色水晶跟一些神秘建筑，军方怀疑这些东西跟地外生命有关，就开始让内维尔司令对这些东西进行研究。在研究的过程中除了一个人能够理解水晶上的文字以外，其他人都无法理解。而这个人就是尤里克哈斯加德。
哈斯加德后来发现那些铭文并不是自己能够读懂，而是符文主动跟他交流让他理解其中的意思。这些符文给他讲述了一个高度发达，平静祥和没有争斗的世界。在当时冷战的背景下，这种世界无疑让哈斯加德非常向往，这也让他产生了迫切的同爪骨（符文创造者）交流的愿望。
因为能够读懂异界符文，哈斯加德也就被内维尔司令任命为了整个项目负责人。哈斯加德就开始在环礁建立Wrad prime设施也就是实验区，同时把二战的战争孤儿拉到实验区开始进行世界连接的实验。实验区到底有多少个并不清楚，游戏里最多是提到了十七号实验区，游戏里我们的基地十三号实验区是世界石存放地和所有实验区的供电中心。
哈斯加德通过特殊设备将人和世界石链接起来，然后能够通过一些手段将实验体看到的景象放出来。但是早期的实验并不顺利二号实验区实的验体在实验室搞了一波大屠杀，一号试验区是人人都发疯，三号实验室则是发生了火灾。主实验室还在火灾录像里看到了火龙的虚影（这个火龙不是游戏里那个火龙！是骨爪！虽然游戏里模型是一样的）。
哈斯加德这时候也觉得实验室不对劲，他封锁了一号实验区对外宣称是一号实验室发生了瘟疫。与此同时取得了布鲁纳博士的笔记。然后他觉得实验失败的原因是这群实验体的精神不够坚韧，无法承载爪骨的信息，而他自己是天选之子能够担当此任。时间到了1964年，十七号实验区的第2409号实验体能够同其他世界产生了联系。这边有了进步，哈斯加德就去十三号实验区研究世界之石。
十三号实验区同时存在过3名梦游者。2923号实验体克莱门汀，2419号实验体加百列，以及加百列死亡后补上的2419-1号实验体卡索，实验中了解到梦游者能够通过世界之石联系到其他世界的守护生物，并在他们身上对其他世界进行观察。但是如果其他世界的守护生物一旦死亡，梦游者也会随之死亡。2419号实验体加百列就是如此死亡的，2419-1号实验体卡索则是为了弄清为什么重新连入到了毛怪的世界，2923号实验体连接到了一个名叫莱森的冰原世界。
2419-1号实验体重新连入2419号的世界。发现世界已经被一种不是本地的植物生命入侵，研究人员命名为根蔓，2419-1号实验体卡萨变为了和根曼入侵的纽带，绝望的研究人员在被根蔓包围前杀死了实验体，撤出了13号实验区。但是主实验区也出了事故，主实验区莱托博士用射线轰击世界之石进行实验，世界之石崩溃后出现了一个虫洞，连通了正被根蔓侵蚀的莱森冰原世界，根曼和当地氏族都对地球展开了入侵。
十七号实验区2409号梦游者也出现相同异常，实验室被封锁。根曼开始入侵地球，人类的军队无法阻止根曼的入侵，整个地球很快就沦陷了。存活的人类去到了偏远的岛屿上生存，大约一个世纪后，一个年轻的冒险家只带着一把剑和一把木盾从一个偏僻的岛屿出发，开始寻找环焦。（这部分就是遗迹前作的故事了）
年轻的冒险者进入了迷宫，杀死了众多迷宫中的生物，见到了高塔中的巨龙，费劲千辛万苦勇者大败了巨龙，但是他不知道这是阴谋，哈斯加德接受了爪骨的传销，杀掉了屠龙归来的勇者，自己成为了新的爪骨，新的根曼代言人。
上一个勇者击杀了巨龙，但是根曼入侵并没有停止。所以需要有人去塔里看看情况，探寻为什么根曼没有消失，我们的主角也就这样驾着小船出发了，但是在前往灯塔的路上遭遇巨大海浪，幸运的是主角被送到了十三号实验所附近。面对根曼攻击的时候被十三号实验区的人们所救，从司令员艾伦口中可以得知大概时间点，我们到达十三区的时间也就比上一个勇者晚上一个月左右。
艾伦司令了解到我们的目标，告诉我们想要去灯塔，必须找到创始人福特，只有福特才知道去灯塔的路。创始人福特是从环礁上的16号实验区逃出来的军事人员。另外一个从哪里逃出来的是根蔓之母，也就是现任司令员艾伦的祖母伊芙琳上尉。在逃离实验区后，两人日久生情，一块生了个小女孩。小女孩长大后生下了现任司令员艾伦。
老福特本人是有梦游者天赋的，他也能够跟世界之石产生联系，他也凭此在实验区外进行探索寻找迷宫和阻止根曼的方法，他找他了高塔，了解到沙漠洛姆，知道了洛姆统治者不灭之王消灭了根曼的方法，但是不灭之王并不待见他，派人追杀他。福特因此逃去了沼泽，但是并不能从女王手里了解到有用的信息，最后他前往了耶莎，并在那里遇到了纳文。
纳文发现福特受伤后治愈了福特。并帮助福特回到迷宫。此后，福特多次返回耶莎以帮助她反抗女皇。最后一次旅行，福特找到纳文，表示他想留下来生活，并帮助叛军战斗。两人就此成为了密友。福特后来被捕成为抓捕纳文的诱饵。
主角解救了根曼之母，从根曼之母处了解到如何前往迷宫，费劲千辛万苦找到了迷宫守护者。迷宫守护者告诉你根蔓会派出吞噬者来杀死并吸收守卫，而他是最后一个守护者。前作Chronos中2409号实验体杀了不少迷宫首位，这也就给根曼入侵铺好了路！
穿越迷宫来到了沙漠洛姆，找到不灭之王从不灭之王口中了解到，沙漠也曾被根曼入侵，他用核手段处理掉了根曼，而他现在需要另一个世界守护生物的心脏来恢复他们世界的守护生物，来保护他们自己的世界。我们借助不灭之王的通道，前往沼泽科尓苏斯，见到了昆虫女王，昆虫女王也希望你帮她拿到怪兽的心脏。
伊斯卡尔沼泽实际上很有意思，这个世界并没有被根曼入侵，而是女皇的族群在统治这里，甚至整个村整个村的人民被伊斯卡尔女王洗脑，变成维斯虫的寄生对象，甚至女王觉得他们可以同化根曼。
我们可以将守护心脏交给不灭之王或者昆虫女王，游戏中会给不同武器，但是剧情并不太影响。然后我们可以前往森林耶莎。森林耶莎此时是内忧外患，因为先代勇者干掉了沙耶的守护生物沙耶此时也受到了根曼的入侵，而且还受到了内战的影响。内战的原因主要是因为女皇的通知。耶莎的女皇在很久之前发现了生命之树，通过树上的果子获得了无限的寿命，然后靠分发这些果子建立了统治。一段时间后生命之树枯萎，女王也无法向贵族们提供果子。但是女王将原因归咎于盗窃，将这莫须有的罪名加到一个不知名的村落里，侍卫队长纳文看不过决定反叛女皇。
主角找到了福特， 明白了如何前往环焦，十三号实验区地下能够前往环焦的十七号实验区，在那里见到了梦游者，梦游者告诉主角这一切都是徒劳，无论重复几次他们依然无法阻止根曼，当然身为主角的我们肯定不会因为嘴炮而屈服，杀死了根蔓的吞噬者——2409号试验体，这次哈斯加德没有出现。打破了链接之后，根蔓的入侵明显缓慢下来。但是想要终止根蔓的入侵，必须前往主实验区。主角决定前往主实验区找寻地球和根曼最后的链接。
主实验区的怪物感觉比较像寂静岭表里世界的样子，但是具体为什么这个样子剧情里都没有交代，个人推测应该是精神世界和物质世界这种样子。在主实验区打碎根蔓之心后，会出现一条前往雪原世界莱森的路。进入莱森之后见到了一个神秘的女人。
追上这个女人，我们在这个女人嘴里知道他就是曾经的实验体克莱门汀，她自己是被莱森的守护生物所救，自己并不想管地球的死活， 那与他无关。但是根曼在此时对莱森产生了影响，这让克莱门汀明白，如果部组织根曼，所有的世界最终都会遭殃，他决定帮助主角回到实验室找到哈斯加德。
哈斯加德被根曼同化成了新的爪骨，地球上一部分根曼怪物就是由他创造的，可以说地球被根蔓入侵他就是罪魁祸首，但不知道为什么最后根蔓还是抛弃了哈斯加德。哈斯加德就此陨落，地球上的根蔓也开始消逝，第一部的故事也就到此结束了。