一、故事背景
1、主權殖民地聯盟
21世紀初隨著地球環境逐漸惡化、化石能源進一步短缺，各國開始因搶奪資源大打出手，其中美俄兩國之間爆發了“第二次冷戰”，進而引起了“白令海戰爭”，白令海戰爭是第二次世界大戰之後規模最大的衝突戰爭。又因為美國一艘裝滿物資的貨輪闖入俄羅斯的領海喀拉海峽時被非法扣押，俄羅斯扣押了船上的全部人員和物資，國際社會上對此表示出極大的憤怒，隨後美國再次出兵白令海峽，發動了“第二次白令海戰爭”。連年的戰爭讓底層民眾流離失所，不得不背井離鄉開始尋找新家園。
美俄爭霸
與此同時，全球變暖導致的海平面上升，淹沒了紐約、悉尼、威尼斯等大量沿海城市，數以億計的難民開始向內陸城市遷移，使得生存資源和空間進一步地壓縮，此時國與國之間的傳統關係無法再正常維持，人類迫切地需要一個新的政權來結束這一切。不久之後，由斯堪的納維亞地區、北美地區、中美地區、南美地區、北亞地區、泛亞地區、泛歐洲區、非洲地區在內的八個地區的政府首腦聯合組建了一個新的政府——主權殖民地聯盟（舊地球政府，下文以聯盟代稱）。為了解決人類的能源問題，聯盟開始向太空深處探索。
電影《後天》
主權殖民地聯盟的藍色標誌
聯盟政府在任期間採取獨裁政策，任何不利於政府的言論都會受到嚴格的管控，並且聯盟政府通過強制徵稅來太空作業提供資金，欺騙民眾太空生活的“好處”用來招募前往太空的工作人員。長期以往使得民眾怨聲載道，於是一些有志之士準備發動政變，準備發動一場名為“分裂戰爭”的武裝運動。
2、分裂戰爭
由於聯盟政府的極端統治，最終導致了分裂戰爭的爆發。2289年，分裂分子佔領了聯盟政府位於火星上的殖民地，標誌著聯盟政府和分裂分子全面開戰。往後的5年間，聯盟政府一面在與分裂分子的戰爭中節節敗退，另一方面又在秘密複製黑色神印，企圖利用神印的無限資源作為戰爭的翻盤點，終於在2290年通過逆向仿製技術成功做出了紅色神印（Maker 1A），隨後又複製出了Marker 2A和Marker 3A總共三個神印，並且分別將它們投放到阿斯佩拉星、克里蒙星和神盾7號三顆星球上。
黑色神印和三個複製神印
位於神盾7號的紅色神印Maker 3A
研究人員通過對死亡的表皮細胞實驗發現，在紅色神印的影響下，這些原本已經死亡的細胞開始融合分裂，以驚人的速度進行成長。並且在神印的周圍有一圈類似於力場的作用範圍，它可以有效地阻止細胞的分裂速度，並使其進入休眠狀態，研究人員將這個範圍稱之為“死亡空間”。然而聯盟政府複製的神印全部都是失敗品，其中紅色神印1A只能把屍體轉化為屍變體。
艾薩克繪製的神印草圖
2311年，聯盟政府通過托勒密陣列發現了冰凍星球塔弗蘭提斯的黑色神印信號源，希望此地可以找到黑色神印無限能量的來源，這點將會幫助聯盟政府在分裂戰爭中扭轉頹勢，於是聯盟政府孤注一擲，派出了以新星號為首的遠征艦隊前往冰凍星球“塔弗蘭提斯”。在塔弗蘭提斯星上，塞拉諾博士發現了整顆星球的真相。在3年後，為了研究資料不被叛亂分子奪取以及防止神印的影響擴散到地球，聯盟陸軍少將斯賓塞·馬哈德啟動了“5號預案”，將列兵緹姆殺死後銷燬掉了“譯碼器”和全部的相關資料，隨後他對著聯盟政府的標誌敬禮後吞強自殺，馬哈德將軍這一偉大的舉動成功地使地球延續了兩百多年的時間。跟隨馬哈德將軍生命一同消失的還有聯盟政府。2314年，聯盟政府宣告正式垮臺，取而代之的是新政府——殖民地聯合地球政府（新地球政府，下文以地球政府代稱）。
新星號
斯賓塞·馬哈德將軍
3、資源戰爭、石村號
地球政府上臺後，除了日常的行政、治安、貿易管控以外，還組建了一支名為“地球防衛軍”（EDF）的軍隊，負責地球和其殖民地的防禦工作和交通管制工作。新政府旨在消除區域衝突、幫助人類尋找新的能源代替品，並且提出了“好事正在發生”的口號。
地球政府
然而資源短缺的問題依然在影響著人類的生存，太空的探索並沒有讓人類的處境有所好轉，相反由於資源消耗的速度遠超過開採的速度，從而進一步加劇了資源戰爭的爆發。2446年，由地球上最大的能源公司——協和採礦公司（CEC）研發並投入使用的第一艘“行星級裂解艦”——石村號，其工作原理是將船上的重力鎖投放到事先安置好對接裝置的行星上，再利用扭曲重力場的原理將這一區域直接從星球上連根拔起，最後送回裂解空間站進行分解。由於石村號出色的裂解效率使得資源戰爭很快走向了結束。
石村號裂解星球
4、黑色神印、邁克爾·阿爾特曼
6500萬年之前，黑色神印撞向地球的尤卡坦半島，造成了恐龍及絕大部分動植物的滅絕，形成了著名的“希克蘇魯伯隕石坑”，而哺乳類動物與鳥類則存活下來，在黑色神印輻射的影響下，人類成為了由猿猴演化而來的優勢物種。
黑色神印
2214年，由於女友艾達被調派到希克蘇魯伯隕石坑附近工作，邁克爾·阿爾特曼辭去了研究所內的工作跟隨女友來到隕石坑附近展開研究工作。在此前的研究過程中研究人員發現黑色神印可以向外發射電磁波，並且擁有無限的能量，這對於資源匱乏的地球來說無疑是巨大的誘惑，聯盟政府決定派出一艘潛艇前往該地進行探查，不料潛艇自出發後再無音訊，此項目被聯盟政府列為最高機密項目，並派軍隊駐守此地。
希克蘇魯伯隕石坑
在隕石坑附近工作的日子裡，阿爾特曼經常受到噩夢的干擾，導致他的身體長時間處於疲勞的狀態。某天阿爾特曼在工作中發現隕石坑的信號偵測器出現了異常數據，偵測器顯示隕石坑的地下存在著巨大的能量波動並且存在重力異常的現象，同時他發現附近的海域上經常有打撈船經過，並且附近還有一臺巨型打撈機在工作。在好奇心的驅使下，不等同事將異常狀態彙報給礦業公司總部，他便自行展開了研究。與此同時，在收到異常消息的礦業公司第一時間趕到現場，遣散了包括阿爾特曼在內的所有職員。不甘心自己的研究成果被他人奪去，阿爾特曼偷偷截獲了礦業公司的內部通訊記錄，發現在通訊中有一段詭異的視頻錄像，裡面記錄的是一個渾身赤裸的男人在房間裡喃喃自語，周身畫滿了奇怪的符號，這時阿爾特曼意識到事情可能不止表面上那麼簡單，為了解開心中的謎團，他把這段神秘錄像公佈到了網上，想看看礦業公司的反應。礦業公司在得知此事後，首先說明該男子有嚴重的精神疾病，然後將之前潛艇失蹤事件的責任全部推卸到了該男子的身上，往後礦業公司便可以用打撈潛艇的理由來進行隕石坑的開採及探查工作。
邁克爾·阿爾特曼
隨著錄像的發出，阿爾特曼將自己的研究發現寫成報告儘可能多的發給各大機構，想要通過此舉引起官方部門對於礦業公司的注意，可惜聯盟政府和礦業公司是穿一條褲子的人。很快在某天的清晨，阿爾特曼被幾個闖入家門的神秘人帶走，神秘人將他帶到了迪迦礦業公司（DredgerCorp），原來是那份報告引起了迪迦礦業公司的興趣，把阿爾特曼抓來脅迫他進行相關工作。迪迦礦業公司在海邊建立了一個巨型的海上研究基地，用於隕石坑的挖掘及探查工作。通過此前潛艇事件的分析，迪迦礦業公司認為當潛艇下潛到一定深度的時候，就會受到神秘物質的干擾從而中斷通訊，為了防止此類事故再次發生，迪迦礦業公司每次探查都會派出三艘潛艇，三艘潛艇水平位置相同，垂直方向上高達幾百米，利用潛艇內部的通訊裝置來傳遞信息。
深海潛艇
某次阿爾特曼被選為潛艇駕駛員下潛到深海後，發現與自己一同前來的同事全部出現了精神錯亂的症狀，眼前出現幻象並喃喃自語，渾身因頭痛不受控制地發抖，這一症狀也傳染到了研究基地裡，嚴重者開始攻擊他人並伴有強烈的自殺傾向。阿爾特曼也受到了神印幻象的攻擊，只不過他的精神力遠超於常人，神印把他的幻想對象設定為他已故的母親，母親告訴他，他們正在挖掘的東西是——黑色神印（Black Marker）。經過多次地下海探測後眾人發現，每次跟隨阿爾特曼下海的人都無一例外的瘋掉了，只有阿爾特曼看上去跟沒事一樣，眾人認為是神印選擇阿爾特曼，於是將他奉為神印的“代理人”，阿爾特曼本人對此絲毫不感興趣。
神印標誌
經過不懈的努力，失事潛艇終於被打撈上岸，阿爾特曼趁機從潛艇表面上刮下來一塊紅色物質帶回去研究，研究後發現該物質在電流的刺激下可以快速生長，迅速成長為有機體。另一方面，黑色神印終於被迪迦礦業公司打撈了上來，存放在研究基地的最底層，由於受到神印的影響，讓研究基地裡再次爆發攻擊和自殺事件，死去的人在神印的作用下開始變異，手掌和小臂以一個匪夷所思的角度彎曲著，背部生長出兩個類似於鐮刀的肢體，眼睛凹陷並且面部器官開始退化，渾身佝僂著向前行走。見此情景，阿爾特曼決定逃離此地，他在角落裡撿到了艾薩克同款等離子切割槍，一路殺出了研究基地。
回到家中後阿爾特曼發佈了一段揭露黑色神印的視頻，他在視頻中說道現在地球上已經發現了外星人存在的痕跡，開發神印功能權和使用權應該交給全人類來決定，而不是讓政府和軍方拿去生產更高級的武器來對付我們底層民眾。想到自己的女友被殺害，越想越氣的阿爾特曼再次殺回到海上研究基地裡準備利用自毀裝置摧毀掉整個基地，在摧毀之前他先來到了存放黑色神印的最底層，決定銷燬掉所有相關數據。
黑色神印
當阿爾特曼把手放到神印的一瞬間，腦海裡突然被神印傳輸了大量的信息，他已經和神印建立起了精神上的聯繫，根據神印傳來的信息阿爾特曼瞭解到，神印上的神秘字符正是其DNA序列，也是開啟和關閉神印的關鍵所在，同時神印也向阿爾伯特傳遞了一個重要的信息，複製他。阿爾特曼在記錄下這些字符後，準備前往自毀裝置時被兩名迪迦礦業公司的回收人員抓到，二人將他帶到了公司的審訊室裡，公司高層對其嚴刑拷打逼問有關神印的研究成果。在目睹了研究基地人員屍變化的恐怖事件後，阿爾伯特認為黑色神印太過危險，為了全人類的生存和發展應該被徹底銷燬，即使不能銷燬也要深埋於地下。公司高層在神印的影響下精神已經開始不正常，癲狂地認為神印能為人類帶來源源不斷的能源，利用能源就可以控制住政府和底層百姓。在瞭解到神印給他傳遞的信息後準備開始複製神印，同時阿爾伯特被殘忍地殺害。
阿爾伯特在與神印交流的壁畫
5、統一教
阿爾伯特死後，迪迦礦業公司利用他的人脈和聲望建立一個名為“統一教”的宗教組織，並將他任命為統一教的創始人。在資源匱乏的年代裡，宗教往往擁有比政府階級更可怕的統治力量，在迪迦礦業公司的海上研究基地裡，已經有一批研究人員和公司的中高層被神印同化成了他的信徒。統一教通過宣揚人在死後可以獲得“永生的力量”吸引來了一大批不明真相的信徒，每天都有越來越多的人加入到統一教的隊伍當中，死亡正是統一教的核心思想。統一教禁止使用火化的方式處理遺體，而是將屍體封存起來發射到太空軌道中，有些瘋狂的教徒為了提早地獲得永生的力量而舉辦自殺集會。教義中的“統一、會聚”是指人類的肉體和靈魂都不再作為單一的存在，而是全部融合形成一個整體，等待到合適的時機後利用神印的力量將其復活。
統一教海報
統一教要求所有入會的成員必須全身心地投入到統一教的事業當中，包括個人全部的財產也需要交予教會進行保管，教會內擁有嚴格的等級制度，下級必須嚴格執行上級的命令和指示。同時統一教也在暗中秘密建造“陵墓飛船”，用於將屍體運到位於太空軌道上的“永生殿”裡。
統一教壁畫
6、神盾7號星球
時間來到2508年，隨著教會的勢力逐漸壯大，在某次星際探險時意外地發現了神盾7號這顆偏僻的星球，經過探查後神盾7號擁有豐富的礦物資源，並且人們還在神盾7號上面發現了紅色神印Marker 3A，得知這一消息的教會決定私自裂解神盾7號，提取礦物並保護紅色神印。紅色神印正是聯盟政府時期複製的神印，在神印的影響下神盾7號的人們開始出現幻覺，陸陸續續地有人開始了自殺行為，此時基地裡已經有屍變體（Necromorphs）在活動了。當有人把消息通知給CEC（和諧採礦公司）後，CEC派出石村號前往該地進行救援和行星裂解。
神盾7號全景
CEC（和諧採礦公司）
到達神盾7號後，時任石村號艦長的本傑明·馬修斯在接收了一部分屍體後，秘密決定不再接受新的屍體，等裂解完成後直接返航，並且不顧眾人的反對，執意要將Marker 3A運送到石村號上。留在神盾7號上的工作人員被屍變體群攻至死，一些人則趁機坐上逃生飛船準備逃離此地，有的在起飛階段被屍變體攻擊墜毀，有的在飛往石村號的途中被石村號上的武器擊落。最終只有一架飛船成功地逃進了石村號的下層甲板上，此時駕駛飛船的工程師被藏在暗處裡的蝙蝠怪偷襲轉化成了屍變體，由此石村號變成了一座人間煉獄。
在神盾7號執行裂解任務的石村號
7、塔弗蘭提斯星球、血月
一顆表面被海洋包裹的星球，塔弗蘭提斯星球上環境惡劣，時常遭受暴風雪的襲擊。在200多萬年以前，當地的原住民意外的發現了埋藏在此地的黑色神印，神印通過無限能源的誘惑使得原住民複製了大量的神印，並將它供奉為“神蹟”。然而神印的副作用也在此刻展示出來，和地球上的人類一樣，大部分的外星人在死後變成了屍變體聚集在神印的周圍，隨著屍變體的數量逐漸增多，血月的雛形便漸漸地形成了。為了宇宙中其他文明的生存，當時還未被異化的外星人決定製造一個機器阻止血月的繼續融合，最終他們以種族滅絕作為代價，將血月永遠地冰凍在塔弗蘭提斯上。同時他們將自己的事蹟以壁畫的形式刻在了地下洞穴裡，期望有後來者能發現他們為宇宙和平做出的犧牲。
冰凍的塔弗蘭提斯星球
觀察黑色神印的外星人
當神印到達一個新的星球后，它會先進入休眠狀態，在該星球上的科技能達到一定的水平後激活自身，對外發出電磁信號，利用無限資源作為誘餌讓星球上的生物對它進行復制。當神印產生的屍變體達到一定規模後，所有的屍變體都會被吸入到平流層，在那裡融合成一個類似月亮的巨大屍變體。血月的誕生代表著這個星球已經被消耗殆盡，血月以星球為食，在發現新的有生命痕跡的星球后，它可以通過某種方式聯繫到宇宙中的其他血月，吃完之後它們會繼續在宇宙中飄蕩尋找其他的星球。
血月
二、主線劇情
1、《死亡空間》
在收到石村號發出的求救信息後，CEC派出了小型搜救飛船凱利昂號（USG Kellion）前往救援。救援小隊共有五人組成：CEC工程師——艾薩克·克拉克、美國國防部高級安全官——扎克·哈蒙德、計算機專家（地球政府特工）——肯德拉·丹尼爾斯、飛船駕駛員——陳·艾登、飛船領航員——海利·約翰斯頓。由於石村號上的飛船對接系統早已損壞，陳只能將凱利昂號迫降在石村號上，迫降過程導致凱利昂號左翼發動機完全損毀，一行人通過步行進入到石村號內部。
石村號
當他們進入到休息室內突然遭遇到了屍變體的襲擊，約翰斯頓和陳在襲擊中不幸身亡，艾薩克則被迫與丹尼爾斯和哈蒙德分開。在被屍變體追逐的途中，艾薩克乘坐電梯逃離了屍變體的追捕。隨後他在房間內找到了等離子切割槍，通過RIG和二人取得聯繫後，哈蒙德派遣他去維修凱利昂號的發動機系統，並承諾幫他找到女友妮可·布倫南。當艾薩克返回到迫降地點時，發現凱利昂號在屍變體的攻擊下發生了爆炸，無奈他只能前往休息室內開始修復電車的工作。
妮可·布倫南
由於石村號的操作權限只能由艦長解除，艾薩克來到醫療區正好看見了馬修斯艦長的屍體被異化成屍變體，經過一番戰鬥後擊敗了屍變體的馬修斯艦長，在他身上拿到了ID卡。這時哈蒙德告訴艾薩克需要重啟石村號上的防禦系統，避免隕石塊擊中石村號，處理好防禦系統後肯德拉又告訴艾薩克石村號上的氧氣不多了，應該是水培區的供氧系統遭到了汙染，艾薩克來到水培區擊敗了盤踞在這裡的怪物後恢復了供氧系統。
變成屍變體的馬修斯艦長
在石村號上東奔西跑的艾薩克突然接到了查爾斯·默瑟醫生傳來的錄像，他認為艾薩克現在做的一切都是在違背“上帝的旨意”，並且讓艾薩克趕緊去死，同時放出了自己研究的新型變異體——狩獵者，這種怪物很難用武器直接殺死，艾薩克將一個狩獵怪冰凍住封存在冷凍倉裡，另一個利用穿梭機啟動的尾焰活活燒死。默瑟醫生是一名狂熱的統一教教徒，他認為屍變體是人類死後生命的繼續延續，這一切都是上帝的旨意，同時他還試圖勸說石村號上的其他船員集體自殺，以達到融合的目的。
查爾斯·默瑟
在艾薩克裝好救援定位器後，被附近的政府軍瓦洛尓號截獲到，由於石村號上的通訊系統已經損壞，在瓦洛尓號接到裝有屍變體的逃生艙後未能及時阻止，導致瓦洛尓號也被屍變體感染淪陷，失去控制的瓦洛尓號撞上了石村號。哈蒙德從瓦洛尓號上的重型軍用武器中發現，其實瓦洛尓號的真正目的是來殺死他們並摧毀石村號，讓神盾7號上的秘密永遠也沒人知曉。
為了逃離石村號，他們找到了一搜穿梭機，但是此時穿梭機的引擎早已被損壞，艾薩克在瓦洛尓號上找到驅動引擎回到石村號後，泰倫斯·凱恩博士與他取得了聯繫。凱恩博士博士告訴他這一切的罪魁禍首都是石村號上的神印Marker 3A，通過研究得知神盾7號上的屍變體是由一個名為“首腦”的群巢之主控制著，想要遏制住首腦唯一的辦法就是將神印放回神盾7號的挖掘處。艾薩克將神印放到穿梭機上準備前往神盾7號時，肯德拉從背後偷襲殺死了凱恩博士，原來她是地球政府派來的特工，此行的唯一目的就是回收神印，將其帶回到地球上。眼看穿梭機越來越遠，這時妮可過來提醒艾薩克利用石村號的牽引裝置將穿梭機重新召回到石村號上，肯德拉無奈只能通過逃生艙逃離。
艾薩克和妮可
艾薩克將神印放回神盾7號後，此時肯德拉從背後出現給艾薩克看了一段錄像，錄像裡顯示女友妮可已經自殺身亡，而現在看到的妮可只不過是神印製造出來的幻想，引導艾薩克將神印重新歸還給神盾7號。肯德拉將神印從基座上移除開再次放到了穿梭機裡，憤怒的首腦從地下鑽出來，一巴掌拍死了準備逃跑的肯德拉，經過一番苦戰後成功擊敗首腦。最終艾薩克乘坐穿梭機逃離了神盾7號，神盾7號也因為隕石的撞擊而破裂，在返航的途中，艾薩克看到了屍變體模樣的妮可，隨後陷入了暈迷中。
首腦
2、《死亡空間2》
在太空中漂浮的艾薩克被地球政府巡邏艇發現，將其安置在靜滯艙內並帶回泰坦空間站，回到泰坦空間站的艾薩克被關在泰坦紀念醫療中心的精神病區，被診斷出患有痴呆和創傷後應激障礙。地球政府為了提取他腦海中的神印信息，利用記憶抑制劑來控制他，以至於艾薩克無法記起當初他是如何逃離出石村號的。
飽受幻象折磨的艾薩克
2446年，地球政府為了研究土星上的地震波動，決定在土衛六上建設太空站用於研究和開採礦物，土衛六是環繞土星運行的一顆衛星，是土星衛星中最大的一個，因土衛六又被稱為泰坦星，所以空間站被命名為泰坦空間站。隨著行星破裂變得越來越普及，泰坦空間站由此進入了高速發展的階段，到了26世紀初泰坦空間站人口已經突破了一百萬，並且是一座擁有學校、商場、摩天大樓和統一教教堂的超級大都市。在行星裂解的過程中，它既是一個重要的研究前哨，也是深空採礦作業的中途站。
泰坦空間站
2508年，泰坦空間站泰德曼政府和地球政府合作，秘密開展一項名為“端粒工程”的研究項目，將艾薩克和斯特羅斯大腦中的神印信息提取出來，製造了死亡空間世界觀中最大的神印——12號神印（Marker Site 12）。由於2511年泰坦空間站爆發屍變體感染，為了防止神印的研究資料被統一教截獲，泰德曼下令銷燬一切有關於神印的研究成果，並派出CPD小隊追殺艾薩克等人。
12號神印
此時還在醫療中心的艾薩克在戴安娜的幫助下成功逃了出來，在此期間還遇到了5號病人諾蘭·斯特羅斯，通過交談得知原來這一切災難的源頭都是由神印引起的，想要阻止這一切只有消滅掉政府區裡的神印才行。二人歷經千辛萬苦終於與戴安娜匯合後卻被她的手下抓了起來。原來戴安娜也是統一教的教徒，想要利用艾薩克和斯特羅斯大腦中的神印信息製造神印，當二人被押往穿梭機上時，CPD突然殺了出來將戴安娜和她的手下通通擊斃，艾薩克和斯特羅斯僥倖逃過一劫。
泰坦空間站
在前往政府區的路上艾薩克遇到了一位名叫艾莉女性，她告訴艾薩克自己是CEC的重型設備駕駛員，在利用太陽能陣列重啟了電車的電源後，三人乘著軌道電車前往政府區。為了阻止艾薩克三人消滅神印，泰德曼切斷了前往政府區的道路，隨後艾薩克回到石村號上啟動了重力索，通過乘坐逃生艙到達到政府區的電車車站後發現，斯特羅斯在受到神印長期的影響下，精神已經開始出現不正常的現象，他認為與神印溝通需要艾莉眼球裡的信息，在挖掉了艾莉的一隻眼球后被趕來阻止的艾薩克殺死。他和艾莉通過利用挖掘機強行突破了地下礦區來到了政府區。
DS2經典怪物：嬰兒怪
在妮可幻覺的指引下，艾薩克遇到了一臺機器，這臺機器可以解開他大腦中被標記感染的部分，並且能和神印直接溝通，這就是著名的“眼球手術”（圖片過於血腥就不放了），此時妮可的幻象開始瘋狂地阻止艾薩克摧毀神印，在面對妮可的質問中，艾薩克承認自己還她，但是為了自己和人類必須和她做個了斷。經過漫長的戰鬥，艾薩克摧毀了妮可的幻象，並且在腦中的清除了神印對他的精神控制，還摧毀掉了神印。
殺死泰德曼
神印被被摧毀後，泰坦空間站的核動力發生裝置失衡，隨即發生爆炸。正當艾薩克坐在地上等待死亡的時候，艾莉駕駛穿梭機前來營救艾薩克，最終二人成功逃出了泰坦空間站。當他看向副駕座的時候，這次他看到的不再是妮可的幻象，而是活生生的艾莉。
艾薩克和艾莉
3、《死亡空間3》
從泰坦站逃出來的艾薩克和艾莉二人來到了位於月球上的新月殖民地，在這裡二人確認了關係，艾薩克還給自己安裝了一個義眼。雖然在泰坦空間站裡清除了神印對他的精神控制，但是他的大腦中仍然有神印的信息，使得他只能選擇逃避來暫時忘記這一切。艾莉覺得解決這件事情最好的辦法就是去摧毀神印，但是艾薩克此時不願意陪艾莉一起對抗神印，二人在該問題上產生分歧遂分手。
新月殖民地
2514年的新月殖民地，突然遭到了由統一教雅各布·丹尼克所率領的部隊圍攻，丹尼克懷疑地球政府利用神印進行非法研究從而發動叛亂，企圖推翻地球政府的統治。與此同時，還在公寓裡為分手而感到傷心的艾薩克突然被一支部隊帶走，領頭的人叫約翰·卡沃爾和羅伯特·諾頓，諾頓告訴艾薩克他們是隸屬於地球政府的部隊，此次帶走艾薩克就是希望他能幫助地球政府共同對抗統一教。
在收到來自塔弗蘭提斯星球上艾莉的求救信號後，一行人通過星際躍遷來到了塔弗蘭提斯的軌道上。通過探查，他們發現艾莉的求救信號就是在這附近發出的，終於他們找到了艾莉所在飛船成功地救出了她。艾莉告訴艾薩克船長在他的房間裡留下了許多看不懂的文字，艾薩克查看後發現，原來此前船長在此地發現了一個可以操控神印的“遠古機器”，在神印的影響下他的腦子裡一直在重複“關閉它”這三個字，艾薩克誤以為可以通過這個機器的關閉指令來封印住神印。
神秘文字
抵達塔弗蘭提斯後，諾頓開始質疑起此次任務的合理性，認為此次任務生還概率極小，此時艾薩克還不知道艾莉和他分手後接著和諾頓確認了關係，諾頓開始對艾薩克充滿敵意，指責正是因為他才害的他們落得這般境地，情緒激動的諾頓朝艾薩克開槍試圖殺死他，不料被艾薩克一槍在腦袋上開了個大洞。進過此次事件後眾人繼續前進，在一個被冰凍了萬年的巨獸體內找到了“遠古機器”的位置，而後又得知遠古機器需要譯碼器來破解上面的外星文字，這一切都需要一個名叫羅塞塔的外星人來完成。當他們探索實驗室時，發現了已經被切成數片的羅塞塔，艾薩克前往各處尋找羅塞塔的碎片用於提取她腦中關於譯碼器和遠古機器的信息。
塔弗蘭提斯星
當所有的羅塞塔碎片組合到一起後，艾薩克才發現了這一切事件背後的真相，原來遠古機器的正確使用方法是打開它，利用遠古機器可以封印住血月和其屍變體。隨即他們來到了遠古機器的所在地，在那裡找到了塞拉諾博士曾經工作過的實驗室，不料此時丹尼克帶著統一教的部隊趕來搶走了譯碼器，並把艾莉關在了充滿毒氣的房間裡。艾莉在毒氣室裡流著淚讓艾薩克快跑，艾薩克頓時大為光火，和卡沃爾砍瓜切菜一般收拾掉了統一教剩餘的士兵來到了丹尼克的面前搶走了譯碼器。
遠古機器
在艾莉獨自逃出毒氣室的途中不幸被統一教的士兵發現，丹尼克把她抓來作為人質要求交換艾薩克手裡的譯碼器，在譯碼器被扔向丹尼克的空中，丹尼克松開了艾莉一把搶過譯碼器並關閉了它。終於，位於塔弗蘭提斯上的血月擺脫了遠古機器的控制，開始向星球上空緩緩升起。看到任務完成的丹尼克欣喜若狂時被一塊碎片砸中當場死亡，艾薩克讓艾莉乘坐穿梭機趕緊逃離此地，而他和卡沃爾二人找到了之前被丟在地上的譯碼器，打開了遠古機器成功阻止血月繼續升空並摧毀了它，在血月砸向地面的同時，二人選擇與血月同歸於盡。
丹尼克劫持艾莉
艾薩克和卡沃爾
看到血月墜落後的艾莉以為艾薩克已經死亡，她設定好前往地球的路線並離開了塔弗蘭提斯的軌道。在血月砸向地面後，艾薩克和卡沃爾二人從地底城市中醒來，他們找到了先前聯盟政府時期留在這裡的新星號，修好了躍遷系統後開始朝地球出發，當他們抵達地球后才發現，此時的地球已經被數個巨大的血月所包圍，而新星號也與血月相撞，最終二人生死不明。
血月攻擊地球
END.