1. 《刺客信条：奥德赛》（公元前485年，古希腊）
- 主角：卡珊德拉
阿利克西欧斯
- 故事：作为斯巴达雇佣兵，主角因家族悲剧踏上冒险，揭露秩序神教的阴谋，并探索伊述文明的秘密。游戏融合了希腊神话与历史事件，如伯罗奔尼撒战争。
2. 《刺客信条：起源》（公元前49年，古埃及）
- 主角：巴耶克
- 故事：古埃及守护者巴耶克因儿子被杀，与妻子艾雅共同复仇，最终推动刺客兄弟会的诞生。游戏展现了托勒密王朝末期的动荡，以及埃及艳后克利奥帕特拉与凯撒的政治纠葛。
3. 《刺客信条1》（1191年，第三次十字军东征）
- 主角：阿泰尔·伊本-拉阿哈德
- 故事：阿泰尔因任务失败被降级，后通过刺杀圣殿骑士高层逐渐成长为刺客大师。游戏以中东的马斯亚夫城堡为中心，探索刺客与圣殿骑士的早期对抗。
4. 《刺客信条2》三部曲（1476-1511年，文艺复兴意大利
- 主角：埃齐奥·奥迪托雷
- 故事：埃齐奥目睹家族被圣殿骑士陷害后继承刺客身份，从佛罗伦萨到罗马、君士坦丁堡，逐步成长为刺客导师，并揭开伊甸圣器的秘密（涵盖《刺客信条2》《兄弟会》《启示录》）。
5. 《刺客信条4：黑旗》（1715年，加勒比海盗黄金时代）
- 主角：爱德华·肯威
- 故事：威尔士海盗爱德华为追求财富卷入刺客与圣殿骑士的斗争，最终成为刺客盟友。他是《刺客信条3》海尔森·肯威的父亲、康纳的祖父。
6. 《刺客信条：自由呐喊》（黑旗DLC，1735-1737年的加勒比海）
- 主角：阿德瓦勒
- 故事：阿德瓦勒脱离爱德华后，加入刺客组织，策划解放法属圣多明戈（今海地）的奴隶。他摧毁奴隶船、对抗圣殿骑士控制的种植园主，最终成为刺客导师。
7. 《刺客信条：叛变》（1752-1760年的七年战争时期）
- 主角：谢伊·帕特里克·科马克
- 故事：谢伊因刺客组织滥用先行者遗迹（如引发里斯本大地震）导致无辜伤亡，转而加入圣殿骑士。他猎杀前同僚，协助海尔森·肯威（康纳之父）重建北美圣殿骑士势力，并与《刺客信条3》的反派（如查尔斯·李）合作。结局中，谢伊还刺杀了《大革命》主角亚诺的父亲，串联多部作品。
8. 《刺客信条3》（1754-1783年，美国独立战争）
- 主角：康纳（拉通哈给顿）
- 故事：康纳作为莫霍克原住民，因部落被毁加入刺客组织，协助华盛顿对抗英国殖民者与圣殿骑士。其父海尔森是圣殿骑士首领，两人最终对立。
9. 《刺客信条：解放》（1765-1777年的新奥尔良）
- 主角：艾芙琳·德·格朗普雷
- 故事：艾芙琳揭露圣殿骑士利用奴隶贸易控制新奥尔良的阴谋，对抗包括西班牙总督在内的敌人。剧情涉及真实历史事件，如路易斯安那易主（法国→西班牙），并探索刺客组织在殖民地的渗透。
10. 《刺客信条：大革命》（1789年，法国大革命）
- 主角：亚诺·多里安
- 故事：亚诺因养父（圣殿骑士）被杀，加入刺客组织调查真相，并与恋人艾莉丝卷入巴黎革命的动荡旋涡。
11. 《刺客信条：枭雄》（1847年，工业革命伦敦）
- 主角：伊薇·弗莱
雅各布·弗莱
- 故事：姐弟二人以不同风格（伊薇潜行、雅各布正面战斗）争夺伦敦控制权，对抗圣殿骑士首领克劳福德·斯塔瑞克，并夺取伊甸碎片。
12. 《刺客信条：英灵殿》（9世纪，维京时代）
- 主角：艾沃尔
- 故事：维京战士艾沃尔带领族人从挪威迁徙至英格兰，与阿尔弗雷德大帝对抗，并逐渐卷入刺客与圣殿骑士（上古维序者）的千年纷争。
13. 《刺客信条：幻景》（9世纪，巴格达）
- 主角：巴辛姆·伊本·伊沙克
- 故事：巴辛姆从街头小偷成长为无形者（刺客组织前身成员），揭露巴格达圣殿骑士的阴谋，并与其未来身份（洛基转世）产生关联。
14. 《刺客信条：影》（1579年日本战国时代）
- 主角：弥助
奈绪江
- 故事：双主角分别以武士与忍者视角展开，对抗织田信长势力及圣殿骑士。游戏首次引入季节变化与光影对潜行的影响。
