額外新增的病原體:N蠕蟲、N喪屍、猩猩流感、暗影瘟疫。
還有不同場景下的官方自定義玩家自定義等。基礎病原體無法使用自定義。
A、細菌:最為基礎的，和之前沒什麼兩樣。最多走大道項鍊增加一個可以多段跳的詞條，出圖收回；走雙下水道項鍊增加一個毒回血or免疫毒的詞條，出圖收回。
B、病毒:1細胞及以上可選，無法主動選擇變異，變異數量上限+1。
C、真菌:1細胞及以上可選，無法使用地圖且無法走回頭路，變異數量上限+2。
D、寄生蟲:2細胞及以上可選，飛頭無冷卻，主副武器禁止使用，蜘蛛符文時不時失效，變異數量上限-1。
E、阮病毒:3細胞及以上可選，第一個Boss前無卷軸(但碎片+1/+2/+3)，第二個Boss前碎片ⅹ2，卷軸恢復正常，第三個Boss時，若主卷軸少於總卷軸數的7分之5，則把最少的卷軸全部轉化成主卷軸。之後，則無卷軸和碎片。
F、納米病毒:4細胞及以上可選，休息區(如商店、兩圖之間休息區、劇情房等)怪物也會攻擊，而且所有怪物都無攻擊前搖和後搖，無攻擊提示(就算開了也沒有)，細胞人自動吸怪。且細胞人無法使用紅綠武器技能和選擇變異(變異固定為免死一次，脫離戰線，冷血無情，初始就有)。
G、***:4細胞及以上可選，細胞人會不斷掉血，沒有黃血時間也沒有一血保護，所有盾和繭都無法使用，禁止走綠流，金武只會刷4倍且所有怪物都是精英。Boss白給紅圈不消失，地火速度ⅹ2，大眼召喚觸手增多，天女散花增多，蟲母所有攻擊無前後搖無感嘆號，攻速ⅹ2，稻草人在地底時間ⅹ2，兩邊蘑菇變食人花，無攻擊前後搖，巨人所有階段都有落石且無攻擊提示和攻擊前後搖，眼晴露出時間減少一半，王手投彈速度ⅹ2數量ⅹ2，旗子數量ⅹ2等侍時間減少一半，兩旁無冰臺，陷阱區域變大，收藏家免疫所有負面狀態(如流血燃燒中毒等)，無攻擊前後搖無感嘆號，地石+炸彈會和別的攻擊一同出現，換到最終間之後不會再換房間，強制細胞人1血。【女王的不知道所以不算】
新增病原體:
N蠕蟲:飛頭無冷卻無距離限制，且主副武器禁止使用，蜘蛛符文可爬頂(即細胞人可趴在天花板上)，放置形陷阱攻擊提升至400%(無副作用)，煙霧彈時間延長至1000%(但隱身期間無法飛頭)。
N喪屍:每個圖都有提燈怪，只有擊殺復活的怪物才算殺敵數，只有擊殺復活的Boss兩次才算通關，且復活的怪物可變為精英怪，復活的精英怪會再次復活，普通怪只會復活一次，建議在5細胞疫病快滿時遊玩。
猩猩流感:細胞人召喚物攻擊力提升，能召喚衍生物的怪物(如蜘蛛、宿主僵、墓地僵等)和小怪物(如自爆蝠、蝙蝠、飛咬蟲、病原蟲等)攻速和攻擊力ⅹ2。繭失效，且所有小怪或Boss在生命低於15%(Boss低於7%)將要被處決或擊殺前都有一次全方位抵擋細胞人攻擊的機會，且下一擊對細胞人來說沒有1血保護(即觸發全方位防禦的怪下一擊可秒殺細胞人)。大眼散花次數增加層數增加，觸手數量增加且都變為精英(可能會掉金武且只有在本房間才能使用)，觸手和本體可以一同行動(即半次性臺子變為實心臺子，召喚觸手時沒有無敵時間)。群攻技能禁止使用，且紫流失效(失效的意思是，可選擇紫卷，但只增加生命不增加攻擊)。
暗影瘟疫:最高卷軸失效(只加生命不加攻擊)，金武吃剩下兩卷軸(若三卷相同則吃紫綠)，普通武器全變為無色，只吃最低卷軸(若三卷相同則吃紫)。那最高卷軸有何用？給Boss加成:紅卷多，Boss近戰攻擊提升攻速變快可秒殺細胞人；紫卷多，Boss遠程攻擊提升攻速變快，且儘量不和細胞人接觸；綠卷多，Boss生命提升且所有攻擊都無前後搖，無感嘆號。給細胞人召喚物加成:紅卷多，夜歌幾卷持續+幾秒，攻擊力攻速提升；紫卷多，鳥狂暴時間ⅹ2，且40卷以上可持續狂暴；綠卷多，蘑菇自爆範圍一卷+1，且40卷以上可爆全圖(可秒Boss)，使用自爆後冷卻為變為666秒，再次使用後冷卻變為2333秒，第三次使用後蘑菇永久消失(除非開新檔否則蘑菇圖紙無法獲得，且新檔蘑菇圖紙細胞花費ⅹ100，且一次只能投一顆細胞)。
場景:(有些不記得了所以只講我記得的)
謠傳:所有怪物都有位移或瞬移(包括遠程怪)，細胞人位移系技能失效(如羽毛、位移、極速、投槍傳送)，藤蔓符文/牧羊符文/蜘蛛符文失效，需要用到這些符文的地方會有傳送。怪物只能被摔死或者被陷阱/放置型技能殺死，其它方式無法殺死怪物。打收藏家時，細胞人不會和Boss一同傳送，請主動選擇傳送點；打蟲母等會鑽地的，請主動使用傳送攻擊其本體(此時武器可生效)。
天花:無法主動選擇變異且無法更換變異，紅紫綠變為一卷加成20%攻擊，只有共10卷的三色卷軸(初始就有且後續無三色且都雙色卷)，3細胞及以上無碎片，5細胞除了正常疫病之外，細胞人被攻擊額外增加一格疫病，且若細胞人因被攻擊疫病滿後則強制掉血至10%(此時脫離戰線不生效)，若細胞人在疫病滿後被攻擊，則之前獲得的卷軸全部排出(即被攻擊後吃了幾卷吐幾卷)，不在10s內全部撿起則卷軸消失無法再次獲得。主卷軸35卷後免疫此效果。
聖誕節快樂:細胞人在此場景下，穿反向小偷裝束或雪人裝束獲得隱身效果(可持續全程)，怪物不會主動攻擊你且只有在攻擊期間怪物才會注意到你才會發動反擊(就算你A一下，怪物發現你了，你不A下一擊怪物還是不會打你，但會跟著你)。為平衡，所有怪物攻擊無前後搖且後背免疫任何攻擊(無視防禦的除外)，所有放置型技能失效，處決失效，一血保護失效，所有怪物均可一擊秒殺細胞人。群攻系技能和持續型技能禁止使用。