基本信息
姓名：喬瓦尼·波吉亞
生卒年：1498-1548
出生地：意大利，佛羅倫薩
活躍時期：文藝復興時期
所屬支部：意大利刺客兄弟會
生平
父母
公元1498年，佩羅託·卡爾代龍來到了聖米西斯托女修道院，表面上他是為波吉亞家族服務的信使，實際上佩羅託借這一身份為刺客兄弟會打探消息。
盧奎西亞·波吉亞正在修道院中等待迎來自己的第二段婚姻，信件成了她和其父親等人聯絡的唯一方式，因此佩羅託時常在她身旁等候。藉助職務之便，佩羅託看到了許多信件的內容，他對這個受制於家族的可憐女人漸漸心生同情乃至愛意，他決心拯救對方。 從託人送禮再到第一次搭話，佩羅託漸漸走進了盧奎西亞心中，這段隱瞞了兩大組織的愛戀給他們帶來了巨大的風險，因為盧奎西亞懷孕了。由於得瞞著波吉亞家族，佩羅託無法長時間陪伴自己的愛人，唯一的知情人也就是盧奎西亞的女僕茱莉亞曾建議他們找人將孩子領養，但視孩子為二人之間關係證明的佩羅託拒絕了。
最終，孩子出生了，卻天生畸形，盧奎西亞為此悲痛欲絕。擔心母子倆的佩羅託想找辦法幫忙，奈何有人已經發現了這個巨大的秘密，而佩羅託在兄弟會的年輕學徒也給他的行動帶來了不小的麻煩。
就在這緊要關頭，佩羅託被波吉亞家族關入了大牢。兄弟會的援救遙遙無期，好在茱莉亞帶來的工具箱給了佩羅託逃生的希望。利用針和銼刀撬開鎖後佩羅託逃出監室，但為了掩人耳目，他不得不殺死了試圖大喊大叫的獄友。
在茱莉亞和她哥哥的幫助下，佩羅託帶著孩子逃出佛羅倫薩，他的計劃是利用兄弟會轉移到阿尼亞德洛的伊甸裹屍布來治癒自己的兒子。羅德里戈的手下緊追不捨，好不容易才抵達目的地的佩羅託又面臨新的難題，因為兄弟會並不會允許他將神器用於這種私人用途。現在佩羅託無依無靠，別無選擇的他只能對昔日的兄弟拔劍相向，刺客們一個接一個倒下，他們無法阻止佩羅託接近裹屍布。
裹屍布盛放在木盒中，佩羅託將孩子放在上面，但一個聲音拒絕為他提供幫助。佩羅託大喊著，命令著，那個聲音只好選擇屈服，怪異的歌謠在腦海中唱響，小小的嬰孩停止哭泣。佩羅託將孩子從裹屍布取出，那雙小小的眼睛如此清澈明亮，這方法有作用嗎？
弗朗西斯科·切韋利奧——佩羅託的學徒——正和其他人一起趕赴阿尼亞德洛。他乞求其他人寬恕自己的導師，得到的回應是無情的拒絕，弗朗西斯科只能把怒火都發洩在對盧奎西亞的謾罵中。刺客們看到了阿尼亞德羅的慘狀，通過詢問當地市民，他們得知佩羅託帶著孩子在城外紮營。
佩羅託早就做好了準備，同僚們的話他一句也聽不進去，一支支箭矢就是回應。為了阻止佩羅託殺死更多人，刺客們只得一擁而上殺死了他。
童年
佩羅託死後，那個孩子被切薩雷·波吉亞收養，命名為喬瓦尼·波吉亞。從小切薩雷就告訴喬瓦尼，波吉亞家族面臨來自外界的威脅，因此他必須接受嚴格的訓練。盧奎西亞常來找喬瓦尼玩，他注意到這個平日裡一直憂傷的“姑姑”只有這時才顯得高興。盧奎西亞告誡喬瓦尼，一定不能相信任何人，包括切薩雷和羅德里戈在內。
受到裹屍布的影響，喬瓦尼和一個叫做康蘇斯的伊述人建立了聯繫。康蘇斯是那些伊甸神器的製造者，他將自己的意識數字化後傳輸進裹屍布，也因此被困其中，馬里奧、佩羅託等人觸碰裹屍布時聽到的聲音就來自他。康蘇斯有時會和喬瓦尼對話，這個情況被羅德里戈注意到了。
羅德里戈將金蘋果交給喬瓦尼把玩，他想看看喬瓦尼會如何使用金蘋果。喬瓦尼沒有辜負他的期待，他可以依靠想象力製造出一些影響，其中他最喜歡的是鷹。每每這時，羅德里戈就會在一旁記筆記。
米凱萊託應切薩雷的要求教導喬瓦尼，但他太過粗暴，這使喬瓦尼對他產生憎恨。有一次，為了讓喬瓦尼理解何為殘酷，米凱萊託甚至在街上殺死了一名無辜的老人。喬瓦尼嚇壞了，他掏出金蘋果試圖阻攔緊追不捨的米凱萊託。在康蘇斯的建議下，喬瓦尼試著製造了一些影響，米凱萊託被震懾住了。就在這時切薩雷趕來，米凱萊託嚇得轉身逃走。
即便是夜裡也不安寧，小喬瓦尼的夢境混亂不堪。他時常代入父親佩羅託的視角，看到父親經歷過的事情，只有在康蘇斯的安撫下才能入睡。
曾服務於切薩雷的妓女菲奧拉·卡瓦紮在一次任務之後投靠了刺客組織。意識到不對的切薩雷某天邀請她到家中吃飯，兩人爆發了激烈的爭吵，卻無人注意角落裡小喬瓦尼正在窺視。
那天晚上喬瓦尼又失眠了，他看到菲奧拉溜出房間。康蘇斯告訴他對方是在尋找金蘋果，於是喬瓦尼立刻跑到羅德里戈的圖書室將金蘋果拿出，菲奧拉緊隨其後，儘管她和康蘇斯都讓喬瓦尼把金蘋果交出去，但孩童的天性在這一刻佔了上風。喬瓦尼提出要和菲奧拉做追與逃的遊戲，而他跑動的聲音吵醒了切薩雷。就在菲奧拉觸碰到金蘋果的那一刻，喬瓦尼意外將其發動，菲奧拉再不能移動分毫。切薩雷一點點走近，要求喬瓦尼給他金蘋果並回去睡覺。
出逃
冷酷無情的切薩雷讓喬瓦尼厭惡，羅德里戈只關心那個金蘋果，而盧奎西亞則沉浸在悲傷當中，喬瓦尼待不下去了，他想要逃跑。
一隻信鴿帶來了好消息，雖然喬瓦尼看不懂那張字條上的信息，不過康蘇斯會告訴他答案：有人邀請他前往噴泉廣場。這個新奇的遊戲引起了他的興趣，羅德里戈正在看書，盧奎西亞還在哭泣，切薩雷壓根不在羅馬，那些守衛也不夠專心，這給了喬瓦尼溜出去的機會。
噴泉廣場的雕像上有另一張字條，提醒喬瓦尼利用他獨有的“眼睛”尋找道路。其實這就是鷹眼視覺，是喬瓦尼一直具備的能力，他沒發現什麼獨特的痕跡，但一個比周圍要亮的男子引起了他的注意。喬瓦尼向男子追去，對方敏捷地竄上房頂，兩人就這樣一高一低展開了一場小小的追逐戰。
最後喬瓦尼追進了一條小巷，兩個乞丐注意到了這個衣著華麗的小孩，他們拿著小刀向喬瓦尼靠近。就在這時那個男子一躍而下，穩穩落在乞丐們身上，他的雙手張開，地上兩人的脖頸淌出鮮血。
面前的男人穿著奇怪的衣服，不知為什麼，喬瓦尼很想跟著他。男人自稱弗朗西斯科，他向喬瓦尼詢問金蘋果的位置，喬瓦尼告訴他切斯科已將其隱藏。康蘇斯告訴喬瓦尼可以信任弗朗西斯科，喬瓦尼不由自主地對弗朗西斯科說道：“我原諒你了。”
弗朗西斯科想讓喬瓦尼重複一遍，無奈喬瓦尼根本不記得自己說過什麼。在弗朗西斯科的邀請下，他和對方一起返回了兄弟會。
海勒姆
1515年，喬瓦尼在托斯卡納地區接受了來自刺客導師艾吉奧的訓練，與他一起的是海勒姆·斯勒達德。在訓練當中，打鬧鬥嘴也是常事，不過海勒姆似乎有一種獨特的魅力，很容易得到了艾吉奧和一個年輕女孩埃萊娜的喜歡，喬瓦尼對此並不開心。
艾吉奧開導他說喬瓦尼讓他想到年輕的自己，他希望喬瓦尼學會耐心和包容，不要同海勒姆爭風吃醋而是應當尋找屬於他的道路。現在喬瓦尼已經不再能聽到康蘇斯的聲音，但他依舊將那視為自己的過人之處並引以為豪，艾吉奧交給他一本但丁的《神曲》，希望喬瓦尼能懂得戒驕戒躁。
那天晚上，喬瓦尼看到了海勒姆向埃萊娜表白，還沒等他介入，艾吉奧就喊著跑來，他帶來了一封來自米開朗基羅的信。米開朗基羅發現了聖殿騎士的新陰謀，刺客們需要立刻行動起來。艾吉奧讓海勒姆作為行動指揮，而喬瓦尼則成了他的部下。
海勒姆和喬瓦尼來到了佛羅倫薩，在米開朗基羅的幫助下找到了形跡可疑的聖殿騎士代·佩特魯奇。海勒姆太自信了，他完全不顧喬瓦尼的建議，執意立刻採取行動。正好代·佩特魯奇的馬車被人群阻礙，海勒姆立刻襲擊了對方，但他滿腦子都想著埃萊娜，根本沒注意代·佩特魯奇已經趁著他和其他人戰鬥悄悄逃走。
兩個年輕的刺客在佛羅倫塞找了整整兩天，可絲毫不見聖殿騎士的影子，喬瓦尼憤怒地指責海勒姆的無能，但對方絲毫不肯認錯。最後，兩人只能寫信給艾吉奧，告知他發生的一切。寫信的工作交給了喬瓦尼，至於海勒姆？他正一邊想著埃萊娜一邊和酒館的女招待調情。
埃萊娜偷看了那封信，隨後便急匆匆的趕到了佛羅倫薩，可海勒姆還在睡覺，喬瓦尼趁機告訴了她昨夜發生的事情。海勒姆堅稱他只是讓那個女招待教他一首情詩的意大利念法，但這自然無法說服一位怒火中燒的女性。海勒姆找到喬瓦尼興師問罪，兩人在屋頂大打出手。突然，喬瓦尼被康蘇斯附身。
康蘇斯借喬瓦尼的身體，同未來讀取海勒姆記憶的刺客對話。但這嚇壞了當時的海勒姆和埃萊娜，後者以為是前者把喬瓦尼變成這副模樣。在推搡中，埃萊娜墜樓身亡，海勒姆只來得及抓住她的圍巾。這場悲劇導致了海勒姆心態的變化。
後來，海勒姆和喬瓦尼竭盡全力回收了聖殿騎士得到的一枚金蘋果，這是他們共同完成的第一項也是最後一項任務。在之後的一年裡，海勒姆的心理愈發扭曲，他殘暴的作風為自己換來了“血腥海勒姆”的稱號。他試圖將那枚金蘋果據為己有，藉此和已經逝去的埃萊娜取得聯繫。
為此，海勒姆來到希臘，那是兄弟會藏匿金蘋果的地方。喬瓦尼伏擊了海勒姆，最終將對方打倒在地。在得知海勒姆的目的之後，他試圖勸說對方迴歸兄弟會，但是海勒姆拒不悔改，他也拒絕接受喬瓦尼的道歉。喬瓦尼將那本《神曲》留給海勒姆，希望他也能從中學到一些東西。
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