基本信息
姓名：乔瓦尼·波吉亚
生卒年：1498-1548
出生地：意大利，佛罗伦萨
活跃时期：文艺复兴时期
所属支部：意大利刺客兄弟会
生平
父母
公元1498年，佩罗托·卡尔代龙来到了圣米西斯托女修道院，表面上他是为波吉亚家族服务的信使，实际上佩罗托借这一身份为刺客兄弟会打探消息。
卢奎西亚·波吉亚正在修道院中等待迎来自己的第二段婚姻，信件成了她和其父亲等人联络的唯一方式，因此佩罗托时常在她身旁等候。借助职务之便，佩罗托看到了许多信件的内容，他对这个受制于家族的可怜女人渐渐心生同情乃至爱意，他决心拯救对方。 从托人送礼再到第一次搭话，佩罗托渐渐走进了卢奎西亚心中，这段隐瞒了两大组织的爱恋给他们带来了巨大的风险，因为卢奎西亚怀孕了。由于得瞒着波吉亚家族，佩罗托无法长时间陪伴自己的爱人，唯一的知情人也就是卢奎西亚的女仆茱莉亚曾建议他们找人将孩子领养，但视孩子为二人之间关系证明的佩罗托拒绝了。
最终，孩子出生了，却天生畸形，卢奎西亚为此悲痛欲绝。担心母子俩的佩罗托想找办法帮忙，奈何有人已经发现了这个巨大的秘密，而佩罗托在兄弟会的年轻学徒也给他的行动带来了不小的麻烦。
就在这紧要关头，佩罗托被波吉亚家族关入了大牢。兄弟会的援救遥遥无期，好在茱莉亚带来的工具箱给了佩罗托逃生的希望。利用针和锉刀撬开锁后佩罗托逃出监室，但为了掩人耳目，他不得不杀死了试图大喊大叫的狱友。
在茱莉亚和她哥哥的帮助下，佩罗托带着孩子逃出佛罗伦萨，他的计划是利用兄弟会转移到阿尼亚德洛的伊甸裹尸布来治愈自己的儿子。罗德里戈的手下紧追不舍，好不容易才抵达目的地的佩罗托又面临新的难题，因为兄弟会并不会允许他将神器用于这种私人用途。现在佩罗托无依无靠，别无选择的他只能对昔日的兄弟拔剑相向，刺客们一个接一个倒下，他们无法阻止佩罗托接近裹尸布。
裹尸布盛放在木盒中，佩罗托将孩子放在上面，但一个声音拒绝为他提供帮助。佩罗托大喊着，命令着，那个声音只好选择屈服，怪异的歌谣在脑海中唱响，小小的婴孩停止哭泣。佩罗托将孩子从裹尸布取出，那双小小的眼睛如此清澈明亮，这方法有作用吗？
弗朗西斯科·切韦利奥——佩罗托的学徒——正和其他人一起赶赴阿尼亚德洛。他乞求其他人宽恕自己的导师，得到的回应是无情的拒绝，弗朗西斯科只能把怒火都发泄在对卢奎西亚的谩骂中。刺客们看到了阿尼亚德罗的惨状，通过询问当地市民，他们得知佩罗托带着孩子在城外扎营。
佩罗托早就做好了准备，同僚们的话他一句也听不进去，一支支箭矢就是回应。为了阻止佩罗托杀死更多人，刺客们只得一拥而上杀死了他。
童年
佩罗托死后，那个孩子被切萨雷·波吉亚收养，命名为乔瓦尼·波吉亚。从小切萨雷就告诉乔瓦尼，波吉亚家族面临来自外界的威胁，因此他必须接受严格的训练。卢奎西亚常来找乔瓦尼玩，他注意到这个平日里一直忧伤的“姑姑”只有这时才显得高兴。卢奎西亚告诫乔瓦尼，一定不能相信任何人，包括切萨雷和罗德里戈在内。
受到裹尸布的影响，乔瓦尼和一个叫做康苏斯的伊述人建立了联系。康苏斯是那些伊甸神器的制造者，他将自己的意识数字化后传输进裹尸布，也因此被困其中，马里奥、佩罗托等人触碰裹尸布时听到的声音就来自他。康苏斯有时会和乔瓦尼对话，这个情况被罗德里戈注意到了。
罗德里戈将金苹果交给乔瓦尼把玩，他想看看乔瓦尼会如何使用金苹果。乔瓦尼没有辜负他的期待，他可以依靠想象力制造出一些影响，其中他最喜欢的是鹰。每每这时，罗德里戈就会在一旁记笔记。
米凯莱托应切萨雷的要求教导乔瓦尼，但他太过粗暴，这使乔瓦尼对他产生憎恨。有一次，为了让乔瓦尼理解何为残酷，米凯莱托甚至在街上杀死了一名无辜的老人。乔瓦尼吓坏了，他掏出金苹果试图阻拦紧追不舍的米凯莱托。在康苏斯的建议下，乔瓦尼试着制造了一些影响，米凯莱托被震慑住了。就在这时切萨雷赶来，米凯莱托吓得转身逃走。
即便是夜里也不安宁，小乔瓦尼的梦境混乱不堪。他时常代入父亲佩罗托的视角，看到父亲经历过的事情，只有在康苏斯的安抚下才能入睡。
曾服务于切萨雷的妓女菲奥拉·卡瓦扎在一次任务之后投靠了刺客组织。意识到不对的切萨雷某天邀请她到家中吃饭，两人爆发了激烈的争吵，却无人注意角落里小乔瓦尼正在窥视。
那天晚上乔瓦尼又失眠了，他看到菲奥拉溜出房间。康苏斯告诉他对方是在寻找金苹果，于是乔瓦尼立刻跑到罗德里戈的图书室将金苹果拿出，菲奥拉紧随其后，尽管她和康苏斯都让乔瓦尼把金苹果交出去，但孩童的天性在这一刻占了上风。乔瓦尼提出要和菲奥拉做追与逃的游戏，而他跑动的声音吵醒了切萨雷。就在菲奥拉触碰到金苹果的那一刻，乔瓦尼意外将其发动，菲奥拉再不能移动分毫。切萨雷一点点走近，要求乔瓦尼给他金苹果并回去睡觉。
出逃
冷酷无情的切萨雷让乔瓦尼厌恶，罗德里戈只关心那个金苹果，而卢奎西亚则沉浸在悲伤当中，乔瓦尼待不下去了，他想要逃跑。
一只信鸽带来了好消息，虽然乔瓦尼看不懂那张字条上的信息，不过康苏斯会告诉他答案：有人邀请他前往喷泉广场。这个新奇的游戏引起了他的兴趣，罗德里戈正在看书，卢奎西亚还在哭泣，切萨雷压根不在罗马，那些守卫也不够专心，这给了乔瓦尼溜出去的机会。
喷泉广场的雕像上有另一张字条，提醒乔瓦尼利用他独有的“眼睛”寻找道路。其实这就是鹰眼视觉，是乔瓦尼一直具备的能力，他没发现什么独特的痕迹，但一个比周围要亮的男子引起了他的注意。乔瓦尼向男子追去，对方敏捷地窜上房顶，两人就这样一高一低展开了一场小小的追逐战。
最后乔瓦尼追进了一条小巷，两个乞丐注意到了这个衣着华丽的小孩，他们拿着小刀向乔瓦尼靠近。就在这时那个男子一跃而下，稳稳落在乞丐们身上，他的双手张开，地上两人的脖颈淌出鲜血。
面前的男人穿着奇怪的衣服，不知为什么，乔瓦尼很想跟着他。男人自称弗朗西斯科，他向乔瓦尼询问金苹果的位置，乔瓦尼告诉他切斯科已将其隐藏。康苏斯告诉乔瓦尼可以信任弗朗西斯科，乔瓦尼不由自主地对弗朗西斯科说道：“我原谅你了。”
弗朗西斯科想让乔瓦尼重复一遍，无奈乔瓦尼根本不记得自己说过什么。在弗朗西斯科的邀请下，他和对方一起返回了兄弟会。
海勒姆
1515年，乔瓦尼在托斯卡纳地区接受了来自刺客导师艾吉奥的训练，与他一起的是海勒姆·斯勒达德。在训练当中，打闹斗嘴也是常事，不过海勒姆似乎有一种独特的魅力，很容易得到了艾吉奥和一个年轻女孩埃莱娜的喜欢，乔瓦尼对此并不开心。
艾吉奥开导他说乔瓦尼让他想到年轻的自己，他希望乔瓦尼学会耐心和包容，不要同海勒姆争风吃醋而是应当寻找属于他的道路。现在乔瓦尼已经不再能听到康苏斯的声音，但他依旧将那视为自己的过人之处并引以为豪，艾吉奥交给他一本但丁的《神曲》，希望乔瓦尼能懂得戒骄戒躁。
那天晚上，乔瓦尼看到了海勒姆向埃莱娜表白，还没等他介入，艾吉奥就喊着跑来，他带来了一封来自米开朗基罗的信。米开朗基罗发现了圣殿骑士的新阴谋，刺客们需要立刻行动起来。艾吉奥让海勒姆作为行动指挥，而乔瓦尼则成了他的部下。
海勒姆和乔瓦尼来到了佛罗伦萨，在米开朗基罗的帮助下找到了形迹可疑的圣殿骑士代·佩特鲁奇。海勒姆太自信了，他完全不顾乔瓦尼的建议，执意立刻采取行动。正好代·佩特鲁奇的马车被人群阻碍，海勒姆立刻袭击了对方，但他满脑子都想着埃莱娜，根本没注意代·佩特鲁奇已经趁着他和其他人战斗悄悄逃走。
两个年轻的刺客在佛罗伦塞找了整整两天，可丝毫不见圣殿骑士的影子，乔瓦尼愤怒地指责海勒姆的无能，但对方丝毫不肯认错。最后，两人只能写信给艾吉奥，告知他发生的一切。写信的工作交给了乔瓦尼，至于海勒姆？他正一边想着埃莱娜一边和酒馆的女招待调情。
埃莱娜偷看了那封信，随后便急匆匆的赶到了佛罗伦萨，可海勒姆还在睡觉，乔瓦尼趁机告诉了她昨夜发生的事情。海勒姆坚称他只是让那个女招待教他一首情诗的意大利念法，但这自然无法说服一位怒火中烧的女性。海勒姆找到乔瓦尼兴师问罪，两人在屋顶大打出手。突然，乔瓦尼被康苏斯附身。
康苏斯借乔瓦尼的身体，同未来读取海勒姆记忆的刺客对话。但这吓坏了当时的海勒姆和埃莱娜，后者以为是前者把乔瓦尼变成这副模样。在推搡中，埃莱娜坠楼身亡，海勒姆只来得及抓住她的围巾。这场悲剧导致了海勒姆心态的变化。
后来，海勒姆和乔瓦尼竭尽全力回收了圣殿骑士得到的一枚金苹果，这是他们共同完成的第一项也是最后一项任务。在之后的一年里，海勒姆的心理愈发扭曲，他残暴的作风为自己换来了“血腥海勒姆”的称号。他试图将那枚金苹果据为己有，借此和已经逝去的埃莱娜取得联系。
为此，海勒姆来到希腊，那是兄弟会藏匿金苹果的地方。乔瓦尼伏击了海勒姆，最终将对方打倒在地。在得知海勒姆的目的之后，他试图劝说对方回归兄弟会，但是海勒姆拒不悔改，他也拒绝接受乔瓦尼的道歉。乔瓦尼将那本《神曲》留给海勒姆，希望他也能从中学到一些东西。
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