回看游戏共有六个章节，分别对应孙悟空死后留下的六个根器：黑风山、黄风岭、小西天、盘丝洞、火焰山和花果山。游戏的每个章节都充满了黑暗和反转的内容，如果不做隐藏支线并仔细阅读游戏内的各种文本的话，很容易被各种事件的表象蒙蔽，最终走上重戴紧箍的结局。
例如在第二章中，灵吉菩萨是第一个黑化的人物。在黄风岭的灾难都源于黄风大王，他寻得了孙悟空死后化作的六根之一，自己的法力却无法炼化此等宝物，因此偷袭斩断了灵吉菩萨的头颅，企图借助菩萨的躯体来炼化大圣遗物中的法力为自己所用。但最后天命人成功击杀了黄风大王，收回大圣遗物，并帮灵吉菩萨恢复正身。然而事件结束后，黄风岭依然是残垣一片，灵吉菩萨并没有降下福祉解救苍生。
另一个例子是小西天的亢金龙。在《西游记》正传中我们遭遇黄眉怪的地方，到了《黑神话悟空》除了同样要面对黄眉之外，本关还多了一位风姿绰约的亢金星君。亢金龙原本在天庭当差，因昴日星官神秘失踪，她才请旨下界去调查。然而她真正想做的是偷偷收集孙悟空死后留下的六根来复活大圣。但她的图谋很早就被黄眉识破了。黄眉怪诓骗亢金龙说大圣的六根之一就在人种袋中，于是亢金龙奋不顾身钻了进去。然而令她没想到的是，黄眉利用孙悟空六根之一的法力重新炼化了人种袋，将它变成了蛊惑人心的妖宝。等到亢金龙从人种袋被放出来时已然变得痴傻，见到黄眉就要磕头认师傅，与一具行尸走肉已无分别。
这种黑暗剧情在游戏中还有很多，比如第四章的BOSS晦月魔君就是一个例子。它从一团肉瘤中诞生，长得如同一具骷髅，浑身散发着恶臭的粘液。但其实它的本体是《西游记》中曾经降伏蝎子精的昴日星官。在《黑神话悟空》的设定中，西王母能令众仙长生不老的蟠桃、太上老君能让人延年益寿的金丹都需要灵韵滋养或炼化，这种灵韵还不能是普通的灵韵，须是有修行、有道法的大妖的灵韵才可以。然而大妖都须经历百年甚至千年的修为，天庭可等不了那么久。为了能批量、大量繁殖提供灵韵的妖怪，天庭与黄花馆的百眼魔君达成秘密交易，默许百眼魔君大搞生化实验，将人、仙、妖进行杂交，给天庭提供合适的灵韵供体。然而孙悟空西天取经之时却跟毗蓝婆菩萨把百眼魔君的道场给毁掉了。对此天庭怎能坐视不理呢？从我们探访紫云山的经历可以推测出紫云山中并未得见毗蓝婆菩萨。昴日星官得知母亲生死未卜后前来紫云山探查却被百眼魔君制服并被植入了一颗疑似是被西王母赐下的仙卵。那仙卵在昴日鸡的身体里不断生长完全吞噬了昴日星官的意志最终把昴日星官炼化成了一个神不神妖不妖的生化怪物。
最后盒友们如何看待黑神话中的故事线呢，想听听盒友们的看法
（最后都看到这里了，点个赞叭）