在【碼頭】選擇【出航準備】後，就可以開啟航行前的準備界面。
可查看航線以及自動航行。航線是開啟自動航行的前提條件。一個區域的航線一般能通過航線圖解鎖，我們可以在商店購買或是完成一些事件獲得航線圖。注意獲得航線圖後，不要忘記打開揹包使用，才能在地圖上激活。
除了解鎖航線外，玩家還需要在甲板的測繪室裡安排測量員才可以自動航行。測量員的測繪等級越高可自動航行的距離越遠。
玩家可以在這裡存取碼頭倉庫的貨物（也可以在碼頭倉庫操作）。
另外，補給和貨物都會佔用船隻的倉儲空間。因此，船艙分為補給貨艙和交易品貨艙。有需要的話，玩家可以通過【分配貨艙空間】來調整兩者的佔比。比如航線較近補給消耗不多的話，可以適當調低補給倉的佔比，以此來運輸更多的貨物。
玩家可以將水手分配到各個船隻上。圖中的紅線表示船隻航行必要的水手數量，水手數低於紅線則無法出航。水手越多航行的效率越高，不過要注意水手數量提升的同時，每日的工資和補給需求也會提升，玩家可以根據自己的航線目的來調整水手數量。
在這裡可以分配船員到不同的位置上為航行提供加成。
按F鍵可以裝載補給，長按的話可開啟自動補給。同此情況下，每次出航儘量將補給帶滿。
準備就緒後，選擇出海航行就能進入航海界面。
玩家可以通過Q\E鍵來調整船帆。航行過程中可以通過右上角迷你地圖中的雲朵來判斷風向。艦隊在順風航行時速度會加快，逆風則會變慢。
航行過程中偶爾會出現附近有寶藏的提示，玩家可以按ALT鍵開啟瞭望模式來搜尋寶藏位置。注意開啟瞭望模式需要在瞭望室設置瞭望手，同時開啟瞭望模式，船帆狀態最多為半帆。
海上航行過程中，玩家需要注意水手士氣也會隨時間逐漸下降，下降的士氣可以在港口的酒館中使用請客指令來恢復。
海上偶爾會漂浮著一些可交互的物體，靠近後長按F鍵可獲得一些物品例如補給、裝備等等。
當進入海浪較大的海域時,部分交易品有幾率磨損。從而影響交易品的出售價格。代表磨損整備室可以保護交易品，降低磨損影響的程度。