在【码头】选择【出航准备】后，就可以开启航行前的准备界面。
可查看航线以及自动航行。航线是开启自动航行的前提条件。一个区域的航线一般能通过航线图解锁，我们可以在商店购买或是完成一些事件获得航线图。注意获得航线图后，不要忘记打开背包使用，才能在地图上激活。
除了解锁航线外，玩家还需要在甲板的测绘室里安排测量员才可以自动航行。测量员的测绘等级越高可自动航行的距离越远。
玩家可以在这里存取码头仓库的货物（也可以在码头仓库操作）。
另外，补给和货物都会占用船只的仓储空间。因此，船舱分为补给货舱和交易品货舱。有需要的话，玩家可以通过【分配货舱空间】来调整两者的占比。比如航线较近补给消耗不多的话，可以适当调低补给仓的占比，以此来运输更多的货物。
玩家可以将水手分配到各个船只上。图中的红线表示船只航行必要的水手数量，水手数低于红线则无法出航。水手越多航行的效率越高，不过要注意水手数量提升的同时，每日的工资和补给需求也会提升，玩家可以根据自己的航线目的来调整水手数量。
在这里可以分配船员到不同的位置上为航行提供加成。
按F键可以装载补给，长按的话可开启自动补给。同此情况下，每次出航尽量将补给带满。
准备就绪后，选择出海航行就能进入航海界面。
玩家可以通过Q\E键来调整船帆。航行过程中可以通过右上角迷你地图中的云朵来判断风向。舰队在顺风航行时速度会加快，逆风则会变慢。
航行过程中偶尔会出现附近有宝藏的提示，玩家可以按ALT键开启瞭望模式来搜寻宝藏位置。注意开启瞭望模式需要在瞭望室设置瞭望手，同时开启瞭望模式，船帆状态最多为半帆。
海上航行过程中，玩家需要注意水手士气也会随时间逐渐下降，下降的士气可以在港口的酒馆中使用请客指令来恢复。
海上偶尔会漂浮着一些可交互的物体，靠近后长按F键可获得一些物品例如补给、装备等等。
当进入海浪较大的海域时,部分交易品有几率磨损。从而影响交易品的出售价格。代表磨损整备室可以保护交易品，降低磨损影响的程度。