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先不谈吉尔和克里斯，让我们回头看一下还在山里的活宝兄弟。
活宝兄弟
飞机残骸中，昆特还在对着电脑屏幕一段输出，奇斯则坐在旁边随着音乐抖动。屏幕出现加载的进度条，但突然就黑屏了，昆特一顿敲击键盘但没有反应，随后竟然开始笑了起来。见到昆特在笑，奇斯也笑了起来。两个活宝笑了一会后，奇斯问他在干嘛，昆特说他什么也没有做。
是真的活宝
奇斯尝试拆解电脑来判断是哪里出了问题，而拿着杯子刚要喝的昆特突然想起了什么东西，丢下一句话就往机场方向跑去。二人很快就回到了之前的地方，驻扎在这里的军队已经撤退了，昆特可以通过备份的钥匙直接进去。昆特似乎对真相有所察觉，但他并不想太早说出，还需要进一步的线索确认。
二人再次进入
来到了房间更深处的地方，这里有着一台电脑。昆特两眼放光，直接冲了上去，说这是货真价实的MB-28型，使他早就想要的东西。在启动发电机为电脑供电后，昆特开始分析电脑里的数据，而奇斯则保护昆特不被四面八方袭来的怪物所打扰。
昆特显得异常激动
当分析完毕后，昆特胸有成竹的说，要知道事情的真相，还需要问其本人。随后他打开了通讯，接通的却是BSAA负责人奥布莱恩。昆特说，灰猎犬根本没有回归，这一切都是幌子，都是奥布莱恩亲手策划的。奥布莱恩显得很高兴，表示没有白付给昆特薪水。
奥布莱恩是主谋？
昆特表示在这台电脑上发现了些遗留的记录，打算给奥布莱恩发送过去，但就在这时头顶上传来了飞机的轰鸣声，电脑报错，他们被FBC所检测到了。奇斯想拉着昆特离开，但昆特却热血沸腾起来，快速着敲打着键盘发送情报。在传输开始加载的一刻，两人头顶的建筑开始破碎，一阵强光闪过，随后是一片死寂。
活宝兄弟的遗照（不是）
对讲机另一头的奥布莱恩尝试呼喊，却没有得到任何回应。几架飞机对机场进行了大范围的轰炸，抹除掉了所有的证据。奥布莱恩摔开椅子表情沮丧，而他背后的进度条却偷偷地动了起来。
进度条动了
昆特和奇斯被飞机轰炸下落不明，我们回到洁诺比亚女王号上。吉尔和克里斯进入了实验室，装有红色病毒的巨大装置就在他们面前。
病毒就在眼前
在走进控制装置的过程中，可以发现一本灰猎犬成员的笔记。他们利用这艘船完成了对浮岛的生化攻击，却在回程时也受到了病毒的感染，害人的人自食其果。控制装置需要通行码才能释放中和病毒的中和剂，克里斯留在这里研究操作，吉尔去搜寻楼下的房间。
二人分头行动
实验室里有一个布置有红外线激光的走廊，利用“起源”的探测能力，吉尔顺利进入了里面，并获得了一份FBC探员的日记。在浮岛事件后，他们立刻封锁了这艘船用于对T-深渊病毒的实验，并且研发出了疫苗。灰猎犬只不过是棋子，是摩根·兰斯提尔将病毒给了恐怖分子用于袭击，又反手将他们所摧毁。摩根是真正的主谋，而这一切是为了扩大FBC的影响力。
摩根是主谋？
房间周围都是被病毒所污染的水，里面似乎有着什么生物，并在不断攻击着房间的玻璃。没时间管这些，拿到了FBC探员身上的疫苗后，吉尔进入了更里面的房间。在为自己注射疫苗后，吉尔下载了通行鉴别码。突然一处玻璃破裂，带有病毒的红水涌进房间冲翻了吉尔，所幸疫苗有效，吉尔并没有被感染。
姐姐你怎么又被水淹了
吉尔回到控制装置使用了通行码，病毒开始中和，而屏幕的画面上出现了摩根。摩根早就知道奥布莱恩和雷蒙德一直在追踪调查他，但他没有考虑到从浣熊市中活下来的STARS——克里斯和吉尔。为了杀人灭口，摩根释放了大量的B.O.W，但都被一一消灭。病毒的中和也结束了。
摩根现身
扳倒保护伞的二人组并不是这么容易解决的，摩根有些失望，但似乎这并不是他的底牌。他表示自己不会容许哪怕很小的问题，于是他要现身解决这最后的麻烦，而这个麻烦就是奥布莱恩和BSAA。
危机还未解除
他向二人展示，太阳神卫星还在瞄准着洁诺比亚女王号，看起来摩根依然稳操胜券。
似乎事件已经走向了穷途末路，BSAA得知了真相，但为时已晚。吉尔和克里斯，以及奥布莱恩会怎么解决这个死局呢。欲知后事如何，且待下回分解。
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