不知过了多久，乔尔从昏迷中醒来，他发现在自己躺在一间病房内，身边有柔和的灯光，病床又软又舒服，不过头部还隐隐作痛。他转过头去，看到了一张熟悉的面孔——马琳，火萤皇后。他以为自己看错了，或者还在昏迷中做梦，直到马琳开口说话。
“欢迎来到火萤。”马琳指了指旁边的持枪士兵，就是他用枪托砸昏了乔尔，“真的很抱歉，他不知道你是谁。”
这是马琳的声音，不会错，还是那种低沉的黑人声线，还是那张精瘦的脸和卷曲的黑发，我们终于找到火萤了。艾莉，可是艾莉？
“艾莉在哪？”乔尔记得她在他面前停止了呼吸，顿时又陷入恐慌。
“艾莉没事，他们把她带回来了。”马林坐在椅子上说道。
谢天谢地，我就知道她不会有事。乔尔悬在半空的心终于放下，艾莉也许正在某个同样的病房内休息，她现在是火萤最重要的宝贝，他们会像照看公主那样照看她。他如释重负，心中有一种解脱感，这大概就是完成使命的感觉。接下来火萤会在艾莉身上提取抗体，制成疫苗，而后他和艾莉会有很多选择，不过他只希望一切都结束后离开这里，去汤米的小镇生活。
“这么远的路程，你是怎么做到的？”马琳的语气中带着钦佩，在漫长的一年中，她几次都放弃了幻想，因为不可能有人带着一个小女孩在充斥感染者和恶徒的世界里横跨大半个美国，她无法想象谁能做到。
“因为有她在，她拼了命想来这里，这大概就是命中注定。”乔尔回答。
马琳缓缓起身。“为了横穿这个国家，我们失去了大部分成员，几乎快一无所有。这个时候你出现了，将她带到了这里，或许这就是命中注定。”马琳有些伤感，但又对未来充满希望。
“带我去见她。”乔尔一边下床一边说。
“你不用在担心她了，我们会接手。”
“我会担心，让我见见她就好，拜托。”
马琳犹豫了一下说道：“现在不能见，她正准备接受手术。”
“你在鬼扯什么，手术？”乔尔有了不好的预感。
“医生跟我说虫草菌在她体内起了异变，所以她才能免疫，只要全部移除它，他们就能用逆向工程做出疫苗，疫苗。”当马琳说出最后两个字时几乎饱含热泪，她和火萤奋斗至今就是为了恢复往日的人类世界，而疫苗将是对抗病毒的终极武器，是人类命运的转折。
“虫草菌蔓延到哪里了？”如果乔尔没记错的话，病毒进入人体后会第一时间侵入大脑，那么异变的虫草菌一定也会留在艾莉的大脑，如果要全部移除它们的话……
“大脑。”马琳犹豫了片刻才说出这两个字，眼神变冷，似乎已经做出准备失去艾莉的选择。
乔尔明白了，如果想要提取疫苗，如果火萤想要完成自己的使命，他们就得先杀了艾莉。这一点不可接受，不论什么理由也绝对不行。艾莉是无辜的，她还天真的以为只要从身上抽一点血就可以制作出疫苗，她横跨半个美国来这里不是为了让火萤杀死自己！乔尔已经失去过一个女孩，不能再失去第二个。
“给我停手，去找别人。”乔尔竖眉说道。
“没有别人。”
“听好了，告诉我她在哪……”乔尔刚往前走了一步，就被士兵从身后踢中腿关节撂倒。
马琳俯视倒在地上的乔尔说：“你的感受我懂，但是不管你以为自己有多难过，都比不上我经历过的一切，艾莉出生时我就见过她，我跟她的母亲保证过会好好照顾她。”
“那为什么还要做这种事？”乔尔说。
“因为这件事不只是为我，或者为她，这件事是为了拯救全人类，该死的我别无选择！”
乔尔摇摇头坐在地上，拯救全人类？我对这件事情毫无兴趣，这是你们所谓的使命，不是我的，更不是一个小女孩的。二十年前的那个晚上，莎拉并没有死于感染者或者病毒，她是被一个士兵用冰冷的子弹射死的，而那个士兵当时一定也认为自己在拯救人类，是吧？所以别跟我说拯救世界，这不是杀人的好理由。
“对，你不断跟我扯这些歪理，这只是你的一面之词。”乔尔说道。
马琳不再是友善的眼神，她像看着犯人一样看着乔尔，这个男人并不理解火萤的使命，他是一个威胁。“把他关起来，如果他敢轻举妄动就立刻射杀。”她又对乔尔说，“别敬酒不吃吃罚酒，乔尔。”
马琳说完便走出房间，去安排手术的相关事宜，她不想再将时间耗在乔尔身上，尽管这很冷酷，但这也是使命的一部分。
火萤皇后离开后，士兵走到乔尔身边，用手枪指着他，然后命令的口吻说道：“起来。”
乔尔缓缓起身。
“走。”士兵让乔尔走在前面，走出门口时又在他肩膀上狠狠推了一把，“快给我走，你站着干什么，有话快说。”
“走那边？”乔尔故意拖延时间，他想要尽快摆脱这个该死的士兵，因为艾莉就要做手术了，火萤很快就会杀死她。
“这边！”士兵用枪口指了指左边。
乔尔一步步走在前面，士兵与他保持两步的距离，两人从病房走到昏暗的走廊，往马琳吩咐关押他的地方而去。路过接待台时，乔尔忽然看到接待台里放着他的背包和武器，原来他们把这些东西放在这里，也许马琳一开始并没有把他当作敌人。他不能跟着士兵走进牢房，于是决定在这里放手一搏。
他突然停住脚步，这个动作惹恼了士兵，后者警告道：“你他妈的又在搞什么鬼，给我继续走。”
乔尔仍然不动。
士兵用枪口抵住他的后背，威胁道：“我说继续走！”
乔尔感觉到了手枪的位置，突然向后抡起手肘打在枪托上，同时猛地躬下身子。士兵几乎在同一时间开枪，但是枪口已偏，子弹掠过身体击中墙壁。乔尔像野兽翻身一般擒住士兵的胳膊夺下手枪，然后用枪托重重在对方脸上砸了两下，鼻血流了下来。
“手术室在哪？”乔尔把士兵按在墙上，枪口抵着肚子杀气腾腾地问道。
士兵没有第一时间作答。乔尔怒道：“我没时间跟你耗。”然后开了一枪，“在哪里？”，又开一枪，打烂了他的肚子。
士兵疼得几乎断气，发出可怕的喘息，艰难蹦出几个字：“在顶楼的最里面。”
乔尔松开手，让士兵从墙上滑落，光滑的墙面上留下几道血印。他又用一颗子弹打爆了士兵的头，然后拿起接待台里的背包和武器迅速离开。附近传出火萤士兵的喊声，他们被枪声惊动，正往这边奔来。他没时间继续纠缠，手术室就在顶楼最里面，必须赶在医生们动手前救出艾莉。
不知从何时开始，当他看不到艾莉时，就会急得像丢失孩子的野兽。当他知道艾莉身处险境时，心中的野性就会爆发，此时根本不在乎任何人的性命，所有阻挡他救回艾莉，或是想要伤害艾莉的人都该杀，而事实上他也从来不会手软。在猎人的地盘如此，在盐湖城也如此。他就像一柄杀人无数的剑，艾莉则是剑鞘，当她在身边时，他会有所收敛；当她不再身边时，他便饮血止渴。
乔尔一路向楼梯口奔跑，昏暗的走廊出现手电的白光和急促的脚步声，几个士兵分头所搜。他们已经看见躺在墙边的尸体，知道马琳口中那个“私运客”逃脱了控制——他是个极度危险的人物。
乔尔从走廊的窗口跳进另一间病房，躲开了士兵的搜寻，同时用匕首干掉一个落单的士兵，拿走了他身上的突击 B Q。在地形复杂，杂物堆积的医院里搜寻一个人并不容易，何况火萤要找的是一个身经百战的家伙，他手上粘过的血会让每一个火萤士兵感到吃惊。他绕过低矮的窗台钻进药房，一直潜到三个士兵身后，然后端起突击 B Q扫射。两名士兵身中数枪顿时倒毙，第三人受伤倒地但是还未断气，乔尔用一台心率检测仪砸碎了他的脑袋，然后收拾子弹向楼梯方向跑去。
圣玛丽医院内顿时响起警报，几乎所有的火萤士兵全部出动，他们要在更大的麻烦发生前抓住，或是杀死乔尔，乔尔亦是同样的打算。硕大的医院中，一场充满血色的猫鼠游戏拉开帷幕。今晚很多人会死，但其中绝不会有艾莉！乔尔此刻终于明白，他的使命不是将艾莉送至火萤，而是让她活着，让她在安稳的日子中长大，很显然，他还没有完成这个任务。
他向楼梯方向移动的时候，又有两个士兵从其他地方赶来，他们一边隐藏一边寻找乔尔，却被后者早早发现。当乔尔用弓箭干掉一个人时，另外一人还毫无察觉，于是乔尔又用弓箭射穿他的喉咙。两个人的尸体清开了一条道路，乔尔冲到楼梯口的大厅，忽然听到楼梯上传来杂乱的脚步声，他立刻像猫一样躲进阴暗的大厅接待台。几秒钟后一小队火萤士兵从楼上冲下来，至少有七八人，他们判断敌人应该还藏在这层楼里面，于是没看接待台，直接向走廊深处冲去。
乔尔趁机向楼上狂奔，径直冲到最顶层。他看到挂在墙上的楼层图，确定了手术室的方向——这是一栋环形楼，手术室在大楼另一侧，他甚至能从窗户看到手术室白色的门。艾莉，等着我，一定要等着。乔尔期待那些医生还没有动手，否则就是杀光这里所有的人，也不会平息他的仇恨。
顶层的守备同样森严，不过刚才的战斗都发生在下层，火萤的人不会想到乔尔已经鬼魅一般来到顶楼。前往手术室的两条走廊都有士兵驻守，不过好在这里房间够多，它们是乔尔最好的掩体和通道。他从窗户鱼贯而入，避开视野开阔的地方，在病房间隐藏穿梭，捂住嘴巴割开了一个挡路士兵的喉咙，然后轻轻将尸体推倒床下。当他潜到一扇隔离区域的大门时，又从身后拧断了一个倒霉士兵的脖子，成功进入距离手术室最近的区域。
这里的墙面上印有很多防疫标志，还有几间用厚篷布搭成的实验蓬，里面放置了各种仪器，但是能看出来已经很久没有使用过。再往前，地上出现很多生锈的氧气瓶，试验台上放着落满灰尘的烧杯烧瓶，还有字迹潦草的实验记录。乔尔躲过守卫，快速穿过这片区域，终于看到走廊尽头的两间手术室。
第一间手术室里只有冰冷的手术台和熄灭的无影灯，当乔尔走进第二间手术室时，从里间窗户的投影上看到三个医生正围在手术台前。乔尔的心脏骤然紧缩，立刻推门冲进去。
艾莉就在这里，可怜的女孩刚被实施完麻醉，换上了手术服，躺在淡绿色的手术台上。三位医生穿着干净的手术服，戴着口罩，正在做最后的准备工作。其中两名男医生在检查手术工具，另外一名女医生在调整装满液体的药包。乔尔的闯入让三人大惊失色，一位最年长的医生是当今世上仅存几位的生物学家之一，他喊道：“你要做什么！”
乔尔没有理会，径直走向手术台上的艾莉。
年长的医生立刻拿起手术刀欲作自卫，喊道：“我不会让你带走她的，这是我们的未来，想想我们以后可以拯救多少生命！求你了，别再过来，我是认真的。”
乔尔对这些话无动于衷，抢下医生的手术刀，一刀刺进他的喉咙。医生顿时血流如注，痛苦倒地，他成为这间手术室唯一的牺牲者。女医生悲哀地喊道：“不！你这残忍的混蛋。”
“凯莉，闭嘴。”另一个躲在墙边的年轻男医生说道。他明白自己根本不可能阻止乔尔带走艾莉，只要他不要再杀人就好。
艾莉还在呼吸，她只是被麻醉了。乔尔无视另外两人，抱起艾莉从手术室后门快速离开。此时大楼里除了警报声鸣响，发着黄红亮光的警示灯也开始闪烁。火萤士兵未在下层找到乔尔，大部分已经攀上顶层。
“没事的，艾莉，没事的我的宝贝，我会带你离开。”乔尔的心里恐惧与欣慰交织，他总算在艾莉被杀死前找到了她，但他还不知该如何离开火萤的地盘。周围的脚步声凌乱，人影与手电的白光闪动，火萤的人在怒骂呼喊，他们誓要找到乔尔和女孩。乔尔几乎是凭借本能寻找出路，还要躲避众多敌人的追杀。
终于，他看见一个还亮着灯的电梯，打开电梯门，此时火萤士兵已经远远发现他们。乔尔冲进电梯躲过了从侧面射来的子弹，他立刻按关门按钮，电梯门在火萤士兵赶到前关闭，乔尔和艾莉下行，电梯停在了医院负二层停车场。他在走出电梯门之前按下了红色的制动按钮，这台电梯暂时无法上行了。
他觉得敌人暂时没可能追来，可当他走出电梯时，马琳端着手枪从黑暗中出现。
“你救不了她的。”马琳厉声道，“你就算把她带出这里，然后呢？她能躲着那些循声者多久？不然就是沦落到被人奸杀。”
“那不是你能决定的。”乔尔抱着艾莉说道。
“她是自愿的，而且你也知道！”马琳用力说出这几个字，她太需要艾莉了，不，整个火萤，整个人类都需要艾莉。“听好了，你还是有机会做出正确的选择，她不会有感觉的，相信我。”马琳轻轻移开对准乔尔的枪口，将双手摊开，以表示她并不想杀死对方。
一个艰难的选择抛给了乔尔，一边是最爱的人，一边是全人类的命运。该何去何从，每个人都会有自己的答案，但选择的过程一定都不轻松。
乔尔开枪了，子弹射中马琳的腹部，致使她痛苦倒地，她的枪掉在地上被乔尔一脚踢开。刚刚还在电梯里时，为了以防万一乔尔将手枪放在手里，又藏在艾莉的身体下面。因为他抱着艾莉，手枪很难被看到，所以他才可以在马琳眼皮底下偷偷开枪。至于开枪的理由，他选择做一个自私的混蛋，因为只有这样艾莉才能够活下去。莎拉的死带给他无尽痛苦，也让他变成了一个自私冷酷的人，为了不让悲剧再次上演，他只能将这样的人做到底。至于拯救世界这种事，并不是自己的使命，也不应该让无辜的艾莉牺牲自己。这么多年来，他一直憎恨这个世界，这个世界充满罪恶，当然他不否认自己也是一个恶人，但如果世界是罪恶的，它就不值得被拯救。
乔尔从马琳身上拿到车钥匙，打开了停在旁边的一辆黑色商务车，将艾莉放在车上，关上车门。他又走到马琳身前，掏出手枪。
马琳痛苦地趴在地上，鲜血不断从伤口涌出。她看见乔尔走来，立刻哀求道：“等一等，放过我，拜托。”
乔尔犹豫了一秒说道：“你只会对她穷追不舍。”话毕，他开枪射穿了她的脑袋。