阿米婭小隊在核心區廢棄設施石棺中將博士甦醒，卻被整合運動成員闖入，解決闖入者後，意識到不對的阿米婭發現與凱爾希醫生的遠程通訊切斷後決定讓博士再度指揮羅德島並與遭到整合運動的襲擊而立刻趕來的杜賓教官領導的E2小隊匯合。短暫商量後，決定按計劃撤離切爾諾伯格。
（0-1坍塌）阿米婭與杜賓帶領的救援小隊在喚醒博士退出石棺後目睹了切爾諾伯格的混亂景象——整合運動痛切爾諾伯格人四處燒殺搶掠，秩序已然崩潰。
在徵得杜賓的同意後，阿米婭秉持著羅德島的信條，在明知應該撤退的情況下，為了救人與救援小隊毅然出手。
解決完敵人後，阿米婭卻因感染者的身份被平民恐懼，由此道出了礦石病。烏薩斯在宣傳上讓民眾恐懼感染者，到了抓捕感染者的時候，民眾自然就習以為常，甚至拍手稱快。所以整合運動選擇了對待感染者尤為冷酷的切爾諾伯格。
留給他們的時間不多了，三個小時之後天災將會吞沒這個城市，必須趕在天災前撤離切城，此時，弒君者已經注意到開始了追蹤。
（0-2守衛）
爆炸，騷亂，火光，巷戰……整合切爾諾伯格都陷入了混亂，一切都超乎了想象。電視裡播放著勝利的喜悅，而在現實中，一切都在預示著切爾諾伯格的毀滅，一點點摧毀烏薩斯軍警的榮光。
正在眾人談話之際，救援隊伍與整合運動正面接觸開始戰鬥。在近衛幹員解決後，遭遇了烏薩斯軍警，一觸即發之際，殺出了弒君者領導的特殊小隊。面對整合運動和阿米婭的提醒，烏薩斯軍警放過了羅德島一行，杜賓與阿米婭帶領各小隊趕往第一匯合點。烏薩斯軍警與弒君者小隊正面對抗。
（0-4混戰）
救援隊伍撤退中與趕來支援的ace完成匯合，同時整合運動成員也追至，杜賓指揮E2小隊應敵，但Ace建議優先後撤繼續向下一匯合點移動。在匯合點附近Ace得知並接受博士失憶的事實，並表示依然願意接受指揮，率領在匯合點附近行動的E3小隊支援杜賓，與阿米婭的法術重創整合運動
（0-6強擊）
殘酷的整合運動驅使著感染的野獸讓幹員們心寒，在結束戰鬥後，眼下的當務之急依然是撤離切爾諾伯格。
（0-7感染）
喘息之際，眾人討論起整合運動的古怪行動，杜賓指出整合運動的掌控者將士兵比作棋子以仇恨和恐慌餵養。此時，隊伍正前方盤踞著敵人的輕裝甲部隊，戰鬥無可避免。
而與臨光的E4小隊失去聯繫的恐慌也在隊員間蔓延。與此同時，阿米婭一行人陷入了弒君者小隊的陷阱，遭遇了戰場分割，與偵查干員失去了聯繫。與整合運動領袖的戰鬥正式開始，杜賓教官指揮，狙擊幹員壓制衝鋒，重裝幹員進行防禦，正當Ace準備出手時，整合運動的另一頭領梅菲斯特出現打斷了戰場。
（0-8狩獵）
名為梅菲斯特的男孩接管了戰場，隨著弒君者的離去，帶著不可一世的狂妄像羅德島發出邀請來一場祭祀式的競賽。談話之際杜賓與阿米婭發出信號彈，並準備強行突圍，卻以失敗告終。在杜賓Ace準備再度突圍之時，梅菲斯特卻道出了與弒君者不同的目的——博士是什麼從哪裡來，核心區發生的事他一直在注視著，
（0-9臨光）
面對著梅菲斯特的狂妄，羅德島開始突圍，卻在梅菲斯特類運用象棋走法下達精準命令下，羅德島小隊竟顯出頹勢。危機時刻，耀騎士臨光衝破了敵人的陣勢，領導E4小隊及時趕到
（0-10困境）
臨光的質問與諷刺激怒了梅菲斯特，命令名為浮士德的狙擊手悍然出手。
臨光憑藉盾牌擋開了浮士德的第一發弩炮，在第二發弩炮發射時，Ace指揮E3小隊狙擊幹員及時干擾壓制。知曉了敵人兼具機動性與威力，眾人不敢拖延，阿米婭指揮E1小隊射手與自己壓制整合運動，E2小隊用最大火力撕開防線，在梅菲斯特暴怒之時，臨光領導E4全體衝擊地方陣型，打開了包圍之勢。（0-11突圍）
突圍成功，可敵方的實力給眾人留下了深刻的印象，在臨光的開導鼓勵下，阿米婭走出了自責。開始繼續撤離。而另一側，梅菲斯特與浮士德的對話中幾近溫柔，休整之後重新投入到了他們的事業當中。
至此，黑暗時代開始…
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