尼迪拜亞王國的興衰
一切罪惡都要從一朵花說起，但這朵花本身卻一無所知。
太陽階梯花（Sonnentreppe Flower）
很久很久以前的新石器時代，在西非的一個洞穴裡，一朵太陽階梯花靜靜盛開，此時它還不知道，在這附近，有個尼迪拜亞人正飢腸轆轆，當他看到這朵美麗的花朵時，立刻飢不擇食，沒有追究它是否可以食用，便把它塞進了嘴裡。
然而，太陽階梯花是有毒的。
然而的然而，這個尼迪拜亞人不但沒有死，反而因為花朵的“毒性”，獲得了超人的能力，這位幸運兒從此成了尼迪拜亞部落的神，被視為“神王”，也是從此時起，這個部落的命運之輪滾滾向前，並且偏離了最初的方向，太陽階梯花的“毒性”，讓沒有因它而死的人成為了工程學大師，他們能夠製造出石器時代，乃至青銅時代的文明都無法製造出的石頭陷阱和機關，同時，在洞穴生活的他們，還發現了一種反射材料，能讓陽光穿過洞穴，讓那裡充滿白晝的亮光，這種技術也被用於軍事，製造出了一種跟今天的激光十分相似的光束，用以對付外來入侵者。
尼迪拜亞王國（Ndipaya Kingdom）
就這樣，尼迪拜亞迎來了突飛猛進的發展，這個文明逐漸形成了一種圍繞太陽階梯花展開的習俗：每一個想要成為神王的人，皆需經過一系列考驗，其中最重要的，就是食用太陽階梯花。如果吃完死了，那就死了，如果沒死，那就一戰封神。
然而如此發達的尼迪拜亞城最終還是陷落了，從考古證據看，它很可能毀滅於一場跟變異動物的戰爭，這場災難後，仍有幸存的尼迪拜亞人生活在他們原來的領土，或者附近的沼澤區，甚至保留著些許軍事力量，但他們再也沒有能力復興這座城邦，他們當中也沒有再出現過能成為神王的領導者。
尼迪拜亞被迫退出了歷史舞臺，不過，當它再一次出現在人們的視野中時，便掀起了腥風血雨。
十五世紀：光明神教的降臨
狼之谷（Valdelobos）
《生化危機》大宇宙的歷史，相對平靜地來到了十五世紀，此時，在西班牙的一個偏遠山區狼之谷，一枚恐怖的種子開始默默孕育，光明神教在這個無人打擾的地方，肆意生長，這個宗教的可怕之處，在於它崇拜的東西，是一種有節肢動物特徵的寄生蟲，名叫普拉卡，這個詞在西班牙語裡意味著“瘟疫”。
光明神教（Los Iluminados）
普拉卡對人類的殘害，可能遠早於十五世紀，考古發現在青銅器時代的西班牙洞穴壁畫藝術中，展現了相關的人祭儀式。不過，隨著研究的深入，尼迪拜亞王國的名字再次出現，對王國遺蹟的考古中，發現了新石器時代的普拉卡遺骸。
普拉卡（Plagas）
普拉卡為無性繁殖，它們的卵會跟隨宿主的排洩物從體內排出，在衛生狀況不佳的情況，卵會通過各種途徑，進入其它動物的消化系統，在新宿主的體內，這些卵只需要幾天時間發育成熟。
民風淳樸的加納多斯（Ganados）
普拉卡的宿主被稱為加納多斯。因為普拉克作用於神經系統，所以加納多斯的行為會被影響，大多數都會越來越暴力。而且，在宿主的大腦被徹底破壞前，他們會跟其它宿主形成社會群落，繼續日常生活，估計這也是光明神教存在的前提了。
然而，光敏神教的秘密，很快飄出了狼之谷，崇拜“瘟疫”，任哪個正常人聽來，都很邪惡，格雷戈里奧·薩拉查伯爵便是無法接受的一員，而且他還有能力對邪教發起聖戰，他率兵來到村莊，抓捕宿主，讓他們排成一排，用劍處決，這種死法或許是最輕鬆的，還有被定在木樁上活活燒死的加納多斯。
格雷戈里奧·薩拉查伯爵處決加納多斯
雖然是古代人，但薩拉查伯爵應該也有一些傳染病知識，他知道，村裡的加納多斯易除，可暗處的普拉卡難尋，狼之谷有個小山丘，山丘下的湖邊和湖底，都有地形複雜的洞穴，光是這種地方，就足以藏汙納垢，伯爵最終採取了那個很有效率的辦法：創立隔離區。
薩拉查伯爵在洞穴上建立起城堡，之後，他的子子孫孫都駐守在這裡，以封建領主和城堡堡主的身份，處理該地事務，城堡區域和村莊之間，由峽谷和大片水域隔開，通過這一系列的措施，薩拉查家族確實成功地封印了普拉卡，天主教又重新成為了狼之谷的主流信仰。由於任何強大的家族都會產出敗家子，我們還得給這個成功加上期限，不過，那就是幾個世紀之後李三多的麻煩了，十五世紀的我們，還可以先擺擺爛。
1918年~1920年：從西班牙大流感走出來的母神米蘭達
米蘭達的出生日期不詳，唯一確定的是，她出生於十九世紀末，1909年，她生下了女兒伊娃，這是她一生中唯一的孩子。很不辛，伊娃10歲那年，西班牙爆發了大流感，當時的醫療條件對此束手無策，許多人都因病喪生，其中就包括伊娃。
年輕時的米蘭達和女兒
墓地爆滿，米蘭達只能帶著女兒的屍體，前往村莊外的波特農田，她埋葬好女兒後，自己也準備了結性命。米蘭達走進農田附近了一個洞穴，希望死後不被人打擾，又能近一點陪著女兒，但在這裡，一個巨大的遠古超級真菌群落吸引了她的注意，米蘭達伸手摸了摸，奇怪的景象猛然從指尖傳到大腦，她的眼前竟出現了成百上千的人影，那些人的一生像幻燈片在她面前上演，這位母親一下子就從紛亂的影像中，看到了熟悉的生活片段，居然是伊娃的。這讓米蘭達產生了一種想法，這種“黴菌”，或許能讓女兒起死回生，她將其敬為“黑之神”。
被米蘭達視作“黑之神”（Black God）的菌根
“黑之神”是否有此功能呢？後來我們知道，這種黴菌會吞噬那些剛下葬不久的人的記憶，米蘭達看到的，正是它“吃掉”的記憶。
米蘭達當然也知道，這一復活計劃要正真實施，還需要大量實驗和研究，她帶著一些黴菌，走出了山洞，先拿感染了流感的村民下手，真地“治好了”他們。米蘭達趁熱打鐵，立刻在當地教堂展示了自己的“神力”，很快，她就被村民們視作“母神”，一個以她為首的新宗教誕生，迅速取代了當地基督教的位置。
母神米蘭達（Mother Miranda）
私底下，米蘭達在村子裡搞了一間地下臨時實驗室，專門研究“黑之神”，其中一項實驗中，她用黴菌感染了寄生線蟲，製造出了船新品種，她把它叫做Cadou，也就是“禮物，恩賜”的意思。
“恩賜”
米蘭達利用她在村裡的威望，把“禮物”植入到了各色人等的體內，上至貴族，下至農民，她想通過跑量，來找到能夠成為超級宿主的人。一旦成功，她會把從黑之神得到的伊娃意識副本，轉移到超級宿主體內，通過這種方式，賦予女兒第二次生命。絕大多數實驗都是失敗的，被實驗對象要麼死亡，要麼變成了狼人。狼人的獸性威脅到了村民，米蘭達將它們統統趕出了村莊。
狼人（Lycans）
實驗中有四個人存活了下來，也沒有變成狼人（但也變得十分抽象），他們就是曾經統治該地的“四王”的後代：阿爾西娜·迪米特雷斯庫（Alcina Dimitrescu）、卡爾·海森堡（Karl Heisenberg）、唐娜·貝尼維恩託（Donna Beneviento）和塞爾瓦託·莫羅（Salvatore Moreau）。但進一步的研究發現，他們當中並無適合“盛放”伊娃的載體。米蘭達沒有因此摒棄他們，轉而讓他們成立了類似委員會一樣的組織，繼續他們對該地的統治。不得不說，米蘭達很有領袖頭腦，懂得可持續發展。
村裡的四大家族（Four Houses）
村莊的生活，繼續這樣年復一年地走過了30個年頭，米蘭達也如此，接下來她還會如此，只不過，一場相遇，卻要讓另一個人和他身邊的世界翻天覆地了。
1950年代早期，村莊附近闖入了一個陌生地年輕人，英國醫學院學生奧斯威爾·E·斯賓塞(Oswell E. Spencer)，徒步來附近做研究的他迷路了，米蘭達救了他。由於兩人在做的研究很相似，斯賓塞便同意留下來當米蘭達的助手，他在這裡學到了影響他終生的知識，大受啟發，這讓他本就蠢蠢欲動的野心，變得更加騷動，但跟斯賓塞試圖用真菌或者病毒影響人類進化進程相比，米蘭達的格局就太小了，她只想復活女兒，最終，斯賓塞還是決定回到更大的世界。
四大家族合體版徽章
兩人的師徒關係還維持著，斯賓塞後來成立保護傘公司時，還以“村莊四領主（也就是前文說到的'四王'）”的“合體版族徽”為藍本，取中間的“傘形”圖案，做了公司的Logo，可見跟米蘭達的這段經歷，對斯賓塞的影響很深。
1960年代：斯賓塞創業記
如果斯賓塞當年沒有誤入狼之谷，他的人生軌跡會有什麼不同嗎？歷史不能假設，但我覺得他依然會把世界推向水深火熱，只是時間問題，因為他的“超人”觀念，很可能在他孩童時就形成了。
斯賓塞家族作為歐洲大名鼎鼎的貴族，對孩子們的教育十分重視，奧斯威爾·斯賓塞博覽群書，在人生觀形成的年齡，他接觸了二十世紀中期的優生學運動，並且因為很喜歡英國探險家亨利·特拉維斯的《自然史概論》，他對非洲充滿了嚮往。同時，少年時的斯賓塞還碰上了二戰debuff，世界觀很可能徹底被戰爭影響了。
奧斯威爾·E·斯賓塞（Oswell E. Spencer）
戰後，斯賓塞主修醫學，在大學校園，他結識了兩位密友：愛德華·阿什福德和學長詹姆斯·馬庫斯博士。
愛德華·阿什福德（Edward Ashford）和詹姆斯·馬庫斯博士（Dr. James Marcus）
有一年，斯賓塞獨自在東歐做徒步旅行，卻在冰天雪地中迷路，昏倒在了路邊，被米蘭達救起，在這裡，斯賓塞完成了他對黴菌變異、同化、複製生命等特性的研究，少年時優生學在他心中埋下的種子，在這片法外之地，如藤蔓般瘋長，斯賓塞再也無法偏安一隅，他必須回到現代社會，才能實現他心中的偉大抱負。
回到大學的斯賓塞像是變了一個人，或者說，他終於變成了內心深處的自己，接下來的世界被冷戰的陰影籠罩，這讓斯賓塞對人類更加失望，他愈發迫切地想要改變人類進化的進程，還要在人類社會中建立起更高的道德標準。這種願景並沒有什麼問題，但實現的手法呢？跟米蘭達一樣，他也想“感染”人類，只不過，他不怎麼看好黴菌，而是把目光投向新興的病毒學，他認為，他要的答案，就在那裡。
斯賓塞說服了兩位密友，跟他一起在病毒的海洋裡遨遊。
隨著研究工作的展開，時間線開始收束，本文開頭的尼迪拜亞，通過《自然史概論》中的敘述，進入到斯賓塞的記憶，當他開始研究病毒時，那朵傳說中的沉睡之花，再度在他的記憶中甦醒，他跟兩位朋友分享了這段信息，馬庫斯也認為，理論上，這種被叫做太陽階梯的花，在優生學領域確實很有前途，三人決定組織一次西非遠征，看看傳說是否真實存在。旅程非常順利，幾個月後，尼迪拜亞的遺蹟就被找到，1967年2月，馬庫斯帶著太陽階梯回來，在實驗室開闢了太陽花園，用來培育這種花朵，此後，他們又成功從花朵中分離出了病毒，也就是始祖病毒。
始祖病毒是一種逆轉錄病毒，屬於RNA病毒的一種，可對宿主的DNA序列進行重組
我們知道，始祖病毒只能讓極少數天選之人成神，多數情況下，它還是以殺人為主，但斯賓塞和馬庫斯的目的，是要批量“生產”超人，所以，接下來的研究重點就是，怎樣削弱始祖病毒的“負”作用。
馬庫斯比斯賓塞更加醉心於研究工作，但就在這時，馬庫斯所在的瑞士大學，以數據造假為由，開除了他。而斯賓塞比馬庫斯更擅長馭人之道，他瞅準這個機會拿捏了馬庫斯。科研工作不能用愛發電，斯賓塞表示很願意給“朋友”提供研究資金，但馬庫斯必須在斯賓塞旗下的實驗室工作，而且不能跟他們這個小團體之外的科學家接觸。為什麼我聞到了PUA的味道？
保護傘公司最初是一個醫藥公司，但它的野心從來不止於此
別看斯賓塞表面上像個金主爸爸一樣，他心中還是很清楚地知道，地主家的餘糧也不多了，為了完成資金積累，他建議成立一家制藥公司，也就是保護傘製藥公司。
阿克雷山區（Arklay Mountains）
同一年的年底，斯賓塞選址在美國中西部阿克雷山區修建的洋館，圓滿竣工，洋館下天然的石灰岩洞穴，被他改造成了地下實驗室，用來進行病毒實驗，這是一個秘密，除了保護傘的核心成員，不應該有其他人知道，但核心裡沒人會土木工程，必須依靠外援，紐約著名建築師喬治·特雷弗成了這個大冤種，當斯賓塞邀請他全家來吃竣工宴的時候，他說不定還很高興，說不定還因為工作太忙，要晚幾天到感到歉意。當時，特雷弗的妻子傑西卡，帶著14歲的女兒麗莎，先行出發，兩個無辜的女性一到洋館，就被斯賓塞的人帶走，關進了地下實驗室，她們將面臨比死亡更可怕的事：成為始祖病毒實驗的測試對象。傑西卡很快死亡，基因突變活下來的麗莎，則要在地獄中煎熬到1998年。
洋館
回到大冤種設計師身上，他最終還是來了，同樣被抓，雖然逃出關押自己的房間，卻在逃跑時，落入了自己設置的陷阱死亡，真是令人唏噓的一生。
喬治·特雷弗(George Trevor)一家
為了獲得更充足的資金支持，斯賓塞又將始祖病毒研究拆分成兩部分：不忘初心的優生學探索，和為美刀折腰的軍方生化武器項目，也就是後來為生化玩家熟知的“T病毒計劃”。
T病毒由馬庫斯博士開發，T就是暴君Tyrant的縮寫
如此一來，研究規模陡然擴大，先前西非之旅帶回來的太陽階梯，不夠用了，斯賓塞派僱傭兵，將尼迪拜亞後裔趕出了他們生活的地方，將花朵和病毒完全據為己有。
有一點必須承認，斯賓塞是個很有格局的反派，不光是因為他跟軍方合作，而是他已經想到了，要把手伸向社會的方方面面。1960年代末，他又結識了一位主張優生學的科學家，威斯克博士，兩人達成共識：只有人們從觀念上徹底接受優生學，始祖病毒才能更順利的傳播，那麼，教育就要從娃娃抓起。保護傘公司開始從世界各地挑選智力超群，基因優秀的兒童，將他們綁架，給他們最好的教育，等他們成年後，再從中選出更優秀的人，用病毒感染他們。這個項目主要由威斯克負責，所以也被稱作“威斯克計劃”。《生化危機》中最有魅力的反派之一，阿爾伯特·威斯克，就是該計劃的產物。
威斯克計劃（Wesker Project）
壞事做盡的斯賓塞權力越大，疑心越重，心眼越小，開始防著跟他創業的小夥伴們，加上他走得越來越遠，保護傘的初代金三角，早已貌合神離，各路湧動的暗流，都開始向一個方向匯聚，屆時，它們將跟現實世界裡的玩家相遇，揭開“洋館事件”的帷幕……
