古老的Nibel森林生活着很多栖息于黑暗的动物，毛绒绒的Naru和她的爸爸、四肢长长善于建造的Gumon一族、巨大的猫头鹰Kuro，以及许多未知的危险的生物。不知何时起，一棵灵树（Spirit Tree）在这片森林生根发芽，灵树给森林带来了光，并孕育出众多的精灵（Spirits），Nibel一时充满生机。
在一个风雨交加的夜晚，一片散发着光芒的叶子被从灵树吹落，叶子落到地上化作一只精灵，被路过的Naru抱起取名Ori。Ori和Naru度过了很多快乐的时光，他们建起长长的桥，饿了就摘果子充饥。
一天，灵树突然迸发耀眼的光芒后急剧黯下，自此森林凋敝，Naru将最后一颗果实让与Ori后衰亡，伤心的Ori独自探索森林体力不支倒下。这时，灵树再次亮起微弱的光芒，光芒恢复了Ori的体力。Ori继续前进，在森林深处发现了一颗光球，它是灵树光的核心Sein。
当初，在Ori被吹落后，灵树一直呼唤着它，那天耀眼的光芒也是为了寻回Ori，可这光却引来了猫头鹰Kuro，她愤怒地抓起Sein丢进峡谷，造成了灵树的枯竭和森林的枯萎。如今，灵树耗尽最后的光复活Ori，Ori背上使命，需要恢复三元素，并重新点亮灵树，继而拯救森林。
Ori首先前往银之树（Ginso Tree）恢复水元素，但银之树的钥匙被一只名为Gumo的Gumon拿走。Gumo在逃跑途中被落石砸中，Ori救了他，拿回钥匙后进入银之树成功恢复水元素。
接着，Ori前往荒芜废墟（Forlorn Ruins）恢复风元素，这里曾是Gumon一族的栖息地，灵树出事风元素受损后，这里却成为他们的冰棺。将风元素恢复后，Ori乘风而上，来到了Kuro的巢穴，一切因果解开，Kuro之所以攻击灵树，是因为灵树那日耀眼的光误杀了她的三个孩子。
在躲过Kuro的袭击后，Ori来到掘之山（Mount Horu）恢复了最后的暖元素，不料引发森林大火，并再次遭遇Kuro，千钧一发之际Naru奇迹般地出现护住Ori。原来在之前恢复风元素时，Gumo也跟着进入了荒芜废墟，并利用族人储存起来的光复活了Naru。
望着守护Ori的Naru，Kuro想起自己幸存的尚未孵化的孩子，她抓起Sein将它放回灵树。灵树再次迸发光芒，召下雨水熄灭了火焰，重新恢复了森林的生机。可惜作为黑暗生物的Kuro承受不住近距离的强光牺牲，Ori他们将Kuro的蛋带回燕子窝照料，故事暂时告一段落。
#奥日与黑暗森林# #Ori and the Blind Forest#