年代：公元1752 - 1760年，七年戰爭時期。此時中國所處朝代：清，乾隆年間。
地點：北大西洋（聖勞倫斯灣、紐芬蘭島）、紐約等地，今加拿大東南部以及美國東北部。
謝伊·帕特里克·科馬克（Shay Patrick Cormac，1731 - 未知）是一名出生在紐約的愛爾蘭裔移民，早年父母雙亡後，他曾服務於刺客組織，1756年叛變到了聖殿騎士一方。
我的運氣操之在我（I make my own luck）——謝伊的口頭禪
大財主彼得·貝克福德1710年死後，他收藏的伏尼契手稿散落在加勒比地區，愛德華·肯威在1715至1722年間收集齊了這些手稿。（《刺客教條4》）
1735年，阿德瓦勒帶著先行者之盒來到海地太子港。1737年臨走時，阿德瓦勒將先行者之盒交給了情人巴斯蒂安娜·約瑟夫。（《自由吶喊》）
1751年，伏尼契手稿和先行者之盒都落到了海地刺客導師——弗朗索瓦·麥坎達（François Mackandal，死於1758）手中。（前面在《解放》講過，麥坎達是艾芙琳的母親和師父共同的導師）
麥坎達派學徒“星期五”去調查位於太子港的先行者神殿，不料意外引發了1751年太子港大地震。聖殿騎士勞倫斯·華盛頓（喬治·華盛頓的哥哥）趁機偷走了伏尼契手稿和先行者之盒，並將其帶回了弗農山莊。
1752年，阿德瓦勒將此事告知阿基里斯，於是阿基里斯派謝伊前往弗農山莊。當謝伊刺殺勞倫斯·華盛頓時，發現他已得了重病，本就命不久矣。
1754年，謝伊從聖殿騎士手中奪回伏尼契手稿和先行者之盒後，找到了剛參加完“奧爾巴尼會議”的本傑明·富蘭克林。威廉·約翰遜爵士正邀請富蘭克林研究先行者之盒。（海爾森會在幾個月後來到北美，與富蘭克林相遇，並招募威廉·約翰遜等五虎將）
富蘭克林在奧爾巴尼的殖民地大會上，提出各殖民聯合的計劃。雖然當時計劃沒有被接納，但當中的不少內容之後在獨立戰爭中成為基本思想。富蘭克林演講時，背後的著名漫畫：要麼聯合，要麼死亡（Join，or die），後來在美國獨立戰爭中也廣為傳播。
富蘭克林用避雷針引閃電，從而為先行者之盒通電。被電流啟動的先行者之盒，顯示出伏尼契手稿中記錄的先行者神殿位置。
1754年幾乎同一時間，正在英軍服役的喬治·華盛頓因為被指控殺害法國軍官，無意間觸發了法國-印第安人戰爭。遊戲劇情對話中也提到了此事。
幾個月後，海爾森乘船來到北美，招攬五虎將重新組建北美聖殿騎士組織。（《刺客教條3》前三章）
1755年，得知里斯本（葡萄牙首都）有先行者神殿後，阿基里斯錯誤地相信那裡藏有金蘋果，於是派謝伊前往里斯本，沒想到卻意外引發了1755年里斯本大地震（歐洲歷史上最強地震）。
謝伊這才明白，太子港和里斯本的大地震，都是由於誤觸了神殿中維持地殼穩定的裝置。造成這麼多無辜者的傷亡，謝伊急忙回到達文波特莊園，憤怒地指責阿基里斯，但其他人根本不相信他的話。
於是謝伊決定趁夜偷走伏尼契手稿，以防止其它城市遭此厄運。在偷手稿時，謝伊看到阿基里斯在牆上列出的聖殿騎士目標，其中包括海爾森、博區以及《刺客教條：解放》中的反派。
在刺客的追殺下，謝伊帶著手稿跌落山崖墜入大海，之後被喬治·門羅上校所救。
1756年，重獲新生的謝伊幫門羅上校打擊了由刺客控制的紐約黑幫，還從富蘭克林那忽悠到了榴彈發射器原型機。
1757年，門羅上校被法軍困於威廉亨利堡（電影《最後的莫西幹人》裡的就是這場戰役）。門羅上校投降後被釋放，卻在路上被印第安人截殺，謝伊及時趕到救下了門羅上校。然而不久後，謝伊敬愛的門羅上校還是被刺客殺害，手稿也被刺客搶走。
這一年，救回姐姐並報了殺父之仇的海爾森回到了北美，為謝伊舉行了聖殿騎士的入會儀式。《刺客教條3》的重要反派威廉·約翰遜、查爾斯·李也出席了這次會議，此時康納剛一歲，三年後他們就要去欺負年幼的康納了。
從此謝伊正式成為聖殿騎士的一員，他的任務就是協助海爾森，幫大英帝國打贏七年戰爭，並剿滅殖民地的刺客組織。
1758年，謝伊和海爾森在路易斯堡戰役中，協助著名航海家詹姆斯·庫克船長打贏了海戰。這場戰役扭轉了七年戰爭的戰局，之後的數年裡英軍逐步佔領了法國在加拿大的殖民地。
海戰後，謝伊和海爾森追上並殺害了阿德瓦勒。在面對海爾森時，阿德瓦勒提到他曾與海爾森的父親愛德華共事，如果愛德華還活著，他見到海爾森變成聖殿騎士一定會很失望。
1759年，謝伊繼續獵殺曾經的刺客夥伴，並幫助英國皇家海軍在基伯龍灣海戰（遊戲中作為傳奇戰役之一，不在主線劇情裡）中擊敗了法國艦隊，自此大英帝國在海上再無敵手。
1760年，阿基里斯找到了位於北極的神殿，謝伊和海爾森尾隨而至。（這一年查爾斯·李等人去欺負小康納去了，難怪海爾森不在場，原來他和謝伊去北極了）
決戰之後，謝伊奪回了手稿，並勸海爾森留阿基里斯一命。如果阿基里斯活著回去，可以讓刺客們知道手稿中記錄的這些神殿的危險，以防止刺客們繼續盲目地搜尋神殿。
海爾森接受了謝伊的提議，但為了確保阿基里斯不再構成威脅，他還是開槍射斷了阿基里斯的一條腿。
美國獨立戰爭爆發後，1776年，本傑明·富蘭克林簽署完《獨立宣言》數月後，被任命為美國駐法大使（1776 - 1785）。
得知先行者之盒在法國刺客查裡·多里安（《刺客教條：大革命》主角的父親）的手中後，謝伊也來到了巴黎。謝伊在富蘭克林的幫助下進入凡爾賽宮，刺殺了查裡·多里安，奪走了先行者之盒。
查裡·多里安臨死時還提到了美洲的刺客兄弟康納。
在凡爾賽宮，謝伊還見到了小時候的亞諾和愛麗絲，與《刺客教條：大革命》的開頭劇情相銜接。
“維持本組織的原則，以及我們的立場。
不得與人談論分享我們的秘密，也不可暴露我們工作的性質。
無論需要何種代價，至死都不得違反此規定。
這是我的新教條。
我是謝伊·帕特里克·科馬克，殖民地教團的聖殿騎士。
我已垂垂老矣，或許也更有智慧了。一場戰爭與革命已經結束，但另一場動亂正在蓄勢待發。
願理解之父指引我們……”
另外，遊戲中謝伊可以通過收集維京人的劍獲得維京人套裝，這個遊戲設定算是為《刺客教條：英靈殿》艾沃爾等維京人近千年前曾踏上北美的土地一事做了鋪墊。