發售日期：2000.4.27（N64）/2003.11.14（NGC）/2015.2.13（3DS）
《姆吉拉的假面》是《時之笛》的延續，無論是引擎還是建模很多都是直接採用的，不同於《織夢島》到《時之笛》的5年，《姆吉拉的假面》僅僅不到兩年就已經推出，同時本作評價也是褒貶不一。遊戲難度高、劇情有深度也就註定了其會出現兩極分化的評價。
《姆吉拉的面具》始於《時之笛》，在林克打倒蓋儂多夫之後，騎著他的馬──伊波娜──穿越迷蹤之森。戴面具的骷髏小子跟其妖精朋友──妲多與特爾──從林克那裡偷走了伊波娜和時之笛，並跑進一處黑洞窟。林克跟著他們，而骷髏小子把他變為德庫矮人。骷髏小子跟特爾丟下妲多跑掉了。由於妲多被她兄弟與骷髏小子背叛感到惱怒，她同意幫助林克變為原形。
林克跟著骷髏小子穿過洞穴到達塔米尼亞的時鐘鎮。在那裡他碰到了快樂的面具商人。商人告訴林克說如果林克能從骷髏小子取回時之笛與姆吉拉的假面的話他可幫忙。林克與妲多離開坐落於時鐘鎮中心、正在準備時間嘉年華的鐘樓驚魂。林克獲悉了月亮將在三天後墜落於塔尼米亞。他在第三天半夜於鐘樓驚魂塔頂與骷髏小子及妖精特爾碰面。林克無法取回面具，不過他拿到了時之笛並吹奏了“時之歌”，這將林克送回了他最早抵達塔米尼亞的那個時候。
快樂的面具商人教林克醫療之歌，這把林克變回人型，且留下了德庫面具。面具商人後來告訴林克，魔吉拉的面具會實現其佩戴者的願望，不過代價是以一種邪惡、毀滅性的力量佔有配戴者的身體。先民由於懼怕它所造成的大災難，“將面具永久地封印在隱蔽處”以避免它被不當使用。這當初封印面具的種族已經消失，而魔吉拉的面具的起源與性質皆已失傳。被魔吉拉的面具附身的骷髏小子，得為月亮成為塔尼米亞的威脅負起責任。
林克得在落木沼澤、雪山、大灣區和伊堪那峽谷之間穿梭。他得進入這四大區裡的神殿，藉由打敗裡頭寄居的頭目取得召喚四大巨人的力量以解救塔米尼亞。一旦所有四位頭目皆被擊敗後，林克召喚出巨人頂住了月亮朝塔米尼亞的墜落。魔吉拉的面具從骷髏小子身上升起進入月亮。在妲多的幫助下，林克追到月亮上並打敗了魔吉拉的面具。四大巨人隨後迴歸長眠，且妲多與特爾和自魔吉拉的面具控制下解放的骷髏小子再度聚首。快樂的面具商人拾起了魔吉拉的面具，檢查後說它蘊含的邪惡力量已經被淨化了。正當時間嘉年華開始時，林克騎著艾波娜離去。遊戲以刻著林克、妲多、特爾、骷髏小子、與四大巨人的樹幹殘株作為顯示幕後製作名單的背景做結。當該圖顯示時，“莎莉亞之歌”的片段在背景簡短地播放。
