我对于黑神话剧情的理解：
首先，最前提的就是天庭是一个非善形象，从影神图的直接拉轮回转世里的魂熔炼成天兵就不难看出，在这个前提下后续的猜测才能成立。
1.为什么一路上的黄眉等boss作恶多端却不受到制裁？
因为他们对付孙悟空有功，不太好找理由制裁，其次是期中大多是成本大于收益的事，如果只是祸害百姓的话没太大制裁的必要，而且对于天庭来说，最好的制裁方法就是等那个众所周知的孙悟空转世-天命人来制裁他们，从剧情中得知，鹤仙人这种大能是直接知道天命人的真实身份，而火焰山土地这个级别的也能大致猜到天命人是谁，所以天庭最优解就是让天命人去除掉这些boss，然后再派王灵管在天命人收集完五根后除掉他。
2.很多boss都想与天命人战斗的原因？
因为他身上有大圣根器，这里期中任何一样都是不得了的存在，黄眉赢了就能增强自己，扩大自己势力范围，甚至和弥勒佛叫板等，其他人也是一样，不过偏弱的boss是使用不了根器的，这也侧面反应了大圣的强大。
3.牛魔王和孙悟空到底是什么关系？
最开始是结拜兄弟，后来他也想给牛魔王搞个正道走（当时西行的孙悟空自认为那是正道），但是过程中也伤害了牛魔王，导致牛魔王选错了边。从牛魔王的影神图中的“有一位旧友，过去有些误会，如今他助我立了功”得知牛魔王后来是理解了孙悟空的所作所为。而孙悟空又用自己的死来让牛魔王立功，且唯独告诉了牛魔王他的根器会引起灾祸，碰不得。不过可惜的是天庭埋下的红孩儿祸根还是给牛魔王带来了灾祸。
4.为什么大圣要自杀？
这个是游戏里交代的不太明白的东西，从开头的剧情可以推测出是为了自由，但如果只是为了自由似乎难以立住脚跟，从和八戒的对话中得知，孙悟空预料到了天庭要“吃”他们的结局，就如同牛魔王等妖明明立功，却给了大圣根器让他们在未来承受灾祸。所以孙悟空为了防止自己在未来提前被吃干抹净，规划好了自杀来摆脱，把前世记忆存于杨戬眼中。但其实还有另一种可能，还是那段对话里“这贡品，本该给种地的人吃，我们吃了，他们就少吃一点”，可以看出孙悟空是对天庭的这个剥削制度是不满的，那会不会是孙悟空要摆脱紧箍，杀上天庭解放那些受压迫的平民？我当然非常希望真实的情况是后者，但前者似乎是更现实的。
5.为什么天庭知道天命人是孙悟空的转世却不去阻止？
这个第一个问题就部分解答了，就像灵吉要借天命人来拿回头颅，天庭当然也想借天命人来除掉些祸患，且他们也认为天命人没法真的复活孙悟空，不然就不会只派王灵官，而是派开头那样的阵仗了。因为杨戬影神图里杀了知道杨戬留有意的天兵，且借助了弥勒这种大能的帮助，可以看出保密工作应该是可以的，所以天庭应该认为会复活的是没有孙悟空意识的且为了凑齐六根不得不带上紧箍的猴子，也就是坏结局，这个结局对天庭来说还是好事。