《超级机器人大战 T》在游戏初始可以选择难度，其中简单难度和精英难度不需要考虑 SR 获得条件，随意攻关，但白金奖杯少不了全 SR 获取，并且获得 50 点 SR 的时候能够获得二重行动的强力芯片，建议尽量在普通难度、精英难度的情况下游戏。
整体游戏难度排序为：普通难度全 SR>精英难度>普通难度不考虑 SR>简单难度，因此推荐在精英难度下游戏，虽然敌军强度较高，但可以无视 SR 条件，无条件获得 SR，非常值得挑战。普通难度全 SR 的情况下，由于游戏难度会随着 SR 综合点数，自动提升至精英难度，并且还需要兼顾 SR 获得条件，因此实际上直接选择精英会相对简单。
攻略中机体配置描述均为我方配置，和参战机体，除了特殊注明关卡地形以外，一般关卡内地形均为「陆地 + 天空」。
第四十六话：斗志在冰原燃烧
初始：黑百合、神高达、16 名选定
增援：宗师高达
SR：4 回合内击坠所有阿比耶斯、伊法斯，并使用额外动作粉碎暴击击坠瓦西鲁蒙。
解说：SR 条件中指定的杂兵机体还包括在第一次增援中出现的敌人，若从关卡初期径直向敌人堆里冲的话，可能来不及消灭增援中指定的敌机。
达成 SR 条件后恶魔高达等敌机在西南方向增援，我方则有宗师高达前来增援。全灭敌机后进入剧情，多蒙和东方不败进入单挑环节，在这个环节中能操作的只有多蒙，顺利击败东方不败的话即可过关。
工厂：可获得 TacP 300，涉及与东方不败相关的隐藏要素，包括使用东方不败击坠一定敌机数、多蒙和东方不败均与恶魔高达战斗过、使用东方不败击坠恶魔高达、单挑战中看完两段对话后再使用石破天惊拳击败东方不败等。
关卡奖励：防御提升、SP 回复、高精度感应系统、S- 适配器、洗牌同盟魂
秘密关卡：流浪的哈曼
进入条件：在此前同时完成玛修玛、夜莺加入我方的条件后即可进入秘密关卡，此前选择独立路线的情况下可较为容易达成。
解说：本关主要为哈曼等人早期加入我方，完成关卡后可在 47 话之前提前改造这些机体。
工厂奖励：TacP 300，此外我方队伍增援前，夏亚击坠 3 机以上可再获得 TacP 200。
第四十七话 钢铁七人
初始：Z 高达、ZZ 高达全装甲、Hi-ν 高达、海盗高达 X1 改改、海盗高达 X1 全覆式披风、卡碧尼（哈曼）、12 名选定
增援：沙扎比 或者 夜莺，均由夏亚驾驶，驾驶哪架机体涉及夏亚隐藏要素相关、宗师高达，宗师高达与东方不败加入我方均涉及隐藏要素
SR：5 回合内完成关卡
解说：本关要求仅限 5 回合内完成关卡才能获得 SR，相对我方成员，敌方数量、体力量均处于压倒性的多，此外还会有新的增援，增援的 HP 一只将近 5 万，推荐在增援前线清理杂兵再消灭生化脑。初期杂兵消灭一定数量后，敌我双方增援，我方夏亚作为增援登场，驾驶的机体会根据玩家完成对应的夏亚相关内容而变化，驾驶夜莺的场合，沙扎比也会以换装机体的形式存入机甲库。
最后的 7 只敌机血厚，不过全部消灭即可过关，时间紧张的话立刻使用琉璃的系统掌握挂分析，热血魂等一口气消灭为佳。
工厂：5 回合内完成关卡。TacP 100
关卡奖励：金块 200000、射击提升、技量提升
第四十八话：期待绝望的人
初始：20 名选定
SR：3 回合内完成关卡。
解说：本关除了诺娃以外，其他初期配置的敌军就是全部，因此达成目的，只需要尽全力消灭敌人即可。由于本地图中遍布敌人，因此战斗力不上不下的机体建议不要出门，此外战舰也要注意保护，或者提前强化作为坚实战力。
工厂：使用魔神兰迪斯与诺娃战斗。TacP 100
关卡奖励：强化推进器
第四十九话： 迈向无尽广阔的未来
初始：炎神、海神、空神、16 名选定
SR：3 回合内击坠其他敌人后再满足胜利条件
解说：本关的 SR 条件中的满足胜利条件指的是消灭初期配置的两个 BOSS 拉班和诺娃即可。不过 BOSS 的 HP 降至一半后会给自己挂热血、不屈、集中、必中等精神，建议先用不屈削掉对方的不屈和热血，再集中火力击坠。
击坠两个 BOSS 后，大型 BOSS 会作为增援出现，具有 3 次行动、武器带有无法行动异常效果、超大范围地图炮等，建议围攻的主力机体带上精神免疫后再上前进攻，其他没有精神免疫的火力机体尽量使用必闪辅助来躲避。
BOSS 剩余 70% 左右 HP 的时候会触发魔法骑士小队强化剧情，BOSS Hp 全恢复，需要再打一次。注意剧情后魔法骑士三人娘会被强制移动到 BOSS 身边，要小心三人不能被击坠。
工厂：使用闪光之剑（新合体技）击坠迪波尼亚。资金 30000
关卡奖励：命中提升、攻击手、奇迹之证
第五十话：看不见的神之意志
初始：新型 Arhan、眼镜斗犬 TC·LRS、18 名选定
SR：5 回合内结束关卡，此外关卡结束前令任一驾驶员的 Exc 到达 10 点
解说：击坠一定敌人数量后，敌方大批量增援，增援的地上战舰合计有 5 只，一只 HP 48000，另外光子战舰还带有 Ace 效果，火力威猛，非常棘手，一定要尽早歼灭，地上战舰在紧贴一格子的情况下无法反击，可以利用这一点快速围攻。
整体布置方面，光子战舰会在西边增援、布罗肯会在东边增援、地上战舰则会在东北方向出现。总体上可按照由东向东北方向推进，东边的部队可以多配置些机体。
工厂：齐力可击坠一台以上的地上战舰。TacP 100
关卡奖励：圣瓦尔基里之火、昆特制感应器、因果律操作装置、格斗提升