《超级机器人大战 T》在游戏初始可以选择难度，其中简单难度和精英难度不需要考虑 SR 获得条件，随意攻关，但白金奖杯少不了全 SR 获取，并且获得 50 点 SR 的时候能够获得二重行动的强力芯片，建议尽量在普通难度、精英难度的情况下游戏。
整体游戏难度排序为：普通难度全 SR>精英难度>普通难度不考虑 SR>简单难度，因此推荐在精英难度下游戏，虽然敌军强度较高，但可以无视 SR 条件，无条件获得 SR，非常值得挑战。普通难度全 SR 的情况下，由于游戏难度会随着 SR 综合点数，自动提升至精英难度，并且还需要兼顾 SR 获得条件，因此实际上直接选择精英会相对简单。
攻略中机体配置描述均为我方配置，和参战机体，除了特殊注明关卡地形以外，一般关卡内地形均为「陆地 + 天空」。
第四十一话：大家的幸福
特殊地形：宇宙
初始：16 名选定
增援：Dann of Thursday
SR：三回合内由我军击坠扎古III 改、亚克托·德卡（裘尼）、亚克托·德卡（葵丝）、居拉·德卡（蕾森）
解说：本话的 Sr 达成也相对不难，被第三军尾刀的情况估计不太可能出现但以防万一还是需要注意一下。初期配置击坠一定敌人、或者中 BOSS 之后敌方出现增援。
工厂：使用哈洛克击坠法萨丽娜。资金 10000
关卡奖励：磁性覆膜、技量提升、回避提升、G-ER 流体
隐藏零件：阿尔卡迪亚号移动至要塞 SSX 正中央，可获得「追加机械臂+」
第四十二话：最后的 VTX 魂
特殊地形：宇宙
初期：暴旋霸王、16 名选定
SR：4 回合内击坠所有敌人，最后击坠瓦西鲁蒙
解说：击坠一定敌军后，敌方增援会以左右夹击的形式出现，再击坠一定数量，敌军再次会以左右夹击的形式增援。不依靠战舰指挥官技能的玩家如果先锋大队离得过远的话，战舰会处于被围攻的状态，需要注意。
工厂：使用主人公的新武装击坠瓦希尔蒙。TacP 100
关卡奖励：VTX 说明书、超级修复零件、命中提升
秘密关卡：来访者 X
触发条件：TacP 管理工厂 Grade 到达 5 级以上
解说：本关和之前出现的《机战 V》联动关卡一样，是与《机战 X》联动的关卡，《X》中登场的机体、人物会在该关卡中共斗，但不会加入我方。
关卡奖励：X之宝剑、X之宝盾
关卡分歧：
这次分歧分为 3 部分，包括「与夏亚共斗」、「与哈曼共斗」和「独自的道路」，分歧上没有分配不同的机器人，而是剧情上和地图配置的不同以及涉及的夏亚、哈曼等人物加入我军条件的不同等。
第四十三话 （夏）：夏亚的思惑
特殊地形：宇宙
初始：16 名选定
增援（全部为期间参战）：沙扎比、亚克托·德卡（裘尼）、亚克托·德卡（葵丝）
SR：3 回合内完成关卡
解说：击坠一定敌人后，夏亚等三人会支援我方，继续消灭所有敌人后即可过关，SR 相对较容易。注意三人的击坠数会影响夏亚小队以及夜莺加入我方的条件（推荐三人合计击坠超过 4、5 架以上的敌机）。
工厂：夏亚、裘尼、葵丝各击坠一名敌机。TacP 100
关卡奖励：气力反应器
第四十三话（哈）悲伤的迷路之子
特殊地形：宇宙
初始：16 名选定
增援：卡碧尼（丘贝雷：哈曼机，期间参战）
SR：3 回合内先击坠亚克托·德卡（葵丝），再击坠亚克托·德卡（裘尼）
解说：SR 达成之前第二回合，哈曼、玛修玛会以第三势力的形式加入战场，哈曼和玛修玛带有掉落技能和零件，有实力的话可以考虑击坠，当然也可以无视他们直接提前完成 SR，哈曼就会暂时加入我方队伍，迎战第二批敌军增援。
工厂：
关卡奖励：气力反应器、冲刺（技能）
第四十四话（夏）：哈曼之泪
特殊地形：宇宙
初始：沙扎比、亚克托·德卡（裘尼）、亚克托·德卡（葵丝）/ 以上为期间参战。16 名选定
SR：5 回合内击坠所有敌人完成关卡。
解说：注意 SR 条件中需要击坠所有敌人，由于本关击坠两 BOSS，就会直接过关，因此需要留下其中一个，先消灭其他敌人，再行击坠 BOSS 才可达成条件。 同 43 话（夏）一样，本话夏亚小队综合击坠数会影响加入条件，建议合计击坠超过 4 机以上。
工厂：沙扎比、亚克托·德卡（裘尼）、亚克托·德卡（葵丝）各击坠 1 机。TacP 100
关卡奖励：哈啰、冲刺（技能）
第四十四话（哈）：在爱憎的尽头
特殊地形：宇宙
初始：ν高达、卡碧尼（哈曼，期间参战）、16 名选定
增援：ν高达 → Hi-ν 高达
SR：第三回合结束前击坠略儒拉级、亚克托·德卡、居拉·德卡（蕾森），再击坠沙扎比
解说：敌军配置比较分散，因此要达到 Sr 条件有些困难，需要分别配置对应火力高的机体，并且尽快瞄准目标攻击，才可以有望达成目标，消灭一定敌机后，敌方夏亚会驾驶沙扎比增援。击坠沙扎比后，阿姆罗会更换成为海牛高达，夏亚则会更换为夜莺。击坠夜莺后即可过关。
工厂：
关卡奖励：钢之魂、战术待机
第四十五话（夏）：阿克斯西决战
特殊地形：宇宙
初始：ν高达、16 名选定
增援：ν高达 → Hi-ν 高达、宗师高达
SR：在第四回合结束前，击坠略儒拉级、全部姆萨卡级、昆曼沙、α·阿基尔、亚克托·德卡，再击坠沙扎比。
解说：本关第二回合夏亚会作为敌方增援出现，裘尼会在气力 130 以上的时候使用一次直感，先用小攻击和厚皮机器人打他一次再做攻击。沙扎比出现后，SR 条件就会出现，条件显得很复杂但其实很简单，只要消灭除了沙扎比以外的所有敌人就行，且在 SR 条件达成以前也不会出现增援，大可放心进攻。
沙扎比被击坠后，夜莺 + 4 机敌机再次增援。注意乘坐夜莺的夏亚会使用 2 次攻击，由于本关失败条件包括阿姆罗被击坠在内，不要让阿姆罗被击坠就没问题。
工厂：达成昆曼沙和 α·阿基尔两个机体的加入条件（让普露与捷多均与普露兹战斗并由捷多击坠普露兹，由阿姆罗击坠葵丝），TacP 300，具体可参考夏亚的夜莺加入条件。
关卡奖励：回避提升、战术待机、钢之魂
第四十五话（哈）：战士再归
特殊地形：宇宙
初始：16 名选定
增援（期间参战）：卡碧尼（哈曼）、宗师高达
SR：5 回合内完成关卡
解说：5 回合包括后期 UND 军队的增援部队也要消灭在内，因此初期击坠哈曼这个任务最慢也要在第四回合完成，否则 SR 无法获得，哈曼的卡碧尼一如既往血厚之外，还有 2 次行动等麻烦的技能，因此需要尽快有大火力对策。
关卡奖励：哈啰、回避提升