在這次《超級機器人大戰 T》中的機體優勢都傾向於超級系較強勁，因此若要使用主力機體，在一週目較高難度或者獲得全 SR 的情況下，推薦使用超級系作為主打，高達機體由於近年來作品地位不斷下降，脆皮、迴避率連續下降補正、大部分缺少移動後可使用的大招等，運用起來非常難。以下按照個人觀點給出推薦的主力機體。理論上花心思培養的話所有機體都可以成為強力的機體，不過這裡列出的推薦主力相對花費的資源要比其他機體少很多即可帶來巨大的受益，因此推薦使用。
神高達：★★★★★
在本次《機戰 T》中非常令人矚目的機體，也是 G 高達系列久違的加入了機戰，也是系列中罕見的不經過閃光高達在初期就加入我方的機體，但機體性能在初期有一定的限制，暫時不能使用明鏡止水和石破天驚拳等知名的招式，但初期爆熱金手指就有驚人的攻擊力，且進入超絕模式後增加移動力、攻擊力、運動性等數值，在攻擊、迴避、防禦上均有著不錯的表現。
多蒙自身在獲得 ACE 後出場氣力 +10，5 改獎勵 + 氣力，基本上開場不需要任何輔助，裸氣 135 登場，各種大招可以說隨便放，精神上還有不屈、直感等，可以說沒有任何死角的機體和駕駛員組合。本作的石破天驚拳拋棄了過去遠距離武器的特點，改成了近距離移動後可使用的高威力武器，射程雖然稍微短板，不過移動力作為補充，可以彌補該缺陷。
ACE 新增的明鏡止水生效的時候傷害 1.1 倍，更加令神高達成為我軍第一戰力。
主角機：★★★★
這次主角機初期由於全部為射擊光線屬性武裝，且移動後可使用的武裝只有攻擊力最低的那個，因此對付有護罩的機動戰艦系敵人的時候會非常吃力。但系列慣例後期會逐步追加強力的武裝，並且無視路線分歧隨時可以使用 + 5 段改造獎勵增加一個零件插槽都是主角機的強項。
主角機後繼機體最大的特徵在於其超遠距離的射擊武器，以及天生的援護攻擊暴擊效果，基本可以做到全方位掩護射擊的強力效果，對於一擊不能殺盡的大型敵人非常有效。
黑百合：★★★★★
與《機戰 V》一樣，本次黑百合的性能基本沒變，且比 V 還要更早加入我方，由於天河明人本身擁有非常多強力的技能，搭配黑百合高移動力、高迴避、中裝甲、護罩、EN 回覆手段等各種令人垂涎的特殊能力，尤其是明人自帶的技能中 IFS、底力 9 兩項能夠減少培養消耗，IFS 默認技能能夠增加他的命中、迴避、技量，底力 9 能夠令他中彈一次後，迴避裝甲輸出暴增，王牌獎勵則是敵軍行動的時候傷害 1.3 倍、迴避率 +20%，稍微改造運動性即可達到非常理想的清理雜兵的效果。
培養方面可著重於射程（插件）、EN 輔助（插件或技能）、格擋技能、識破技能、鬥爭心等方向作為培養終點，5 段改造獎勵還能夠獲得與撫子號一起出擊時每回合滿 EN 的效果。
Dann of Thursday：★★★★☆
首次加入機戰的強力超級系機體，配合梵安本身同樣強力的技能，具有非常強力的防禦、攻擊能力，5 段改造獎勵也是 HP+1000、照準 +20、運動 +20、裝甲 +200、EN +50 等非常豪華的獎勵，梵安獨有的特殊技能「YII」會隨著氣力的提升，而增加全數值，利用這個特性搭配氣力上限突破、底力 9（需要培養）、格擋技能等技能，可以令其更為攻不可破，唯一缺點是移動能力較低，需要依靠衝刺技能或者插件來彌補。
大魔神/無敵鐵金剛（魔神 Z）：★★★★
機戰系列中的常客機體，高防禦力高火力、移動後可大招等超級系一應俱全的能力均具備，大魔神早期加入但火力層次相比神高達要低一個檔次，不過在 13 話追加新武裝「雷霆擊破」後會得到改善，5 段改造獎勵也能夠獲得 EN 自動小回復的能力，非常值得作為主力機體來使用。EN 消耗量巨大也可以通過節省 EN 使用的特殊技能來改善。兩者機體最大的缺點在於移動力不足，尤其是鐵也沒有加速精神，用起來會非常吃力，建議使用先制攻擊、衝刺、加速插件等方式彌補。
值得一提的是雷霆擊破性能有很大改變，過去系列中該武裝由不可移動後使用 +7 格子射程變成了移動後可使用的 2-4 格射程，使用起來需要適應。
真蓋塔/真蓋塔龍：★★★★☆
同樣是機戰中的常客，但相對魔神 Z 系列高防禦高火力，蓋塔系列則走的是高火力高自由度的路線，可以通過蓋塔 1 —— 高火力、蓋塔 2 —— 有一定的保命能力，來不同的切換使用，三人分的精神也令蓋塔有著魔神 Z 系列不一樣的使用方式，且真蓋塔龍加入後火力方面會有劇烈的加強，是非常值得培養的機體系列。
真蓋塔系列最大缺點在於防禦能力、EN 持有能力相對魔神 Z 系列要低很多（5 段改造獎勵獲得 EN 中回覆會得到改善），技能方面由各種氣力系技能取代了魔神 Z 駕駛員的格擋系技能，技能方面可以使用自由培養來解決，但裝甲方面也稍微遜色。
GAOGAIGAR：★★★★☆
初期自帶護罩、EN 自然恢復的強力大型超級系機體，有著和魔神 Z 差不多的火力、防禦能力，GAOGAIGAR 中後期追加裝備、黃金巨錘等強化，可以令本機與魔神 Z 系列一較高下。
勇者特急、託萊達：★★★★
這兩個系列擁有中規中矩的超級系能力，火力上防禦能力上均不如魔神、GAOGAIGAR 等機體，但他們有著「社長」這種能夠賺取 TacP 的特殊技能，因此在一週目遊戲中建議全程跟著他們抱大腿。實際上這兩者的能力，其實能夠發揮出超乎想象的實力，各種強力大招、堅固的防禦能力（勇者特急相對防禦能力較低）等都是這類超級系的特徵。
激勵哥（齊力可）：★★★★★
眾多超級系機體眾爭神壇之中，可以說是唯一一個突顯拔尖的真實系，激勵哥在 Z 系列中的表現給很多玩家都有著非常強烈的印象，由於其最大特徵在於本人的技能非常強勁和明人一樣最初有著底力 9，加上本身獨特的異能生存體特殊技能，機體反而只是非常常規平庸，更凸顯其個人能力的強勢。
除此外精密攻擊特技能夠令暴擊威力提升至 1.5 倍（平時暴擊威力為 1.25 倍），5 改獎勵加上暴擊插件，可以令激勵哥的所有攻擊幾乎全部享受 1.5 倍暴擊威力加成，各種大招砸暴擊再加上再攻擊的威力非常可怕。
激勵哥的 ACE 能夠讓異能生存體的觸發條件為 30% HP，精神方面也有集中、不屈、必中等常用精神以及調整 HP 剩餘量的精神。但注意與 TacP 工廠管理的 HP 自動回覆項目非常不合拍，建議工廠部分不要採用 HP EN 自動回覆，能更有力激發此類機體的潛力。
激勵哥唯一缺陷在於地形適應比較混亂，一般需要插一個 A- 適配器來解決問題，否則難以發揮激勵哥的效果。
劍魚 II：★★★
駕駛員史派克的牛仔技能可以作為本作賺錢的主力技能之一，建議其多多上場賺錢。劍魚 II 本身則屬於過去作品中開摩托、小飛機類型的機體 —— 超高迴避超低 HP 的特徵，運用起來建議儘快加強識破技能來避免受到攻擊。
阿爾卡迪亞號：★★★
阿爾卡迪亞號很明顯是借鑑了《V》、《X》等作品中宇宙戰艦大和號、藍寶石之謎諾其拉斯號等的待遇，不過相對上兩部戰艦，阿爾卡迪亞號沒有了 EN 自然恢復、護罩等待遇，相對削弱了不少。不過阿爾卡迪亞號保持了上述兩戰艦超高的火力、移動後可大招的特性，加上強力的武裝以及艦長自身的賺錢、火力系技能、以及新追加的海盜戰法特殊指令，依舊可以值得向前線推進滅敵。
撫子號 B、C：★★★★
機動戰艦撫子號劇場版形態由於在《V》中被史上最強戰艦大和號的強勢壓了下去，但該戰艦本身擁有者非常強勁的射程、地圖炮、護罩、EN 自然恢復以及琉璃本身的輔助技能，令撫子號有著非常堅實的戰艦性能。尤其是撫子號 C 在追加了相轉移炮後，兩種不同的地圖炮方式令其大範圍殲滅速度有著格段的提升，後面新增的對全敵人擾亂 + 分析的特殊效果也非常實用，琉璃本身的指揮官 + 電子妖精等輔助技能也能夠讓撫子號率先衝入敵陣的同時率領眾多機器人獲得強力的 BUFF。
不過撫子號有著戰艦通用的缺點、包括移動力不高、沒有移動後可使用的武器等問題需要依靠增加移動力、打帶跑技能等解消。