《苏菲的炼金工房2》为《苏菲的炼金工房 ～不可思议书的炼金术士～》的续作，主线攻略按照本作「行程表」内的主要剧情行数序列进行编写，如有卡关情况可针对剧情片段进行排查。
◎我为人人
想办法守护艾薇拉的梦想吧
回工房触发剧情；
调合梦幻坠饰吧
「梦幻坠饰」需要炼金Lv85才能调合，主要素材除了「梦幻路标」之外「炼金球仪」、「纯洁钻石」、「万能中和剂.虹」都要通过构思配方解锁调合获得，其中「炼金球仪」解锁条件中需要调合制作「海星徽章」，而「海星徽章」需要到商业区调货商阿蕾特购买「梦幻见闻录」学习解锁；
「海星徽章」调合主要素材含有「灵魂黏土」，获得方式只能通过委托任务EX「巨人的脚步声」讨伐地狱暴君掉落获得，可以完成EX任务再睡觉刷任务出来；
准备好以上素材后制作「梦幻坠饰」；
将梦幻坠饰送去给艾薇拉吧
传送到梦之大树-梦之摇篮触发剧情；
向每个照顾过我们的人打声招呼吧
这里开始无法使用大地图传送，根据小地图到达各处目的地触发剧情；
前往梦之大树看看吧
继续步行到达梦之大树触发剧情；
剧情后主线剧情全部结束。
通关后选择进入结局前夕继续存档内容，会回到第十部分制作完成「梦幻坠饰」之后，出现「与镇长普拉芙妲说话吧」这个进度，到到水晶光辉亭二楼与普拉芙妲对话，这里其实就是没剧情了，如果你告诉镇长没什么事情要做的话会直接进入「向每个照顾过我们的人打声招呼吧」游戏结束阶段，如果你选择是的话就会继续在这个世界里继续完成你没完成的支线人物剧情和其他探索构思配方等，等你觉得都差不多了可以再找镇长说结束游戏阶段保存存档进行二周目等操作。