《蘇菲的鍊金工房2》為《蘇菲的鍊金工房 ～不可思議書的鍊金術士～》的續作，主線攻略按照本作「行程表」內的主要劇情行數序列進行編寫，如有卡關情況可針對劇情片段進行排查。
◎修復夢之核心
構思修復夢之核心的配方吧
解鎖「夢想粉末」的條件；要求「鍊金粘土」調合出效果含有「製作個數+4」；
根據需求信息所示需要大量的火元素堆積才能達成「製作個數+4」的效果製作即可；
※注意：這裡會發現製作「鍊金粘土」的時候第一項效果被鎖住10格無法突破，原因是你需要按下L或R鍵反轉觸媒的面板才能突破；
湊齊10個火元素星號組件就能到達「製作個數+4」的效果；
調合夢想粉末吧
直接調合完成「夢想粉末」觸發劇情；
對夢之核心使用夢想粉末吧
轟雷宮-炸雷之間目的地觸發劇情；
向普拉芙妲報告吧
任意回城觸發劇情；
◎古羅爾
去看看艾薇拉吧
傳送到夢之大樹-夢之搖籃與艾薇拉對話觸發劇情；
離開夢之大樹吧
劇情後離開夢之大樹再次進入劇情；
返回鍊金工房思考吧
回工房觸發劇情；
◎對付古羅爾的方法・1
構思保護夢之核心的配方吧
完成解鎖「驅除古羅爾的魔石」構思配方；不鏽之心可以到蘇瓦的心臟-搏動炎界西北頭目處採集獲得；巨大古羅爾可以到轟雷宮-遠雷正門找到；
調合驅除古羅爾的魔石吧
完成「驅除古羅爾的魔石」的調合觸發劇情，調合主要素材「魔導書殘頁」可以在古都洛伊亞姆-洛伊亞姆之麓東北處房子附近獲取，製作4個「驅除古羅爾的魔石」因為後續主線所需使用；
在夢之大樹使用驅除古羅爾的魔石吧
傳送夢之大樹，到大樹下光圈使用「驅除古羅爾的魔石」觸發劇情；
◎對付古羅爾的方法・2
對夢之核心使用驅除古羅爾的魔石吧
・傳送到浪花堤跡-海王的領域西北目的地光圈使用「驅除古羅爾的魔石」觸發劇情；
・傳送到雪煙迴廊-冰之公館東北目的地光圈使用「驅除古羅爾的魔石」觸發劇情；
・傳送到轟雷宮-炸雷之間北目的地光圈使用「驅除古羅爾的魔石」觸發劇情；
返回洛伊提爾向普拉芙妲報告吧
傳送到商業街觸發劇情；
◎艾薇拉的力量
去調查東北方的大地吧
傳送到蘇瓦火焰山-烈焰之路西北觸發劇情，來到塞爾加德大山峰往深處目的地前進；
◎沙漠
試著往沙漠深處前進吧
到達忘卻沙漠目的地觸發劇情；
打倒阻擋去路的古羅爾吧!
消滅三隻Lv42妄想者；
去向普拉芙妲報告吧
回城觸發劇情；
◎異變
去看看夢之大樹吧
傳送到夢之大樹觸發劇情；
用次元溶解劑開路吧
回工房製作「次元溶解劑」再回到夢之大樹錢光圈使用；
尋找艾薇拉吧
繼續前進到達夢之搖籃接近艾薇拉觸發劇情；
◎艾薇拉失控
拯救艾薇拉吧
擊敗Lv60艾薇拉；
返回鍊金工房一趟吧
劇情緊接略過；
第八部分結束。