《蘇菲的鍊金工房2》為《蘇菲的鍊金工房 ～不可思議書的鍊金術士～》的續作，主線攻略按照本作「行程表」內的主要劇情行數序列進行編寫，如有卡關情況可針對劇情片段進行排查。
◎斯拉夫龍來襲
打倒斯拉夫龍吧
到達洛伊亞姆之麓目的地直接進入戰鬥，擊敗Lv55斯拉夫龍，建議Lv50以上討伐；
沿著山路往深處前進吧
前往目的地觸發劇情；
返回鍊金工房構思配方吧
回工房觸發劇情；
◎夢之容器
構思夢之容器的配方吧
完成「夢之容器・空」構思，前往雪煙迴廊-霜之側壁目的地調查觸發劇情，然後回到工房製作完成「夢之容器・空」即可；
前往艾薇拉的所在地吧
傳送到夢之大樹-夢之搖籃與艾薇拉對話觸發劇情；
前往洛伊亞姆之麓吧
傳送到古都洛伊亞姆-洛伊亞姆之麓目的地觸發劇情；
第六部分結束。