緊接上期帝皇從邪神那裡得到了製造基因原體的能力，並且發現了網道準備毀約然後乾死混沌邪神。帝皇的再次露面即是紛爭紀元後期追逐泰拉控制權的人類軍閥之一，此時他只是一個人類軍閥，為了以後的大規模戰爭和泰拉的重建，帝皇創建了戰爭議會招募了那些最有能力的管理者，為首的便是被稱為魔紋的掌印者馬卡多。馬卡多是一位擁有著永生能力的超強靈能者。當帝皇進行統一泰拉的戰爭時，馬卡多本是泰拉上的一名軍閥。他以收集人類過往歷史中最偉大的知識遺產為己任。在馬卡多被帝皇招募後，很快展現了優秀的管理能力，他被帝皇指派管理新晉征服的泰拉，在他的執掌下，泰拉從一片戰爭廢土中慢慢恢復。同時也是掌印者馬卡多說服帝皇接受帝皇的稱號。
馬卡多
帝皇曾經以曾經以“規則領主”的身份在泰拉的一個山區為人所知。在那裡，他會尋找那些基因可用於他的雷霆戰士計劃的個體，並提供基因編輯服務，以糾正該地區後代的遺傳突變。正是在這個時候，他遇到了阿馬爾·阿斯塔特，此人後來與埃爾達和帝皇在原體項目中密切合作，帝皇還遇到了亞澤卡爾·桑德尼，此人後來為雷霆戰士的後繼者——星際戰士軍團開發了黑色甲殼。皇帝發起了一系列針對星球上所有其他軍閥的戰役，這些戰役後來被稱為統一戰爭。在這些戰爭中，皇帝使用了幾種軍事力量——如雷霆戰士和千連軍團（軍官由靈能者女性組成但軍團士兵是男性）這些軍事由基因改造/基因工程戰士組成，在統一戰爭後期，阿斯塔特也成建制的登場了。他們在帝皇統一泰拉最終的勝利中發揮了重要作用。當然，帝皇也是一貫的雷霆手段：不配合，那就讓你體面。掃除了泰拉上的所有軍閥、變種人和宗教。
雷霆戰士
向阿爾法軍團阿斯塔特鞠躬的千連軍團
憑藉這場勝利，泰拉的星球和人口終於統一在一個名為帝皇之人的統治下，有了這一成就，皇帝隨後啟動了他的計劃，以實現他團結和守護人類、並率領人類進入星際、逐鹿銀河的目標。這項事業後來被稱為大遠征！
基因原體計劃也隨即展開，帝皇為每個原體都安排了位置：荷魯斯將作為戰帥保衛人類偉大的疆域、馬格努斯將坐上黃金王座以施展帝皇那讓全體人類飛昇成不需要亞空間的計劃、康拉德將作為監督者，使帝皇禁絕的一定不會出現、洛珈為人類啟蒙不受迷信的影響。
帝皇與已知原體們
“帝皇是傑出的科學家、強大的戰士、偉大的靈能者，但他也是一位糟糕的父親……”
——羅伯特•基裡曼，簡短但準確地描述帝皇
原體們是由埃爾達的基因與帝皇的基因結合產生，埃爾達在功能上已經是原體們的母親了，而帝皇則是原體們的父親。但埃爾達被阻止參與他們的生活，因為皇帝為他們準備了大遠征的使命。她對皇帝為他們計劃的痛苦未來感到絕望（一個母親，知道了兒子們在未來要與整個宇宙為敵並可能戰死沙場）所以埃爾達在原體們還是嬰兒時，就創造了一個亞空間漩渦，把嬰兒原體們分散在了銀河各處藏匿起來。然後躲藏了很多年，據艾瑞巴斯這個戰錘帶惡人說，埃爾達在不知不覺中就被混沌操控以實現他們的計劃。雖然帝皇對她的背叛感到憤怒，但他從未試圖報復埃爾達，即使他知道她在哪裡。
埃爾達（右）
也許一個母親的這種行為可以被原諒，但是帝皇為了人類必須這麼做。你可以說帝皇沒有人性，只為了自己的目標。他宣稱人類優於所有外星人、用武力取締了所有宗教、計劃將所有人類世界團結在自己的統治下且不接受任何有關獨立的請求、甚至他可以把他的“兒子”們當做工具，帝皇冷漠、功利性強，但帝皇的眼光長遠而獨到。你可以說帝皇對不起很多人，但帝皇絕對對得起整個人類！這種頗具破壞力的性格也為之後埋下了禍根。
滅卻人性的單親父親
帝皇為大遠征做了充分的準備，他創造了星語者軍團，這將把他未來的統治安全地聯繫起來。並創造了星炬，這是一種由皇帝自己的靈能驅動的極其強大的信號裝置，可以簡化和安全地穿越亞空間。（星炬建造時，有些靈族已經預見了靈族的隕滅，將艦船改造為方舟世界駛離了艾達社會中心）
星炬的形象
然而，他的設計中最主要的是創造超人戰士，但這個設計失敗了，前文提到埃爾達作為一個母親保護了自己的兒子，以全人類的命運為賭注。把嬰兒原體們扔進了亞空間漩渦，以彰顯對帝皇給原體們規劃的未來の不滿之情。雖然關於究竟發生了什麼的說法各不相同，但故事的結局總是一樣的：原體被扔進亞空間漩渦，失散在了銀河各處。
在這場動盪的事件中，皇帝的基因實驗室被混沌力量摧毀。他用自己的靈能支撐著坍塌的地下屋頂，直到基因庫工作人員和數據安全撤離。馬卡多和禁軍元帥瓦爾多認為原體們已經死亡或者腐化，但帝皇在亞空間中感應到了他們的回聲並確認了他們還活著。馬卡多對帝皇稱呼失散的原體們為“兒子”很是震驚，並認為這是帝皇壓制人類感情的一種退潮。
這裡插一嘴，在M30，靈族隕落色孽誕生，艾達靈族帝國中心隨著色孽誕生炸出來一個恐懼之眼。“飢渴女士”瞬間吞噬了數十億名艾達的靈魂。只有荒蠻艾達，方舟世界艾達，以及網道中的卡莫拉城內那些遠離艾達帝國的靈族才得以倖存。靈能大爆發吹散了數千年以來阻止亞空間航行的風暴。
經常去卡迪亞的人可能認識這個地方啊
然後，為了找回自己的21個超人兒子，帝皇決定進行自己超人戰士的下半截：阿斯塔特修士項目（也就是我們俗稱的星際戰士或者罐頭），他利用保存下的原體DNA樣本創建了對應的二十支星際戰士軍團，他們將會成為帝皇未來大遠征以及後期統一戰爭最鋒利的矛頭。並且他們基因父親的失蹤，只會激發他們的鬥志和動力（誰先找到爹誰就是有爹帶的孩子了！）
基因原體群像
一切準備就緒，帝皇率領軍隊的第一戰目標就是月球，因為月球曾經是人類基因研究基地。佔領了月球即可利用月球基因技術大批量生產阿斯塔特戰士。 儘管帝皇希望能與月球合作，但月球的統治者們選擇無視新晉成立的帝國。在他們眼裡的帝皇，跟屢次被他們打敗的地球科技野蠻人頭目並無區別。月球人面見了帝國使節，並拒絕加入帝國，而帝國的使節在返回泰拉時被改造成一團不斷尖叫的肉泥。
（這裡是一張圖片，只有聰明的人才能看見。實際上是因為根本沒有40K月球的圖片）
帝皇派出了第第七，十三與十六軍團平定月球目標只有一個：月球上基因實驗室必須得以完好保存。在戰鬥開始後第十六軍團作為先鋒率先抵達月球表面。他們關閉了自己的動力甲系統並在超低溫環境下行動，以避免被儀器偵測，第七軍團與第十三軍團利用地球軌道防禦平臺對月球進行火力壓制。第十六軍團進行了高效的斬首行動。數百名月球基因教派的領導者在沒來的及反應時就遭消滅，隨後第七和第十三軍團登陸，幾小時後，月球投降。從此，月球為大遠征輸送星際戰士。第十六軍團在月球之戰為自己贏得了影月蒼狼的稱號。
身著MK2型來自第七軍團帝國之拳的星際戰士
身著MK2型來自第十三軍團極限戰士的星際戰士
身著MK2型來自第十六軍團影月蒼狼的星際戰士，腿甲有月亮戰役紀念塗裝
月球歸順帝國後，帝皇前往了火星。正如我前文所記，火星一直在默默關注泰拉並時常來到泰拉去掠奪科技遺產，帝皇也在關注著火星。火星作為一個鑄造世界可以為大遠征提供源源不斷的戰爭機器和武裝戰艦。所以帝皇乘坐華麗的戰艦前往了火星，與其上的科技神甫談判最終簽訂了“奧林匹斯”協議，帝皇尊重火星機械神教的歐姆尼賽亞信仰，並且會在未來的泰拉議會中獲得一個席位，並且帝皇會派給機械教六個導航者家族，讓機械教可以再次探索失落的科技。而作為回報，機械教需要提供給帝國宇宙戰艦，併為星際戰士們生產裝備，派出自己的智控軍團和泰坦軍團參加大遠征。有些科技神甫認為帝皇只不過又是一個泰拉上的臭軍閥，而部分神甫則認為帝皇就是傳說中歐姆尼賽亞在現實的化身。但沒有人知道為什麼帝皇對火星上根本沒人去過的暗道那麼瞭解（帝皇：我當年幹你們的歐姆尼賽亞那陣，你們這群齒輪小子還不知道在哪呢？）
來自火蜂軍團的帝皇級泰坦
除了月亮和火星，帝皇還率軍清除了太陽系內其他拒絕加入帝國的團體和勢力。人類將要從太陽系出發，向著宇宙前進，收復那些舊夜和紛爭紀元中被遺忘的世界。偉大的大遠征即將開始！
