1.碇真嗣
14歲，第三適任者，初號機駕駛員，就讀於第二新東京市立第一中學。由於缺少父母的關愛，性格內向消極，面對使徒入侵，碇源堂讓其駕駛初號機時他內心十分抗拒，但由於其十分善良，不忍心看見綾波麗滿身傷痕仍然駕駛其作戰，便成為了初號機駕駛員。
作為初號機駕駛員，其同步率最高，雖然處事消極，但在各個任務中表現都十分出色。同時由於他經常以"對不起"來逃避，也使得明日香對他產生了一定的反感情緒。
作為該作品的主角，他反應了一代人的窘境。軟弱，被動，無力。面對他人的裹挾，對自身的存在持懷疑態度，認為自己好像是一個棋子，在別人需要時才會排上用場。特別是在碇源堂說出:"不願駕駛就滾"之後。
2.綾波麗
14歲，第一適任者，零號機駕駛員。為莉莉絲靈魂的容器，擁有無數個複製體的她並非沒有感情，她只是不懂得。故事開始，她很少同他人交流，只聽命於碇源堂，而碇源堂也對她較於碇真嗣來說更溫柔，讓碇真嗣看到原來碇源堂也會笑。獨自住在一間髒亂的房間裡，裡面還有一副碇源堂的破碎的眼鏡。她一共經歷了三次死亡，在經歷了時間的洗禮之後，開始變得稍微感性，開始懂得看小說了。
綾波麗作為一個三無少女，非社會化，不與他人接觸，與現實生活中的人幾乎並不掛鉤。也使得其三無形象更進一步。
#雜談# 3.惣流·明日香·蘭格雷
14歲，來自美國，第二適任者。是一名14歲就已經大小畢業的天才少女，自尊心極強，同時也瞧不起"官二代"碇真嗣，認為其無論是戰鬥天賦還是頭腦都不如她。不過在後續與使徒作戰時，兩人的無間配合，讓其對碇真嗣轉變了態度，逐漸對其敞開心房，甚至在後續劇情中為其做飯。雖然其外表強勢，但這也正是她掩飾自己脆弱的內心的手段之一，缺乏安全感，壓抑自己的情感，在母親的喪禮上告訴自己"不會在哭了"，這也使得她的內心變得脆弱。
明日香作為女主角之一，她活靈活現的性格也贏得了眾多觀眾的喜愛，並在日本NHK電視臺票選中成為新世紀福音戰士中最受歡迎的角色!
