本文為遊戲內文本整合梳理，加之部分個人猜測創作而來，旨在理清各角色劇情關係和時間順序
文中所提及各種小妖影神圖故事不作詳細展開，還請自行查找
劇情梳理以遊戲設定為主，原著不與之矛盾之處充當補充
流沙國蟲害突起，黃毛貂降妖除魔
流沙國坐落在沙漠當中，遍地黃金，傳說那裡是日落之處。城中有一至寶名曰落日鼓，乃佛祖所賜，每到申酉之時，國王便差人上城，擂鼓吹角，以此庇佑百姓安居。因得佛祖賞賜，故而舉國禮佛，當地黃金巨量，便塑有諸多金身佛像。可隨著信眾逐漸增加，百姓信佛不信王，國王的權威受到了挑戰，又有丞相獻言，鼓動國王終止信仰。國王下令，改國名為斯哈哩國，寺廟盡數拆除，就連修行之人也遭驅逐。
不久，禍事即至。某日黃昏慣常擊鼓過後，城外忽有一巨大甲蟲破土而出，大肆破壞，百姓死傷無數。自此之後，每逢擊鼓，便有蟲害發生。臣民進言說這是對佛不敬招來的報應，國王不得已停止毀佛行動，組織起軍隊抗擊巨蟲。奈何這怪蟲蝜蝂甲殼極厚，斯哈哩國組織的四羽軍又人心不齊，那箭雨根本傷不得蝜蝂分毫。好在軍中有一來自朱紫國的雙頭怪人提出火攻之際，暫時逼退蟲妖，國王大喜，便封賞雙頭怪人世襲都尉。國王還有三個兒子，其中大王子英姿颯爽，在這場蝜蝂之亂中亦是屢建奇功，被封為英武將軍。
可這斯哈哩國人雖然數次取得抗蟲成效，終究是不能將之根除。直到一個黃髮黃毛的修士途經此地，準備協助大軍斬除妖邪。實際上，這黃毛修士也並非凡人，他本是靈山腳下的得道老鼠，因為偷了琉璃盞內的清油，燈火昏暗，恐怕金剛拿他，故此走了。下凡之後，這黃毛貂鼠身邊也聚集妖眾，更是有虎先鋒這般猛將，也是形成了一股勢力。這鼠妖著實有些本事，使得一手三昧神風，擂鼓引蟲又經苦戰，竟真將蝜蝂除去了。國王喜悅，將其敬為國師，這黃毛鼠精便在斯哈哩國修行了數年。
敬鼠令毀壞朝綱，黃風怪移駕山嶺
卻說這黃毛貂鼠自打當上了斯哈哩國的國師後，國王不論朝政大事還是民生小事均要向他諮詢，一時間權力無限。於是黃毛鼠攛掇國王頒佈了“敬鼠令”，舉國上下，以“鼠”為天佑之物，不可撲殺，違者監押，國王親審。好端端一個禮佛之國成了敬鼠之國，方圓百里的鼠妖， 俱往此地遷徙。百姓自然不願與妖混住，但害怕監押懲戒不敢發聲。朝中翰林學士忠肝義膽，聯名請願希望國王修改法令，單為鼠妖闢出一隅之地也好過散入城中。可國王哪裡聽得進？上書當日，御林軍便圍了大殿，好一陣血雨腥風。其後三天， 王不早朝，群官調職，本最受國王器重的三王子也因而與之決裂，從此杳無音訊。被封為英武將軍的大王子早看不慣鼠妖做派，先前便同三王子鬧出數次風波，弟弟走後，他內心的忌恨更甚。
是日，恰逢國師誕辰，舉國上下為國師祝壽，國王更是親至護國寺為國師添香祝禱，大王子忍無可忍，當眾掀了香案。國王勃然大怒，將大王子下獄。那國師竟不生氣，反倒替大王子說好話，這更使得大王子意識到此人城府之深，於是咒罵更甚。國王深覺兒子應嚴加管教，便下令一日三餐只可送至牢門前，不許任何人探視。對外則稱大王子染上癔症，情緒難控，因此幽居。這一下，老國王算是接連失了兩個好兒子，只得把心思都花在有些憨傻的二兒子身上。這二王子天生神力，使得一對重錘，自此常伴國王左右。
數年之後，這斯哈哩國突然從上到下均由人變鼠，哪怕被長期囚禁的大王子也不例外。實際上，流沙國之民棄佛，於是靈吉菩薩招來蝜蝂。蟲害之後凡人信鼠不信佛，菩薩便讓其世代為鼠。哪怕是當初黃毛鼠靈山竊油，背後都少不了那靈吉菩薩從中作梗。正如後來馬天霸所言：“偷油的老鼠上高臺，定是有人架梯來。 “黃毛鼠明白是自己引來禍事，雖然不捨，仍決定帶著手下離開此地。
黃風嶺中生石精，山谷之內出大聖
黃風嶺盛產石英，相傳服之可使人長生不老，哈咇國的老國王就曾派人來此開採。且說這些石英當中，便有那麼幾塊吸取天地精華，修成石精。其中有兩隻道行較深，因此被授以山神之職。
一日，嶺中不知緣何生出了幾顆佛頭，見了活物便放聲嚎叫，只待對方靠近將其吞下。有個石精決定除了這佛頭以保生靈無恙。誰曾想，一下撞過去反倒將這肉佛頭沾了一身，慢慢又在石精身上長出個石佛頭來。從此之後，這石精便性情大變，將山中所有肉佛頭全都撞爛後抹在自己身上，成了個揹負數個佛頭的怪模樣。他也不再靠吸取天地之精修行，轉而與那肉佛頭一般開始吞食山中生靈，成了黃風嶺更大的禍患。
自那佛頭石怪出現後，石精們便商量著要將石怪趕出山間，於是請山神一同作戰。其中青石英所化的女體山神本不願參與，但看著眾石精紛紛落敗化作齏粉，終究決定出手相幫。石精們撞不過那佛頭石怪，便將體內石英像箭似的噴射出去，以此偷襲。饒是如此，石精們依舊是節節敗退，就連那女山神身上的青石英也被一拳打碎。
恰巧此時，離開斯哈哩國的黃毛貂鼠率領群妖途徑黃風嶺，一眼便看出這佛頭石怪是老熟人手筆。一腔義氣的鼠妖再次決定出手相助，他出言振奮頹靡的山神，又帶領眾妖加入戰鬥。一番辛苦之後，鼠妖不僅消滅這一佛頭石怪，還將山中肉佛頭也全數剷除。
為了彌補山神的損失，鼠妖將佛頭石怪遺留的精魄分給他們，由此二山神便有了人心人形，二石和合，竟誕下了個石頭孩兒。是以，眾妖就將他們三者稱作石父、石母與石子。其後，石父因故離了山場，石子尋父而去，便就只留了石母一個，孤零零在此。由於得了精魄有了神通，石母變得不善行走，就用青石英仿照自己當年的模樣，消耗化生出了石精“石雙雙”，讓她們替自己觀察山裡的情況。
再說那黃毛貂鼠，經此一戰得到山中眾生敬謝，並將之拜作大王。兩個山神為報答高人的恩情，更是主動為其塑造山場。於是這黃毛鼠就成了群妖口中的黃風大聖，就此定居黃風嶺。至於他在下界鬧出的這諸番動靜，自然難逃佛祖法眼。如來照見了他，不該死罪，故賜靈吉菩薩一顆定風丹，一柄飛龍寶杖，著其轄押。靈吉菩薩拿住鼠妖后，饒了性命，放他歸山，不許傷生造孽，隨後去了二千里外的小須彌山設壇講法。鼠妖雖稱大聖，卻也難敵佛法，索性求個庇佑，拜菩薩為師，這黃風嶺也就成了鼠妖的道場。
虎先鋒擒唐三藏，孫大聖降風大聖
自這黃毛貂鼠稱了大聖拜了菩薩，便在這黃風嶺中修行，算來也有段時日，直到那唐三藏師徒三人途徑此地。這一日黃風大聖座下虎先鋒奉命巡山，正與幾人狹路相逢，作勢要撲。八戒掄起釘耙打將過去，與那虎妖戰作一團。虎先鋒自知不敵，使一個金蟬脫殼計化作原型。那邊廂大聖安撫了玄奘，也趕上去與八戒一同迎敵。虎先鋒無奈只得剝下皮來，苫在一旁臥虎石上蓋以誘敵，自己化作一陣狂風遁去，正好擄走了無人看護的唐僧。
回到洞中自有小妖相迎，虎先鋒的兩個兒子更是對父親的功績大為欽佩。通報的妖怪也已將唐僧的來歷報與黃風大聖，但這鼠妖早就聽聞取經之人的底細。他擔心那兩個惡徒弟找上門來，便暫時不準備吃了唐僧，只叫人先將之關押，待清淨後再做處置。虎先鋒誇了大王深謀遠慮，也就退下。
妖怪們如何收押唐僧暫且按下不表，說回那邊師兄弟二人。悟空和八戒尋虎不得，回來卻發現師父不見蹤影。孫悟空料定妖物就在山中，交代八戒藏好行李，兩人便向山嶺內尋去。不出半日，那黃風洞便出現在眼前。孫悟空高聲叫陣，洞內自有虎先鋒請命出戰，雖然黃風大聖和膝下二子一再勸告，卻也攔他不得。
沒多時，虎先鋒便敗下陣來，又欲遁走，被八戒趕上，一釘耙便將腦袋砸出九個窟窿來。孫大聖拖著死虎再去洞前叫罵，擾得洞裡黃風大聖著實心煩，最終出門應戰。二人鬥經三十回合不分勝敗。這行者要見功績，使一個身外身的手段，變出百十個同本人無異的分身，將黃風大聖圍在當中。鼠精害怕，也望著巽地上把口張了三張，嘑的一口氣，吹將出去，忽然間，一陣黃風，從空颳起。這三昧神風名不虛傳，吹散了身外化身又吹迷了火眼金睛。悟空不敵，那黃風怪自回洞中。
無可奈何之下，孫悟空只得帶著八戒先行離去，準備尋得應對之法再來救人。不久之後，那猴化作飛蟲潛入黃風洞中，竟真探聽到靈吉菩薩能夠剋制妖風。又得太白金星指點，終請來靈吉菩薩助陣。菩薩用定風珠止了妖風，又使飛龍寶杖化作金龍，將那黃風大聖打回鼠精原型。孫大聖本欲打殺，可靈吉出言阻攔，自將鼠妖帶回靈山去見如來。那兩位救出唐僧，除了山中不少妖物，一行人再度西去。
風暫歇各尋出路，百年後再度聚首
黃風大聖被捉回靈山後，這黃風嶺的勢力又是一番變化。
先說那滿山石精，在石母帶領下開始著手恢復山體環境。不過本就有一山神出走，現在又少了黃風大聖庇護，難免遭人惦記。這黃風嶺的土地本非良善，當初山中鬧佛頭石怪時不出手相助反而作壁上觀。你說他既無功績，可看到二山神得了鼠妖賞賜又心生嫉恨，屬實是個心胸狹窄的主。自黃風大聖被擒之後，這土地對獨自掌管山中石精的石母生了歹意，他在山谷中窺看了好些時日，發現石精們，搬山造石，非常忙碌，而山神坐鎮石窟之中，只管調令，便心生一計。這土地施個變身法術，也變作石精模樣，意圖混進交差隊伍摸到石母身前，到時一頭撞將上去，裂石取核，從而奪取精魄。
可這土地神沒想到的是，石母為了守護黃風嶺，早早化生出諸多石精，其中有一極為健壯強橫者更是盡全力化生。待土地來到石母面前，剛欲動手，便有這些守護石精破土而出。土地一時分神，只撞出一道裂縫，趕在被撲開之前吸了一半精魄。石精們在那強橫者帶領下一路追打，土地本想還原本相，卻被那精魄拖累，早已固定為石頭，最後被石精們砸進地裡。即便如此，他也整日罵罵咧咧不得消停。
再說那虎先鋒的兩個兒子，父親身死大王被抓，兩隻幼虎收拾殘部自尋出路，好在從虎先鋒那裡學到本領，倒也熬過了最苦的日子。山中沒了大妖，小妖們又被虎兄管束著，慢慢地便有凡人聚集，黃風嶺外建起了定風莊，虎兄依照“啖盡迷路奸邪，護送過往好人”的風俗，為自己博了個“虎神”的名號。
定風莊既然信奉虎神，那就連莊裡的大巫們也拿起了畫有虎神的盾牌，自以為鎮服了山中妖物。村人還為“虎神”建了座臥虎寺，常常供奉，虎弟卻對佔盡風頭的兄長越發不服，就此埋下矛盾的種子。
至於那斯哈哩國，國王子民都成了妖怪。一活百年雖不是難事，但妖不似人那般光明正大，昔日繁華的黃金佛國終究被歷史的沙土掩蓋。
百年間滄海桑田。黃風大聖不知得誰之命，拿了大聖根器不說，更是將那靈吉頭顱斬下，充當盛放的容器，也算了了種種仇怨。得了神物的黃風大聖再次下凡，斯哈哩國的老國王分外高興，帶著殘餘國民前來投靠意圖復興。黃風大聖見那二王子還有幾分蠻勇之力，他剛剛歸來身邊也缺人手，就順勢收留了這一支鼠妖。
黃風大聖的歸來給黃風嶺又帶來樹起風波。那虎弟記恨其坐視父親身亡，慫恿虎兄趕走這群鼠精。未曾想根器在手，這黃風大聖的手段依舊，一個照面便將虎弟重傷。虎兄為救弟弟姓名，只好求饒，黃風大聖卻也豁達，得知是故人之子便讓虎兄繼承了父親的先鋒之職。
虎弟呢？依舊恨意難平，和兄長大吵一架後獨自離去，藏身在定風莊外枯井之下苦練嘯聚神功，意在尋仇。不久之後，有一刀客為替被三昧神風侵擾的孩子尋找醫治之法來到此地，虎弟假借兄長威名說服刀客，又用虎兄贈與的葫蘆緩解孩子症狀。虎弟本意是為了讓這刀客替他誘人前來，食之以恢復傷勢，沒想到竟和那孩子也結下友誼。可為虎作倀之舉終究天理難容，刀客的兒子被憤怒的村民亂棍打死，他殺了全村人，成了風沙中的遊魂。等到虎弟趕來，只見得棺木當中那具小小的屍體，恨意更重了幾分。
說回虎兄，雖然重回黃風大聖座下安身，但畢竟是因其家破人亡，心中憤懣無處發洩，便遷怒於斯哈哩國的鼠妖們。這虎先鋒三天兩頭要吃些老鼠，唯有那位二王子能攔他一攔。於是這黃風大聖重組的妖邪，內部便存有諸多嫌隙。不過，二王子畢竟勢力略遜，大聖手下僅有個虎先鋒依舊不夠。再者說，既已回到黃風嶺，何不見見昔日山神？黃風大聖欲見石母，卻被那些守山石精所阻。好在虎先鋒從中調解，讓石精們再次聽命於黃風大聖。更是說服那位最勇猛的石精，叫其做了另一路先鋒。
準備工作完備，黃風大聖下定決心要煉化根器。黃風大陣開啟，鼠妖佔了嶺上村莊，二位先鋒手持秘符鎮守大門。只有三條沙道通向那狂亂的黃風之中……
黃風大聖就此閉關不出。至於那黃風嶺上依舊過客匆匆。黃袍的員外似是梅山七怪中的朱子真，奉大哥的命令在此等候有緣人。無頭的僧人風起時現身，拿著三絃四處彈奏，唱的盡是些因果報應血雨腥風。