忍者系列是遊戲王裡面比較古早的一些系列，最開始各個忍者只是使用五行遁術在各種卡組裡面打醬油，直到忍者變化之術的出現確立了忍者的變身戰法，才終於將忍者卡組的強度提升了上來。
在卡牌世界裡面，最先開發出變化之術忍法的忍者是女忍者八重，變化之術可以讓忍者將自己變成其他種族的怪獸形態，並以此大幅度提高自身的力量。
女忍者八重在開發出變化之術之後，將變化之術無私的傳給了其他忍者。這極大的提高了全體忍者的作戰能力。
忍者半藏是第一個對變化之術進行改良的忍者。在原先的變化之術的基礎上，半藏開發出來了超變化之術。超變化之術在理論上甚至可以讓他變成龍族，擁有僅在傳說中出現的力量。
半藏不僅僅掌握著變化之術，對於其他忍法的運用也出神入化，更難能可貴的是他還擁有著一雙識人的慧眼。這些都讓他成功坐上了二代目忍者頭領的位置。
踏著女忍八重和半藏的腳步，才藏繼續開發出來了妖變化之術。這個變化之術可以讓忍者變成被殺死的敵人的模樣，更好的執行奸細和刺客類型的任務。
才藏的能力和謀略在忍村中皆屬一流，並且對各種忍法的運用也出神入化，因此他成為了第三代忍者頭領。
通過對超變化之術的普及和使用，忍村裡面的一些下級忍者經過刻苦的修行，通過變化之術成為了更為優秀的龍忍者。
白衣忍者升級成為了白龍忍者，不僅攻防得到了大幅度的提升，並且還擁有了保護我方陣地的能力。更重要的是它獲得了最正統的龍神之力。
黑衣忍者通過變化之術變成了黑龍忍者。
變成黑龍忍者之後，黑衣忍者的速攻能力得到進一步強化，並且還獲得了野獸的力量。
青衣忍者與紅衣忍者原本是忍村裡面最下級的忍者，但是通過超變化之術，它們也晉升成為了龍忍者。
這是原來變化之術不能做到的事情，而這一切都得益於半藏頭領開發出來了超變化之術。因為這樣，青龍忍者對頭領半藏有著他人所不能及的忠誠。
因為實力弱小的緣故，早期青衣忍者和紅衣忍者只能執行暗殺類的任務，但是在習得超變化之術成為龍忍者之後，他們的戰鬥風格也出現了轉變。
超變化之術極大的強化了忍者的力量，紅衣忍者的戰鬥方式現在更傾向於正面作戰。說起來，他原本就是個脾氣火爆的人。
黃衣忍者是村裡的元老，很早就追隨者一代目忍者首領佐助，經歷了大大小小的戰役，擁有著豐富的作戰經驗。
如果不是因為半藏和才藏優秀的能力，黃衣忍者本該早就成為忍者頭領的。現在通過超變化之術，黃衣忍者升格成為了黃龍忍者。事實上光從戰鬥力上來說，黃龍忍者才是忍村最強。