故事背景
優格·索托斯為了打破現實和夢境的藩籬，在許久之前，在K市所在的古楚地與古神諾登斯爭鬥。一批又一批的存在，在優格·索托斯的引導下試圖舉行儀式將夢境和現實的界限破壞，試圖將現實緯度拖入夢中。這些行為都被諾登斯阻止。諾登斯會回溯它失敗的嘗試，但它的能力是有限的，一旦失敗的過多，優格·索托斯就無法避免的逐步打破現實和夢境的藩籬。
時間來到現代，張強本來是一名明天礦業的礦工，在一次下礦考察前，他發現了作業中可能的隱患，但是被主管要求刻意忽視，導致了97特大礦難的發生。其陷入深深的自責中。為了贖罪，他參與組織對主管和公司的舉報和聲討。但是其被認定為ptsd和伴生的一系列精神疾病，被送進了精神病院。在精神病院中他持續和有關部門寫著舉報信件，但是始終了無音訊。
後來，他被轉院到仁愛醫院中。在仁愛醫院中，他目睹了仁愛醫院中對病人的虐待，開始試圖向外界求助。卻依然徒勞無功。在絕望之際，他認識了朱明非。朱明非是一名富有正義感的年輕醫生，並且傳承著名為“雲中君”的神秘古楚地信仰。在其瞭解了醫院和科瑞醫藥公司之間的權錢交易後，他和張強計劃了一場逃亡，並在通過媒體將事件公諸於眾，以迫使仁愛醫院關閉。
在2008年1月11日，逃亡最終失敗，張強選擇跳樓自殺來鬧大聲勢，保護其餘的患者。其身體最後被院長藏匿。在臨死之時，張強進入了夢境。他在不停的入夢後見到了優格·索托斯的化身，陷入了瘋狂並堅定了製造覆蓋整個K區的夢境的想法。
為了實現自己的計劃，張強在夢中同時和亨利和院長取得了聯繫。張強向院長承諾會幫助他殺死亨利，前提是他要想辦法將亨利引誘到醫院內。同時他要求院長使用他的血液，仿製科瑞公司的工藝製造效果完全相反的藥品—紅叉藥—舍曲帕羅西汀。並對醫院內的病人使用，其目的是為了通過將其提前拉入夢境以保護他們。
而對於亨利，張強謊稱如果幫助他脫離院長的控制，他將與亨利合作。並且在他的要求下，亨利通過醫院內唯一的線人-老李搞到了包含張強血液成分的紅叉藥樣品。並大批量生產，為了以後將夢境散佈到整個K市內。
而張強的真正目的是：通過足夠的入夢者，收集三個罪人的噩夢，在醫院樓頂，完成儀式召喚雲中君-塔維爾·亞特·烏姆爾，將所有人陷入夢境使得幻夢境和現實重疊，使所有人幸福———萬物歸一。
亨利的舉動引起了諾登斯的注意。由於優格·所託斯的限制，它無法直接干涉。它化身為病人，在仁愛醫院內等待新的調查員的到來。並隨時準備在調查員們失敗後重置時間。
時間線
不知何時，偉大的優格·索托斯將其的目光投射於K市的地域。在這塊土地上，夢境和現實的藩籬極易被打破。其化身和諾登斯展開了曠日持久的鬥爭。
1989年，斯科特·沃特雷收到信仰優格·索托斯的家族消息後，籌建了與本地合資的科瑞醫藥有限公司。並指派自己發展的下限亨利出任公司CEO，秘密命令他暗中搜尋相關信息。
1995年，科瑞醫藥有限公司和仁愛精神病院合作，使其成為了大型的綜合性醫院-仁愛醫院。仁愛醫院院長與科瑞醫藥有限公司CEO亨利開始合作。科瑞醫藥有限公司為仁愛醫院提供儀器，資金，本地關係等一系列支持，而仁愛醫院需要建立相關的採血檢驗實驗室，同時，亨利為了提高公司的收益，與院長私下非法進行未經批准的三期人體藥物實驗。
1997年3月11日，97特大礦難發生。張強作為唯一一個倖存者患上了對警報聲和震動的PTSD症狀。他在精神病院期間持續向周圍報社和有關部門寫信舉報部門主管和公司存在的違法行為，試圖為自己贖罪。最後卻被認為症狀加重，被迫轉入仁愛醫院。
2000年，張強被轉入四樓重症病房。
2002年，在老李的指導下，朱明非開始在仁愛病院的工作，並開始與張強接觸。
同年，由於一次血樣採集失誤，醫護人員的血樣和病人的血樣被混在了一起。朱明非的靜脈血樣被地下實驗室檢測出，由於血樣採集批次等相關因素，亨利開始鎖定四樓的重症病房，並開始對相關血樣的研究。四樓的重症病人被分批次送到地下的秘密實驗室，進行人體實驗。以朱明非靜脈血為重要成分的藍方藥—哌醋開始研發。
2004年3月，亨利初步完成對所有的四樓重症病人篩查，並將目標轉移到了負責四樓的醫護人員身上。朱明非通過夢境預知術察覺到了危險，臨時更改了原本和報社朋友一同曝光仁愛醫院的計劃。打算讓張強通過醫院地下室的建設漏洞，帶領地下室的病人逃離醫院。並讓他們作為人證，在聯繫到場的媒體面前公開收集到的貪汙，虐待證據，以此迫使仁愛醫院關閉。
同年4月，朱明非在夢中和張強接觸，為了讓張強相信自己，向其交代了部分事實，張強得以瞭解到相關的知識。朱明非向其傳授了入夢的技藝。在得知朱明非掌握著將他人拉入夢境的儀式後，張強提議通過控制院長等人入夢來殺死他們。此舉遭到了朱明非的反對，二人產生了矛盾。
同年12月，亨利已經鎖定朱明非，但由於無法找到控制朱明非的藉口，亨利轉向脅迫老李。迫於威脅，老李向其交代了他所知道的朱明非的舉報計劃。儘管他本以為這件事最壞的結果也只是朱明非丟掉工作，但後續事情的走向出乎他的意料。他的告密直接導致了朱明非的結局。
2005年1月11號，張強帶領所有長期被關在地下實驗室中的病人，通過朱明非的內應，試圖通過醫院地下室的建設漏洞逃出醫院。但由於老李的告密，朱明非被提前發現，其掌握的貪汙證據被亨利的手下-壯奪走。而病人們的逃跑行為被汙衊為群體性臆症。為了防止其他病人被迫害，張強選擇跳樓自殺以在媒體前鬧大聲勢。其朱明非為了防止自己被亨利找到，不得以使用法術強行肉身進入幻夢境，最後迷失在其中。其餘的病人因為媒體的曝光，被重新收治到三樓重症病房。在張強的影響下，所有人提前進入了重度睡眠。四樓重症病房的相關流言開始在二樓和三樓的病患間傳播。
同年，迫於社會壓力，科瑞集團停止了與仁愛醫院的合作並撤資。實際上，這次撤資是因為院長擔心自己被亨利等人滅口，藉此機會和亨利單方面切割並中斷合作。亨利被迫中斷了醫院內部的信息來源，儘管亨利試圖進入醫院找到朱明非的去向，但由於院長掌握了相關的實驗證據而不敢輕舉妄動。
2008年2月， 張強和院長達成合作。張強答應院長幫助他除掉亨利等人，只要他按照自己的指示行動。在被張強拉入夢境後，並向他展示了造夢的技藝後，院長相信了張強的說辭。在張強的指導下，院長通過仿製藍方藥——哌醋的製作工藝，使用造夢記憶和張強的動脈血製造出紅叉藥—舍曲帕羅西汀。一些三層的病人使用這些藥品後開始見到了奇異的紅光，並開始頻繁做夢，張強對夢境的掌控力逐漸增強。
2008年3月， 張強向亨利施加影響。在夢境中，張強假稱自己就是他們要找的人，並向亨利承諾，如果他能將他救出他就願意和他的教派合作。亨利於是決定和張強合作並開始佈局。在3月11號的 97特大礦難默哀時，亨利派手下向K市自來水廠裡投放了稀釋後的紅叉藥（從老李手上得到）。有著嗜睡多夢症狀的新型流感開始在K市傳播。
2008年4月，收到張強的影響，明天礦業退休的前主管李強在家中“自殺”，死相恐怖。其在遺書中坦白了明天礦業和自己的違法行為。後經過媒體報道引起了關注。
2008年4月11日，覆蓋全市的大型的夢境已經產生，得益於張強的夢境計劃，朱明非得以短暫影響現實，在意識到張強的計劃後，朱明非通過短信向外界求助。曹道士接到了朱明非的短信。並且此時在張強的計劃下，亨利也找到曹道士招募人員滲透醫院，遊戲正式開始。