在原作中寶玉獸的持有者約翰因為滯留異次元的世界，而導致自身被尤貝爾的黑暗影響，感染了卡組裡面的7只寶玉獸，所有的寶玉獸都變成了暗屬性的【A寶玉獸】形態。A寶玉獸在實卡化之後更名為了【高等寶玉獸】，屬性會因為效果變成暗屬性，並且擁有比原版更強的效果，可謂真的是黑化強三分，下面就一起來看一看吧。
【高等暗黑結界】在介紹高等寶玉獸之前，想說一下這張高等暗黑結界。遊戲王的系列卡牌設計在正常情況下都會遵循一個故事發展的邏輯，這張卡就是實卡里面寶玉獸會黑化成高等寶玉獸的這個事件的起點。當然看過動漫的人會知道，導致寶玉獸黑化的真正原因是尤貝爾，這張高等暗黑結界只不過是尤貝爾在實卡里面力量的具象化而已。
【高等寶玉獸 青玉飛馬】寶玉獸按照攻擊力排序的話，這張青玉飛馬算是7只寶玉獸裡面大哥。黑化之後的青玉飛馬相較於原版身上多了一些暗黑風格的裝飾物，身後作為背景的青玉寶石的光澤也明顯暗淡了一些，原版是非常純粹晶亮的感覺。1效果是要有高等暗黑結界才能存在場上，這也是所有高等寶玉獸共有的效果，畢竟按照原設定寶玉獸是因為黑暗感染才會變成這個形態。
【高等寶玉獸 琥珀猛獁】原版的琥珀猛獁是寶玉獸卡組裡面盾，擁有在場上的時候對方玩家的攻擊對象可以轉為琥珀猛獁的效果。但是黑化之後的琥珀猛獁效果有了質的轉變，原版只能阻擋攻擊的效果，現在變成了連以寶玉獸為對象的卡牌效果也能無效化，並且也不再是改變攻擊的對象而是直接將那次攻擊無效。這波才是真正的黑化強三分。
【高等寶玉獸 黃玉虎】原版黃玉虎的效果只是在攻擊階段對有效，現在的效果範圍則是覆蓋到了全體高等寶玉獸身上。雖然原始攻擊力黃玉虎只能在寶玉獸中排行老三，但是因為能夠提高自身攻擊力的效果，黃玉虎才算是7只寶玉獸裡面真正的打手擔當。黑化後的黃玉虎也因此給人一種更加兇惡的感覺。
【高等寶玉獸 鈷尖晶鷹】因為設定上卡組裡面的寶玉獸只有7只的原因，原版的藍鈷鷹的作用是在於回收寶玉獸，促進卡組的資源運轉。黑化後的藍鈷鷹則是進一步強化了這一功能，擁有能夠檢索高等寶玉獸的關鍵場地魔法卡高等暗黑結界的效果，並且這個效果即便是在魔陷區也可以發動。而原版只能將場上的寶玉獸送回卡組最上面的效果，也強化成了可以回到手牌。
【高等寶玉獸 紫晶貓】跟黃玉虎一樣，紫晶貓原本只對自身起效果的能力，現在適用於全體高等寶玉獸。不過7只寶玉獸的攻擊力都很低，寶玉獸卡組裡面唯一的上級便是虹龍，但是虹龍並不沒有高等寶玉獸的形態，所以導致紫晶貓的這一能力很雞肋。如果不是召喚虹龍需要湊齊7只寶玉獸，紫晶貓完全可以被踢出寶玉獸卡組。
【高等寶玉獸 翠玉龜】黑化後的翠玉龜跟原版慈祥和藹的卡圖比起來，真是有天翻地覆的變化。這龜龜一看就很兇，會咬人。而且原本是一隻非常老邁的龜，這隻龜龜則看起來年輕很多，相當的有活力。看來黑化真的是能逆轉年齡，原作裡面影丸理事長當初解放三幻魔獲取永生的辦法真的是睿智。
【高等寶玉獸 紅玉獸】紅玉獸算是7只寶玉獸裡面比較特殊的一個物種。因為其他動物都能夠一眼看出來原型，但是紅玉獸的外形像貓不是貓，像鼠不是鼠，更何況寶玉獸裡面早就有了紫晶貓。經過一番查閱，發現紅玉貓的原型來自於南美洲一種叫做卡邦克魯的生物。傳說其額頭上綴著一顆紅寶石，取得這顆寶石的人將獲得大量的財富和名聲。在近代甚至有探險家專門為了尋找卡邦克魯而前往南美密林。