1348年，此时法国正深陷战争的泥潭中，国王查理四世的逝世导致王位出现了短暂的空缺，由于查理四世生前并没有给自己留下男性继承人，于是查理四世的堂兄腓力六世和英国国王爱德华三世展开了对王位继承权的争夺。爱德华三世的母亲是查理四世的妹妹伊莎贝拉，从血缘关系上来说爱德华三世明显更适合，但是自己国家的掌权人怎么能允许外国人来插手，当时的法国上下不论是贵族还是平民，都坚决反对爱德华三世继承王位。
为了拿回“属于自己的王位”，爱德华三世在1337年向腓力六世这个“虚假的法国国王”发出战书，随后发动了历史上著名的英法“百年战争”。1346年英军在克雷西战役中大获全胜，成功占领法国海防要塞加来港，至此距离黑死病爆发还有两年的时间。
“苹果树，父亲！”阿米西亚从马背上跳下来，只见她身穿深蓝色印花马夹，头发高高的绾在脑后，“我想要再接受一次骑士考验！”曾在英法战争中立下赫赫战功的罗伯特骑士，退伍回到家乡后被册封为勋爵，面对家人他总是聚少离多，如今难得有机会和女儿一起出来打猎，他有些愧疚地说道：“阿米西亚，你知道的，一个家庭中每名成员都有自己的义务……”
“吼……汪汪……汪……”一旁的利昂打断了父女二人间的谈话，罗伯特捡起地上的树枝随手扔向了前方，“嘿，这次别空着手回来！”
“是的，就跟我刚才说过的一样，我们都有自己的义务，我要管理田地，而你的母亲需要在家里照顾你的弟弟。”
“可是我都没怎么见过你！见到母亲的次数更是屈指可数……”阿米西亚有些气馁。
“来吧，希望你带了投石索！”没等阿米西亚把话讲完，罗伯特就独自一人跑开了，阿米西亚跟在他身后来到了苹果树前。罗伯特严肃地告诉她，眼前的这颗苹果树已经被一个强大的邪灵腐蚀了，如果她能在十个数以内打掉六个腐烂的苹果，他就册封她为骑士。正当阿米西亚跃跃欲试时，旁边的利昂似乎嗅到了猎物的气味，阿米西亚跟在它身后一路小跑果然有大发现，只见一头野猪正趴在前面的草地里。
罗伯特和阿米西亚
“喂，利昂，跟着气味走，追到了也有你的一份！”眼见野猪准备逃跑，阿米西亚急忙命令利昂追上去，紧接着自己也跟上跑了过去，直到身后父亲的声音消失不见，阿米西亚这才发现周围有些不对劲，干瘪的树叶散落在地上随处可见，空气里弥漫着尸体腐烂的臭味，可怜的野猪早已变成了一堆骨头架子，这时利昂的呜咽声断断续续从前面传了过来。
眼前的一幕让阿米西亚惊呆了，只见利昂浑身是血，眼神呆滞地趴在地上，半个身子已经被拖进了土里，“是谁……利昂，究竟谁干的……”阿米西亚颤抖地伸出双手想要把利昂拉上来，突然从地底传来一阵诡异的振动，可怜的利昂被活生生地吞了下去。
利昂
一路无话，回到家里后罗伯特准备组织一次狩猎，他让阿米西亚去叫她的母亲，自己有话要跟她说，此时阿米西亚还未从失去利昂的悲伤中走出来，她神情恍惚朝着母亲的房间走去。
周围的仆人们正在窃窃私语。
“哎你听说了吗，英国军队打过来了……”
“啊？那咱们镇子咋办啊……”
“没啥大事，不过大家都很紧张……听说有人在夜里被咬了……”
“啊？？？英国人为什么要咬人？”
阿米西亚走到母亲的房门前，老仆人路易丝拦住了她，在得知是勋爵的命令后，路易丝有些不情愿地拉开了门。此时比阿特丽斯正坐在桌子前奋笔疾书，旁边摆满了大小不一的实验仪器，阿米西亚有些犹豫，但还是开口说道：“妈妈……”
“你知不知道你不该来这里？”比阿特丽斯头也没抬。
“我知道，但是……有东西在森林里袭击了利昂！”
比阿特丽斯有些烦躁，她不希望阿米西亚过来打扰自己的工作，更何况是这些无关紧要的小事，“亲爱的，我非常希望自己有时间能听完你的冒险故事，但是现在……”这时楼下传来一阵马蹄声，比阿特丽斯快步走到窗户前，悄悄打开一条缝瞟了一眼，随即转过身用不容置疑的语气命令阿米西亚去找自己的弟弟雨果，阿米西亚担心雨果身上的病会传染到自己，比阿特丽斯向她保证不会有问题的，说完便急匆匆地离开了。
比阿特丽斯
楼下的骚乱声越来越大，阿米西亚穿过房间在一处角落里找到了雨果，她轻轻掀开帘布，雨果望着眼前的这个陌生人有些不知所措。
“你姐姐……阿米西亚……”阿米西亚努力在脑海里寻找有关于雨果的记忆，“我们不常见面……妈妈很快就回来……”
“你好。”雨果乖巧地回答道。
雨果
此时父亲的声音从楼下传了上来，阿米西亚抬头望去，只见父亲双手反绑跪在地上，一个骑士模样的人正在逼问他雨果的下落，周围人都叫他尼古拉斯大人，罗伯特宁死也不肯交出雨果，失去耐心的尼古拉斯当场处决了他。看到父亲惨死在自己眼前，阿米西亚感到一阵眩晕，她拼命捂住嘴巴不让自己发出一点声音，紧接着拉起雨果的手跟在母亲后面逃到了花园里，早已在此等候多时的仆人急忙打开了后门。
“我的宝贝，快去躲起来，快去！”比阿特丽斯轻轻地抚摸着雨果的脸庞，仿佛在做最后的告别，她扭过头对站在一旁的阿米西亚说道：“阿米西亚，快带你弟弟去找劳伦提斯医生，他会照顾你们的！”
“那……那你怎么办……”
“阿米西亚，你已经长大了，答应我，照顾好雨果！”
“夫人……他们来了！”听着逐渐靠近的马蹄声，身旁的仆人焦急地催促着，比阿特丽斯最后看了一眼雨果，接着像是下定某种决心，用力关上了门。
比阿特丽斯
“妈妈……”还没等阿米西亚反应过来，，一柄锋利的长剑就从木门里刺了出来，“不，不，不！”阿米西亚不敢置信地看着这一切，鲜红的血液从门缝里渗了出来。
“给我搜！就算是躲到地底下也要给我挖出来！”尼古拉斯怒喝一声，开始命令手下追捕姐弟俩，“女的直接杀死，男的要留活口！”突然大地一阵颤动，周围的士兵们顿时鬼哭狼嚎，二人趁机逃到了前面的小村庄里。
四周一片寂静，只有头顶的乌鸦还在吱嘎吱嘎地叫个不停，阿米西亚牵着雨果的手慢慢走到了村子里，准备找人问问劳伦提斯医生的住址。奇怪的是，村民们见到他俩仿佛是见到了瘟神，纷纷关上门窗生怕连累到自己。
“喂，你干什么的？”一个满脸横肉的光头男提了提手上的铁锤，此时广场上聚集了大批村民，他们围在一起正准备举行某种仪式，阿米西亚顺着众人目光望去，只见一位老妇人被绑在十字架上，脚下的柴火正呲呲地往外溅出火星。还没等她开口，光头男扭过身子冲着身后的村民大喊：“就是他们！他们把老鼠引出来，入侵了我们的教堂！”阿米西亚见势不妙，赶忙拉着雨果钻进了旁边的小巷里，正当二人走投无路时，一位好心的老妇人打开门救下了他俩。
光头男
老妇人名叫克莱尔维，她曾是一位虔诚的天主教徒，随着瘟疫在村子里迅速爆发，光头男纠集了一批无业游民，将那些自己看不顺眼的人统统打上传播瘟疫的罪名，接着绑上十字架处以火刑，所幸克莱尔维的屋子附近正好是瘟疫最严重的地方，才侥幸躲过一劫。克莱尔维拿出新衣服给姐弟俩换上，还把家里的工具台借给阿米西亚使用，阿米西亚很感激她所做的一切，然而光头男显然不肯就此罢休，他继续派人四处搜寻阿米西亚。
克莱尔维
“你们就是在这跟丢的？”
“嗯，但是我觉得他们在这活不了多久……”门外断断续续传来村民的交谈声，克莱尔维做了个噤声的手势，阿米西亚心领神会地点了点头。“咚、咚、咚”，突然一阵刺耳的声音从里屋传了出来，阿米西亚顿时头皮发麻，只见雨果正拿着一把锤子疯狂地砸地板。
“你在干什么！”阿米西亚小声地呵斥道，“你是不是傻了！快把锤子放下！”
“我没傻！我要见妈妈！”雨果一边喊一边加大了手上的力度。
“闭嘴！你会害死我们的！”
“我！要！见！妈！妈！”
“妈妈已经死了……爸爸也是……你再也见不到她了！爸爸也见不到了！”
“你……你骗人！”雨果扔掉手中的锤子，一把推开阿米西亚跑了出去，“你骗人！你骗人！我恨你！”
“喂！雨果！等等，别出去！”来不及多想，阿米西亚一路狂奔来到教堂前，没想到阴魂不散的光头男也追了过来，他气急败坏地抡起铁锤就要劈死阿米西亚，可惜身上的盔甲限制了他的行动，阿米西亚结果了这个可悲的愚昧之人。
“阿米西亚……你杀死了他……”四周仿佛安静了下来，阿米西亚呆立在原地，心中的罪恶感如同一只野兽，无时无刻都在撕咬着她，眼里的浓雾让她看不清前进的道路。“阿米西亚，后面！”好在雨果的声音及时将她拉了回来，眼看周围的村民越来越多，姐弟俩合力推开教堂大门躲了进去。
阿米西亚
教堂里早已年久失修，蜘蛛网覆盖着每一寸的角落，雨果在教堂中庭里发现了一朵康乃馨，他小心翼翼地摘下给阿米西亚戴上，据说这样可以给她带来好运。这时阿米西亚看到了正在浇花的托马斯神父，仿佛抓到救命稻草的她恳请神父帮帮雨果，可是托马斯神父却摆了摆手，并奉劝他们不要再深入了，趁现在还能跑就赶紧跑。教堂外面挤满了丧心病狂的村民，阿米西亚深吸一口气，指了指雨果脖子上的家族徽章，请求他看在父亲的面子上帮帮他俩，心软的神父最终还是答应带他们找到劳伦提斯医生。
托马斯神父
姐弟俩跟着托马斯来到了教堂的地下通道，大厅里弥漫着一股潮湿的气息，昏暗的烛光中有一道身影若隐若现。“莫雷尔兄弟？”托马斯将火把递给阿米西亚，嘱咐她待在原地不要乱跑，自己则一瘸一拐的上前查看。
突然一阵阴风刮过，蜡烛全灭了，黑暗里传来诡异的低语声，散发着令人毛骨悚然的气息，阿米西亚心跳加快，紧紧地将雨果搂在身旁。这时无数只老鼠从四面八方涌来，它们爬上托马斯的身体，钻进他的衣服里，可怜的托马斯瞬间被老鼠啃食殆尽，只剩下一具白骨淹没在无穷无尽的老鼠大军中。阿米西亚强装镇定，她一边挥舞着手里的火把驱赶老鼠，一边死死地抓住雨果的手，姐弟俩利用地下室里的火盆和树枝,成功逃了出来。
托马斯神父
“唔……我的头……好痛，”雨果双手抱头，表情痛苦的站在原地。
“雨果，我们不能停在这……等到了劳伦提斯医生那里，你就可以好好休息了，”阿米西亚有些不知所措，她不知道该如何处理眼前这种情况，只能半跪在雨果面前轻声地询问道：“雨果……那妈妈会怎么办……”
“给我吃药……”
“可是我身上没有药啊……来，雨果我背着你……我只能做这么多了……”
“妈妈说我不能出门……”雨果趴在阿米西亚的背上小声地说道，“我想见妈妈……”
“至少你以前还能见到她……”
“嗯？”
“没什么。”阿米西亚急忙改口。
姐弟俩
二人穿过满是老鼠的田野后来到一处谷仓，在这里他们见到了劳伦提斯医生和他的助手卢卡斯。自大瘟疫之后，劳伦提斯医生的病情就在逐渐恶化，他躺在床上缓缓地告诉阿米西亚，雨果的血液中存在着一个古老的诅咒，之前自己和他们的母亲一直在延缓转变的过程，但是自从大瘟疫之后，这个进程明显加快了。说罢他将目光移向阿米西亚，一字一顿地说道：“只有你才能保护他，完成你母亲的遗愿……”劳伦提斯医生喘着粗气，让卢卡斯带他们前往阴影古堡，顺便将制作点火器的方法教给阿米西亚。
劳伦提斯医生
阿米西亚很无语，凭什么自己会平白无故多出来这么个大包袱，雨果颤颤巍巍地伸出小手想要拉住姐姐的袖口，却被她一把甩开，雨果生气的跟在卢卡斯身后，不肯让阿米西亚牵自己的手，就连下梯子的时候也不让她扶自己。此时谷仓内外早已被肆无忌惮的老鼠大军占领，阿米西亚打掉挂在房梁上的火腿，才勉强打开一条路，望着漫山遍野的老鼠她陷入了沉思。突然一声巨响打断了几人短暂的沉默，只见老鼠们纷纷从地底钻出来推倒了蒸馏罐，谷仓里瞬间升起巨大的火光，劳伦提斯医生不幸在大火中牺牲。
卢卡斯
无穷无尽的老鼠如同喷泉一般源源不断地从地底喷射上来，放眼望去满是黑压压的一片，在卢卡斯的指引下，三人很快来到小溪旁，跳上小船暂时躲开了老鼠大军。
清晨的薄雾笼罩在溪水上，雨果躺在阿米西亚的怀里睡着了，看着雨果略带憔悴的脸庞，阿米西亚轻轻地帮他整理好头发，接着抬起头看向正在划船的卢卡斯，忧心忡忡地问道：“他的血液里……到底有什么？”
“有一个……古老的传说……是关于大玛库拉的……”卢卡斯没有停下的手上的动作，“它曾只存在某些特定家族中的血液里，但是随着大瘟疫的爆发，它提前在雨果的体内苏醒了，玛库拉没有情感，也不在乎善恶，它会和宿主共同进化，直至统治一切，统治整个世界。”卢卡斯走到阿米西亚面前，“我的老师、还有你的母亲，都曾尽力阻止过玛库拉的苏醒……”
“但他们都失败了。”阿米西亚讲出了实情。
“是的，没错……不过我认为主要还是因为时间不够。好了，到岸了。”卢卡斯撑起船桨，小船稳稳地靠在了岸边。
“哇，青蛙！好多青蛙！”雨果兴奋地朝前跑去，从船上下来的他仿佛变了一个人，看到活蹦乱跳的雨果，二人心里稍稍松了口气。
“喂，别跑太远了！”阿米西亚冲着雨果的背影喊道。
“没事，小孩子嘛，跑一跑身体就暖和了。”卢卡斯似乎觉得阿米西亚管得太严了。
“嘿，看呐，我是一个骑士！”雨果正拿着不知道从哪里捡来的盾牌，显然这块盾牌对于他来说还是太大了，他将盾牌立在地上，右手拿起长剑对着二人比划了起来，阿米西亚认出了这是英国军队的盾牌，她让雨果赶紧丢到一旁。
“你真没劲。”雨果有些丧气。
雨果骑士
穿过一片低矮的灌木丛后，三人来到了一处开阔地带，这里曾是英法战争的战场，如今无数的死尸让这里变成了老鼠的乐园，阿米西亚利用投石索打碎了士兵的油灯，在老鼠们的“帮助”下解决了一个又一个英国士兵。不远处有两个小偷模样的人正被一名士兵盘问，话不投机半句多，很快双方就打了起来，其中一名小偷撂倒了士兵，拉起另外一人逃走了。阿米西亚认为这是个好机会，她催促雨果和卢卡斯赶紧跟上去，不料雨果在逃跑途中不慎摔倒，阿米西亚也被一棍子敲晕给带走了。
第二天上午，阿米西亚醒来后发现自己被关在一个笼子里，抓住他们的英国军队和宗教审判所达成了交易，由尼古拉斯出面花重金赎回姐弟俩，条件是必须在一个小时内完成交易，免得夜长梦多。正当阿米西亚绝望的时候，昨晚的小偷二人组再次出现，他们打开铁笼救出了阿米西亚，女小偷介绍自己名叫梅莉，那位是自己的哥哥亚瑟，梅莉轻车熟路地打开了旁边的箱子，显然她不是第一次做这种事了，阿米西亚跟在她身后找到了被关押起来的雨果。突然，营地的大门被打开了，尼古拉斯骑着马走了进来，他一边抱怨英国军队不给力，一边命令手下抓捕雨果，面对多名敌人的围攻，阿米西亚逐渐陷入苦战。这时躲在城墙上的亚瑟扔出炸药，把审判所的人炸了个人仰马翻，阿米西亚等人趁机钻进下水道里躲过了追捕。
梅莉
刚从营地里跑出来，几人都气喘吁吁地站在原地，梅莉提议先找一个地方躲起来，在这干站着也不是办法，自己和亚瑟的秘密基地正好可以当做落脚点，于是阿米西亚领着雨果来到了他们的秘密基地里。
“别碰那个，那个是我哥哥的开锁工具，很值钱的，”雨果吓得赶忙把手缩了回来，梅莉转过身继续摆弄她的头发。
“你们是如何生活的……”看着如此简陋的房屋，阿米西亚鬼使神差地问了一句。
“生活？你想知道我们是怎么生活的？”梅莉仿佛受到了什么刺激，她一字一句地说道：“我和哥哥从小就生活在贫民窟里，那里到处乞丐和流氓，我们的父亲也是个混蛋，亚瑟受不了他的打骂才带着我逃出来的……”说到这她顿了顿，“那你呢，你看看你穿的衣服，你再看看我穿的衣服，跟我一比，你就像是那些大家族里的公主！”
“你还不明白吗，我们现在什么什么都没有！”阿米西亚有些可怜地看着她。
“那谁付给我们钱呢？你，还是你？”
“钱？什么钱？”
“哦，之前有个叫卢卡斯的人告诉亚瑟，他说你们很有钱，救下你们可以拿到一大笔赎金，快点，钱呢？！”眼看吵了半天也吵不出个结果，或许她也看出来了阿米西亚确实没钱，梅莉双手一摊，“算了，等亚瑟回来再说……今晚你们先躺在他的草垫上睡吧。”
一夜无话，第二天早晨阿米西亚迷迷糊糊中感觉有人在推自己，她侧过身子发现梅莉正示意自己不要出声，屋外教堂审判所的士兵已经追了过来，梅莉熟练地搬开靠在墙上的木板，一条密道赫然出现在众人眼前。三人穿过密道后救下了正在被押往刑场的卢卡斯，雨果激动地和卢卡斯抱在一起，然而现在显然不是叙旧的时候，又是一番波折，几人终于抵达了阴影古堡。
阴影古堡
阿米西亚做了一个噩梦，梦里雨果被无数只老鼠围在一起，变成一只超巨大的鼠王朝自己扑了过来，阿米西亚浑身一哆嗦被吓醒了，只见雨果弯下腰正眼巴巴地看着自己，他今天准备带阿米西亚参观整个城堡，还没缓过神的阿米西亚悻悻地点了点头，看到姐姐同意了自己的“古堡计划”，雨果兴奋地跑到前面给她带路。
此时卢卡斯还在研究对抗玛库拉的药剂，昨晚一夜没合眼的他想到了一个好主意，他告诉阿米西亚在玛库拉病变的临界点上，作为玛库拉使者的雨果很有可能会死亡，而第一个临界点马上就要来了，劳伦提斯和比阿特丽斯在之前共同研制了一种极其复杂的药剂，可以帮助雨果在临界点前做好准备。阿米西亚忙问他能不能复刻出这个药，卢卡斯思索片刻后表示这个药的灵感来自于一本名为《血液之旅》的禁书，如今那本书被封存在大学院的地下室里，如果能拿到这本书，说不定会有一丝机会。
家族徽章
眼看亚瑟迟迟未归，梅莉通过小道消息得知自己的哥哥已经被宗教审判所带进了堡垒，当她听到阿米西亚要去大学院的时候表示自己知道那里，可以顺路一起走。很快二人就来到了要分手的地方，看着木枷上的尸体，梅莉祈祷亚瑟不要成为下一位，随后她帮阿米西亚打开了通往小镇的木门，二人就此道别。
甩开身后的士兵和鼠群，阿米西亚溜进了大学院里，毫无头绪的她想到了卢卡斯之前说过的玫瑰花，于是她便沿着挂有玫瑰花横幅的方向继续前进，这时一个古怪的声音从前面传了过来，阿米西亚悄悄爬上楼梯看看是什么情况。
“你和你的父亲一起建造了那扇门，现在你要打开它……”一个面色枯黄的老头指了指自己眼前的小伙子，接着转头看向身旁的守卫，“小雨果还是没消息吗？”
“回禀大人，尼古拉斯将军还在寻找。”
“这样的话，那就只有你能帮我们找到那本书了……我命令你打开那扇门！”
“当初父亲建造那扇门就是为了防止你这种人渣进去……”还没等小伙把话说完，两旁的士兵就直接把他打趴在地上，动弹不得。
老头的情绪有些激动，“我是大审判长维塔利斯·贝内文！你根本不知道我受了多少罪……为了拯救你们，我每天都要注射这该死的玩意！来人，元血！”一位神父模样的人拿着针管走了过来，元血仿佛让维塔利斯舒服了不少，他语气稍有放缓，对着小伙问道：“你叫什么名字？”
维塔利斯
小伙没搭理他，直至长剑顶住了他的咽喉处，“罗利克……”
“好的，罗利克……你不想打开我也不勉强你，”维塔利斯吩咐手下不要像对待他父亲那样对待他，事还没办成就先把人给砍了，随后两名守卫抬着维塔利斯缓缓走出了房间。
罗利克
阿米西亚立即意识到这是个大好的机会，自己和这位名叫罗利克的人有着共同的敌人，如果自己能救下他，说不定他会帮助自己找到《血液之旅》，为了不让《血液之旅》落到教会手中，阿米西亚必须要加快进度了。她小心翼翼地跟在罗利克后面，瞅准时机打掉了头顶的吊灯，吊灯砸在士兵身上燃起了熊熊大火，罗利克趁机掀翻了另一名士兵，二人穿过大门，阿米西亚惊讶地发现这地底下竟然还有一个图书馆，罗利克解释道这些都是禁书，自己的父亲正是为了保护这些秘密才修建的那扇大门。
拿到《血液之旅》后二人准备出去时，维塔利斯闯了进来，他一眼就认出了阿米西亚，还恬不知耻地说多年前教会就派人监视他们家，自己是看着她长大的。随着门外的大火越烧越旺，整个大学院也即将坍塌，好在罗利克十分熟悉这里，二人冲出火海回到了城堡里。
一眨眼时间来到了十二月，寒冷的冬季已经降临，玻璃上结了一层厚厚的水汽，城堡内外都弥漫着清冷的气息。自从《血液之旅》拿回来后卢卡斯便一直在研究，可惜始终没有什么起色，雨果的病情也在一天天的恶化，眼下的设备不足以支撑他继续研究，卢卡斯建议阿米西亚可以回家看一看，说不定那里能够帮助他完成研究。
阿米西亚的希望就如同这漫天的大雪，一点一点被埋进脚下的泥土里，直至不见踪影，幸亏还有罗利克陪在她身边，给她打气，鼓励她坚持下去。
冬季
“阿米西亚！”这天清晨，一声熟悉的声音从外面传了进来。
“梅莉！”阿米西亚紧紧握住梅莉的双手，“你做到了，你真的做到了！你救出了亚瑟！”
“还好他挺过来了，要不然真的会死在那里……”梅莉转头看向亚瑟，亚瑟接过话头继续往下说，“是这样的，阿米西亚，我们今天来这里有件事想要告诉你……”
“你说。”
“有一天，我正在牢房里躺着，突然监牢的大门被人踹开了，我被吓了一跳，起身一看原来是两名士兵押着一位女人走了进来，嘴里还在不停地嚷嚷着让她交出自己儿子的下落……”亚瑟清了清嗓子，“他们在审讯时我偷听到了那个女人的名字……”
阿米西亚握紧了拳头。
“比阿特丽斯。”
“果然，母亲还活着，他们不敢杀母亲，他们想要母亲手里的研究成果和雨果，”阿米西亚确定自己的判断没错，目光恳切地看着梅莉，“你都把亚瑟救出来了，那……”
“什么，你想都不要想！亚瑟我都是费了好大劲才把他捞出来的，”梅莉果断杀死了阿米西亚这个念头。
“我只是个小角色，但你的母亲不一样，她对于审判长很重要，”亚瑟在一旁补充道，“审判长问了她很多问题，还……还把她扔到牢房里继续审问……”
亚瑟
原本躺在席子上的雨果不知何时来到了众人身后，当听到母亲还活着的消息后，扑通一声摔在了地上，阿米西亚心疼的把他抱回席子上，转身对着卢卡斯大喊：“快，马上去我家！”卢卡斯收好《血液之旅》，跟着阿米西亚回到了德·卢恩庄园。
天空中下起鹅毛大雪，曾经生机勃勃的庄园如今满目疮痍，只剩下一排排黑色的沟壑和无穷无尽的老鼠，看到父亲的尸体依旧躺在冰冷的雪地中，阿米西亚想要送他最后一程。突然一阵剧烈的振动，无数的老鼠从房屋里钻了出来，它们汇聚在一起，慢慢地形成了龙卷风的样子朝着二人的方向移动过来。看着母亲亲手制作出来的解药，阿米西亚心里五味杂陈，如果当初母亲告诉自己这一切的真相，自己一定会理解她的，卢卡斯利用这份解药逆向推导出了解药的制作方法并加以改进。
此时大厅里早已挤满了密密麻麻的老鼠，卢卡斯一刻也不敢耽搁，他必须争分夺秒才能保证他们不会葬身鼠腹，随着越来越多的老鼠冲破地板爬进大厅里，火盆里的火焰快要顶不住了。千钧一发之际，卢卡斯成功将解药做了出来，顿时四周一片寂静，老鼠们全部停止了进攻，似乎它们也知道这意味着什么，纷纷退后给二人让出一条道路。
万鼠臣服
雨果的病情再次加重了，原本还在脖子上的深青色血管已经蔓延到了整张脸上，昔日可爱的小脸蛋竟有几分恐怖之色。
“雨果，你还没睡觉？”阿米西亚拿着解药来到他身旁，“你看，我们做到了，这是解药！来，快喝了它。”
“可能会有点苦……”卢卡斯提醒道。
“没事，直接一口气喝下去。”阿米西亚打开瓶塞对着雨果的嘴咕咚咕咚灌了进去。
“那……我现在是不是没事了？”没等阿米西亚开口，卢卡斯赶紧把话接过去，“不管怎么说，你很快就能康复了。”
“阿米西亚，我们还能见到妈妈么……”雨果仰起小脸盯着阿米西亚，阿米西亚被盯得有些不自在，赶忙打个圆场给糊弄过去，“啊……我之前跟你说过的，妈妈不会再回来了……不会了……”，随后赶紧让他躺下睡觉，说不定第二天早上病就好了。
雨果
第二天迎接阿米西亚不是雨果痊愈的好消息，而是雨果失踪的噩耗，她发了疯似的在城堡周围寻找，可惜怎么也找不到雨果，直到看见挂在树上的家族徽章被取走时她才明白，雨果真的走了，他去找妈妈了，阿米西亚双腿一软，昏了过去。
雨果根据脑海里的声音找到了大教堂，教会里的人将抓来的囚犯杀死后，把新鲜的的人血人肉喂给老鼠吃，这样喂出来的老鼠能够更好地和维塔利斯“通灵”。雨果跟在尼古拉斯的后面找到了比阿特丽斯，看到许久未见的母亲，雨果隔着牢房和她紧紧抱在一起。
临界点马上要来了，玛库拉一直在雨果的体内呼唤着，想要得到他的回答，这一次在母亲的陪伴下，雨果接受了自己的天赋，他小手一挥，老鼠们便顺着他手指的方向冲去。面对始终不肯服从自己的比阿特丽斯，维塔利斯放出了大量老鼠，一是为了杀死比阿特丽斯，二是为了试试雨果的天赋，雨果拼尽全力操纵鼠群救下了母亲，自己也因体力不支倒在了地上。此时，远在城堡里的阿米西亚醒了过来。
鼠王降临
1349年1月，伴随着天空中飘落的雪花，新的一年到了，阿米西亚似乎已经放弃了寻找雨果的念头。夜幕降临，她来到城堡的防御工事前，催促众人做好今晚的防御工作，诡异的事情出现了，原本坑道里只有稀稀拉拉的几只老鼠，如今却如潮水一般不断向上翻涌，很快便有越来越多的老鼠冲进了城堡里，眼看形势不妙，众人纷纷朝着密道里跑去。这时，阿米西亚看到了一张既熟悉又陌生的脸，只见尼古拉斯领着雨果一步一步走了上来，如今的他身穿教会的衣服，无数的老鼠围绕在他的周围，仿佛在保护着它们的皇帝。
雨果
“去吧，去完成你该做的事。”尼古拉斯松开了雨果的手，阿米西亚怔怔的站在原地，无法相信眼前这一幕，罗利克一把抓住她的手把她拽了过来。老鼠们的进攻让这座城堡岌岌可危，在一片废墟中，尼古拉斯找到了阿米西亚，他一拳打在她的下巴上，阿米西亚顿时一阵头晕目眩。
“开工吧。”尼古拉斯把她扔到雨果面前，“快点，杀死她，否则我就杀死你母亲。”
“雨果？雨果！你看看啊！我是你姐姐啊！”阿米西亚从地上费力地爬了起来。
“孩子，杀死她，她现在对你而言已经毫无用处了。”
“雨果！别听他的！”
眼看雨果迟迟不肯下手，尼古拉斯一把将他推开，自己拔出长剑准备刺死阿米西亚，这时躲在暗处的亚瑟趁机推倒了满是大石头的木架子，直接把尼古拉斯砸进了地里。阿米西亚远远地望着雨果，“亚瑟，你去确认下他是不是真死了……我得和雨果谈谈……”
“雨果？”
“雨果你看，他不会再伤害你了……”阿米西亚指了指身后的石头堆，雨果没有说话，他控制着老鼠慢慢朝阿米西亚逼近，“好的，好的！我不动了！你来这边吧……来吧……”
“你骗了我！妈妈还活着，你为什么要骗我！”
“不……我没有……我只是想保护你……”阿米西亚的辩解就如同她的脸色一样苍白。
“你！骗！我！”鼠群逐渐在阿米西亚的身旁汇聚成了一个小旋风，阿米西亚不顾周围的老鼠，直挺挺地跑过去抱住了雨果，感受着姐姐怀里的温软，雨果逐渐清醒了过来。
阿米西亚和雨果
刚才的石头并没有砸死尼古拉斯，反而彻底激怒了他，他一剑直接把亚瑟捅了个对穿，跟丢垃圾一样丢到了一旁，雨果利用鼠群的力量杀死了他。梅莉看到自己的哥哥惨死在眼前，她抑制不住心底的怒火，立马就要上去和他们拼命，阿米西亚赶忙拉住了她，众人决定组成一支小队，共同对抗宗教审判所。
尼古拉斯
街道上的守卫还在不停地抓人，他们将抓到的人送回审判所，以确保仪式的顺利进行。此时墙上的弓箭手让众人犯了难，眼尖的雨果发现了一辆货车，罗利克自告奋勇推起货车护送姐弟俩进入大教堂，无数的箭矢刺进了他的身体里，罗利克一声不吭依旧埋头推车，他停下货车使出浑身力气抬起铁门，直到所有人都爬进铁门后，他两手一松倒在了地上。
罗利克
教堂里，维塔利斯献祭了全部的教堂成员来喂养自己的老鼠大军，不同于雨果的老鼠，维塔利斯喂养的老鼠体型更大，毛发也更趋近于白色，他召唤出无数只老鼠把自己包裹在里面，白色鼠群在他的指挥下形成一根巨棒，狠狠地砸向阿米西亚，此时身后的雨果也开始操控老鼠发起反攻。一黑一白，两大鼠王在小小教堂里上演着生死对决，雨果利用黑鼠大军冲散了保护在维塔利斯周围的白鼠，阿米西亚抓住机会拿出投石索，终结了维塔利斯可笑的计划。
旋风鼠
没有了老鼠的困扰，小镇里恢复了往日的宁静，这一次雨果依旧和阿米西亚玩起了赛跑游戏，阿米西亚在后面笑着让他跑慢点。这时前方传来了卢卡斯催促的声音，他架起马车，载着母子三人朝着远处的港口驶去。
新的开始
END.