20世纪初：“小男爵夫人号”离奇失踪事件
二十世纪开始，寂静岭已经不再是美国西部小镇风味，煤矿关闭、托卢卡监狱关闭，此后，这里便朝着旅游区的方向发展了。
风光旖旎的托卢卡湖
镇上最吸引游客的，自然是风景优美的托卢卡湖，乘坐豪华邮轮欣赏湖上美景，是当地的保留项目，游客们基本不会有渠道了解，在平静的湖面下，有大量尸体埋藏在淤泥中，他们很可能都死不瞑目，眼中射出怨念的光，利爪般伸向湖面，试图将轮船上的人，拽入湖底。
【以下剧情出现在《寂静岭：街机》（Silent Hill:Arcade）闪回部分】
湖上失踪案频出，其中一起发生在1918年11月，事发当天，小男爵夫人号正执行着旅行任务，船上的游客中有一对母女，小女孩名叫汉娜，在她走过的短暂九年，命运始终没有善待她，父亲在她很小的时候去世，她跟母亲罗瑞安相依为命。肺结核这一当年无法治愈的疾病，将汉娜困在了布鲁克海文医院，她需常年在那里接受治疗，这也让她成了家中的负担，重到令她的母亲再也无法承受。她们俩会出现在小男爵夫人号上，完全源自于罗瑞安既无奈，又阴暗的谋划，她要在今天，将病重的女儿推下船。
小男爵夫人号
纯真的汉娜，还在困扰于母亲对她日益冷漠的事实，在甲板上，她遇到了善良的船长，便向他倾吐了自己的痛苦，就在船长鼓励她要相信母爱时，罗瑞安的声音从甲板的另一端传来，她呼唤着女儿：“汉娜……”
那一刻，汉娜觉得船长说的很对，妈妈是爱自己的，因为妈妈在见不到她时，会出来找她，对于长期感受不到妈妈关注的汉娜，一句呼唤，已足够让她如获至宝。汉娜感激地冲船长道别，冲向了罗瑞安的怀抱。
病重的汉娜
船长再次注意这对母女时，汉娜的身体已经倾向了甲板外，等他冲到汉娜落水的位置时，一切都晚了。
奇怪的是，惨剧发生后，小男爵夫人号也没有返航，它载着14名船员和游客，消失在了托卢卡湖上。
小男爵夫人号船长
各种调查无果的船难接连发生，重创了寂静岭的旅游业。
1930年代：达莉亚的邪神养成计划
1930年代，达莉亚·吉莱斯皮在镇上出生，注意这个姓氏，最先开采魔鬼坑的煤铁公司，也叫这个名字，所以两者可能有某种关联。
关于达莉亚的身世，没有确切的资料，但记载几乎都跟“使团”有关，她的对外身份，是“绿狮古董店”的老板娘，其实是使团狂热信徒，地位很高，她的古董店是一座使团秘密教堂的入口，此外，她还在店里给顾客搞一些灵媒活动，比如下咒和算命。
《寂静岭：起源》时期的达莉亚
32岁那年，达莉亚生下了女儿阿莱莎，没人知道孩子的父亲是谁，很可能这个父亲压根不存在，因为有个说法是，达莉亚带着狂热的使团信徒，通过魔法创造了阿莱莎。这种猜测可能不像它看起来那么离谱，至少它能解释，为什么阿莱莎与身俱来的特异能力。
《寂静岭：起源》时期的阿莱莎
阿莱莎的独特，没给她带来任何好处，反倒把她的童年搞得一团糟，在学校，她被同学们视作女巫，承受了不少校园霸凌，回到家，妈妈又不停地给她灌输使团的宗教信仰，稍有不如意，达莉亚就会对她施行体罚，被关在家里阁楼上的小黑屋，都是她的家常便饭。阿莱莎的老师曾经注意到了她的异常，还帮她报了警，可惜，参与调查的人里，有个迈克尔·考夫曼医生，本来就跟达莉亚、使团狼狈为奸，由他主导的调查，自然是查不出什么东西，最后，调查以“没有发现任何儿童虐待证据”为由，不了了之。
迈克尔·考夫曼医生
在这样的成长环境中，一方面，阿莱莎几乎全盘接受了母亲的熏陶，相信完美的使团天堂确实存在，幻想着有一天，世界会被火焰净化，带来永恒的幸福。
但另一方面，人性使然，她做出了反抗，比如逃学。有一次，她翘课溜进了亚陶剧院，正好有剧团在那儿排练莎士比亚的《暴风雨》，团里的导演对阿莱莎的遭遇，多少了解一点，很是同情，便邀她观看排练，剧中角色卡列班，外表半人半怪，吓到了阿莱莎，她的情绪剧烈波动，对自身超自然的能力也失去了控制，伤到了扮演普洛斯彼罗的演员。
亚陶剧院《暴风雨》舞台
同一时期，阿莱莎的母亲达莉亚，正在寂静岭悄悄绑架年轻女性，企图把她们的子宫作为载体，复活她心中的邪神，实验屡次失败，她愈发把希望寄托在与众不同的女儿身上。
【以下内容主要发生在《寂静岭：起源》中】
悲剧发生在阿莱莎7岁那年，为了能快速创造邪神，达莉亚没有特意寻找仪式地点，她迫不及待在自己家跳起了大绳，把阿莱莎置入使团图腾“太阳光环”中央，按照仪式流程，在各处点蜡，结果不小心把房子烧了。
召唤邪神的仪式引发了大火
火势蔓延至她家的整栋大楼，此时，卡车司机特拉维斯·格雷迪正巧路过，当天他正要去勃拉姆斯送货，却因为快要迟到，没走大路，而是抄了穿过寂静岭的近道。
在寂静岭的一条街道上，他看到了阿莱莎出窍的灵魂，震惊之余，他一路跟着女孩的魂魄，竟来到了一栋着火的楼房前，他冲进屋子，看见祭坛上的阿莱莎全身烧伤，顾不得太多，他上前把可怜的孩子救到了屋外的草地上。由于接连经历不正常的事，特拉维斯身心俱疲，听到远处传来的警笛声，绷着的神经终于放松，失去了意识，倒在了阿莱莎身边。
仪式被意外中断，加上阿莱莎并不想成为邪神的“代孕妈妈”，让部分灵魂出窍逃跑，正是她为阻止仪式做出的尝试，就这样，邪神的种子虽然种下，却暂时处于休眠状态。而从这时开始，阿莱莎和达莉亚的对立，也彻底激化。
特拉维斯精神分析，他可能是连环杀人狂吗？
再醒来时，特拉维斯发现自己并不在原来的地方，他正躺在街边的长椅上，那似乎是个街区，但雾气太大，他也搞不清状况。特拉维斯沿着街道探寻，在街边的立牌上，发现了一张地图，这才知道，自己莫名其妙到了寂静岭的商业区。
寂静岭中央区地图
其实从这一刻起，因为寂静岭神奇的力量，特拉维斯某些深埋的意识，会被不断具象化，他也将通过穿梭里世界、表世界，不断与自己逃避的过去重逢。
不过，特拉维斯尚未觉察到异样，他一心记挂着昨晚救出火场的女孩，地图显示，拐过几条街道，就是斗蓬草医院，特拉维斯推测，女孩大概率被送去了那里。
斗蓬草医院入口
医院如同被废弃了般荒凉，还透着一丝古怪，特拉维斯好不容易遇到一个医生，对方却说昨晚并没有伤者入院，这是当然，因为这医生正是先前包庇达莉亚的考夫曼，他绝无可能透露阿莱莎的踪迹。
实际上考夫曼医生并没说谎，阿莱莎的确没被送进医院，而是由骑士团信徒，搬进了达莉亚古董店，考夫曼则准备了一具尸体放入火场，冒充阿莱莎，这也是为什么，一场邪恶仪式，被报纸和不明真相的大众，传成了达莉亚家中锅炉爆炸，阿莱莎被烧死的意外事故。
特拉维斯也不太信任考夫曼医生，继续在医院寻找，在二楼，他遇到了身材性感，头上却缠满绷带，抽搐着逼近自己的“护士怪物”，在打败了怪物后，特拉维斯终于来到了“里世界”的入口：一面大镜子。
护士怪物
如果说，表世界的寂静岭还是谜团暗藏，里世界就是明晃晃的光怪陆离了，特拉维斯在那里遇到了更多怪物，而且每一种怪物，似乎都指向了他的童年阴影。
特拉维斯在这里遭遇的第一个怪物，就穿着拘束衣，很难不让他想起在雪松疗养院接受治疗的妈妈，特拉维斯的妈妈在他小时候突然精神失常，总是臆想来自镜像世界的人告诉她，“你的儿子是恶魔的孩子”，为此，海伦一直想杀死特拉维斯，最后真的用上了毒气，准备跟儿子同归于尽，幸亏警察及时赶到，把两人送进了医院。脱离生命危险后，特拉维斯的父亲理查德，便把海伦送进了疗养院，特拉维斯很可能是偷溜进疗养院时，看到了穿着拘束衣的妈妈。
雪松疗养院
母亲的形象，在特拉维斯反复穿梭中，越来越扭曲，也越来越清晰，在他终于面对一个母亲形象的怪物，并亲手杀死她之后，一块“弗劳洛斯碎片”出现在他面前，他拿着这东西，一脸懵。
特拉维斯关于母亲的童年记忆是非常扭曲的
弗劳洛斯碎片到底是什么？
《寂静岭》里有许多东西，都以现实为灵感或蓝本，而在现实的记载里，弗劳洛斯是可以困住魔鬼的装置，据说其中的一个记录跟西汉的张骞有关。弗劳洛斯也是一位强大的地狱大公的名字，他的麾下，有69个魔鬼受他管制。无论是哪种情况，弗劳洛斯都有管理约束妖魔鬼怪的能力，在《寂静岭》，它也有类似功能：
达莉亚为了更好的控制阿莱莎，便把女儿那充满潜力的灵力，“装进”弗劳洛斯里，并将它拆成几块，交给考夫曼医生，由他藏在寂静岭各个隐秘的地方。
现在，为了跟母亲对抗，阿莱莎需要找回所有碎片，但灵魂状态的她，显然无法自己实现这一点，特拉维斯作为闯入者，就成了她首选的棋子，只要等特拉维斯拿到碎片，她再出现拿走就好了。
在第一个碎片被拿走后，特拉维斯从阿莱莎身上，感受到了奇怪的力量，瞬间晕了过去，醒来后，一张不期而至的亚陶剧院戏票，似乎在暗示他下一步该去哪里。
特拉维斯如同被心理医生催眠的病人，乖乖跟着指示前进，在剧院里，他了解到了阿莱莎曾在那里闯下的祸，更进一步了解了那个小姑娘的魔力。在这里，他也遭遇了怪物，只不过，这次的怪物是阿莱莎（某种意义上的）心魔，而不是他的。但为什么别人的心魔，会出现在特拉维斯的里世界中，会否它们之间存在我们不知道的关联？
不过，每个人最大的心魔，永远源于自我，一把出现在演员尸体上的钥匙，指出了新的方向：河岸旅馆，于是，特拉维斯继续向着他的谜底靠近。
河岸旅馆
河岸旅馆怪物的强度、里外世界的频繁转换，都暗示了，这里可能藏着特拉维斯最崩溃的内心。在战胜了所有的大怪后，500号房间，终于出现在特拉维斯面前，他怀着极度的忐忑，推开门，看到了上吊的父亲，不过里世界的父亲还能说话，在告诉他“直面过去”后，这位父亲也变成了怪物。
有一说一，理查德好像老白
特拉维斯终于想起，孩童时，父亲每次带他来看望母亲，都会住在河岸旅馆，500号房间，是他们最后一次探视住的地方，这一次，父亲再也撑不住了，他先是骗儿子说，海伦已经死了，后来，又趁着儿子在门廊里玩耍，上吊自杀了。但特拉维斯只要回房，终归还是会看到这一幕，年幼的心灵根本无法处理这样的情景，特拉维斯锁上房门，站在那里对着父亲尸体说话，说了整整一晚上话，希望他能够醒来，直到第二天清洁工来打扫房间。
无法接受突如其来的变故，小特拉维斯跟父亲的尸体独处了一整晚
这次的重大创伤，很可能让特拉维斯人格分裂了，这也是为什么在进入寂静岭之前，他就产生了幻觉，后来我们知道，那些幻觉都跟他不好的过去有关；这同时也解释了他的失忆症，因为他不记得的事，都不是那个“热心救火市民特先生”的人格做的。以下我将根据坏结局，来做一个推测（仅代表个人观点）：
虽然爱着母亲，但母亲差点杀死自己这件事，应该影响了特拉维斯对女性的看法，那些看法是极度扭曲的，在跟异性正常接触时，他会害怕，所以，成年后他一直保持单身，可能更糟糕，他跟异性接触的方式，就是杀掉她们。特拉维斯在河岸旅馆找到的“裸体女性死亡照片”，很可能就是他的“作品”，极有可能是他分裂的那个人格做的，河岸旅馆是那个人格诞生的地方，而那个地方也成了他实施犯罪的“舒适区”。
如果是这样的话，特拉维斯果真如他母亲说的，变成了恶魔，但这又是他母亲觉得他会成为恶魔造成的。坏结局中，特拉维斯被困在了里世界，他“恶”的人格占据了上风，游戏中的“屠夫”，本来是他努力压抑的“恶”人格，却在此时与他成为一体。好结局，则可能是他战胜了心魔，消灭了“恶”人格，在车里，他将里程表归零，决定从头开始。
归零象征着特拉维斯的新生
不过，鉴于《寂静岭》一直追求模糊化的叙事风格，故意用模棱两可，去激发玩家个人化的解读，所以，特拉维斯的种种表现，还有可能是服用PTV造成的。PTV是用当地特有的植物“白色克劳迪亚”制成的毒品，经考夫曼医生的推广，在寂静岭游客中流行，很可能，不光是特拉维斯，所有一到寂静岭就不对劲儿的游客，他们的幻觉和失忆症状，都跟这玩意儿有关。同时它还是使团成员们的最爱，因为他们会把药物作用下的幻觉，视作跟上帝的神交。
《起源》的结尾就是第一代游戏的开始
阿莱莎最后也获得了重生，她的灵魂，把特拉维斯引向了古董店，她的尸体就在那里，达莉亚和考夫曼等人，连尸体也不放过，还在继续那个快要成功的邪神仪式，阿莱莎借助完整的弗劳洛斯，恢复了力量，捣毁了仪式，从她身体里诞生的，并不是邪神，而是由她一半灵魂化作的婴儿。这个婴儿，被她的另一半灵魂留在了路边，不久后，婴儿就被路过的哈利·梅森捡回家了。